147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0444 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
587 aa  1142    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.15 
 
 
611 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.54 
 
 
591 aa  105  2e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.15 
 
 
607 aa  103  7e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.94 
 
 
469 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  30.77 
 
 
452 aa  97.8  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  34.55 
 
 
445 aa  97.8  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.47 
 
 
487 aa  97.1  7e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  30.37 
 
 
632 aa  92.4  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.94 
 
 
462 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.7 
 
 
467 aa  89.4  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  31 
 
 
498 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  28.35 
 
 
487 aa  85.5  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.36 
 
 
473 aa  80.1  0.00000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.6 
 
 
473 aa  80.5  0.00000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30.3 
 
 
471 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  33.75 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.19 
 
 
606 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  33.75 
 
 
466 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  30.88 
 
 
490 aa  78.6  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.05 
 
 
478 aa  79  0.0000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  28.86 
 
 
438 aa  77.4  0.0000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  33.33 
 
 
466 aa  77.4  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.33 
 
 
463 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.75 
 
 
475 aa  77  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.73 
 
 
933 aa  76.3  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.04 
 
 
594 aa  75.9  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  28.88 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  27.85 
 
 
441 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.78 
 
 
472 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.35 
 
 
456 aa  72.4  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  31 
 
 
447 aa  72.8  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.91 
 
 
479 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.8 
 
 
474 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.8 
 
 
477 aa  70.9  0.00000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  30.28 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.13 
 
 
488 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  29.52 
 
 
465 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.1 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.1 
 
 
454 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.45 
 
 
468 aa  68.9  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.84 
 
 
524 aa  68.6  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.81 
 
 
457 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  28.38 
 
 
452 aa  66.6  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.15 
 
 
456 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.06 
 
 
475 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.3 
 
 
680 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  26.51 
 
 
646 aa  66.2  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.25 
 
 
451 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.3 
 
 
680 aa  66.2  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.7 
 
 
473 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.41 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.39 
 
 
456 aa  65.1  0.000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  30.68 
 
 
685 aa  64.7  0.000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.25 
 
 
451 aa  65.1  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.69 
 
 
454 aa  64.3  0.000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.19 
 
 
457 aa  63.9  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  30.77 
 
 
458 aa  63.2  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  29.37 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  29.37 
 
 
441 aa  62.4  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  28.45 
 
 
484 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  26.74 
 
 
454 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  26.23 
 
 
838 aa  62.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.82 
 
 
502 aa  61.2  0.00000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  23.8 
 
 
528 aa  60.5  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  29.6 
 
 
663 aa  60.1  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  28.4 
 
 
670 aa  60.1  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  26.01 
 
 
452 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  36 
 
 
668 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.42 
 
 
500 aa  58.9  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.84 
 
 
504 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.49 
 
 
470 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  28.91 
 
 
477 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.61 
 
 
479 aa  58.5  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.7 
 
 
458 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.41 
 
 
471 aa  57  0.0000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  28.27 
 
 
575 aa  56.6  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.12 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.38 
 
 
479 aa  56.2  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
457 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  27.89 
 
 
781 aa  55.5  0.000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.69 
 
 
452 aa  55.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  32.04 
 
 
665 aa  55.1  0.000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  26.17 
 
 
437 aa  54.7  0.000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.97 
 
 
438 aa  54.7  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.62 
 
 
434 aa  54.3  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  26.21 
 
 
438 aa  54.3  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  27.09 
 
 
541 aa  53.9  0.000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.43 
 
 
475 aa  53.5  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  25.93 
 
 
666 aa  53.5  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.08 
 
 
504 aa  53.5  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  34.1 
 
 
669 aa  52.4  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  25.52 
 
 
456 aa  52.4  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  27.31 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.31 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.09 
 
 
468 aa  52.8  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.43 
 
 
577 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  25.49 
 
 
442 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.94 
 
 
453 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  27.16 
 
 
448 aa  51.6  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>