202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0994 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
434 aa  841    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.42 
 
 
468 aa  132  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.09 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.19 
 
 
457 aa  117  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.86 
 
 
469 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.57 
 
 
457 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  25.78 
 
 
456 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.75 
 
 
462 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.73 
 
 
453 aa  113  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  28.63 
 
 
490 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.33 
 
 
457 aa  108  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  25 
 
 
456 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.28 
 
 
454 aa  107  4e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.55 
 
 
447 aa  107  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.06 
 
 
454 aa  106  1e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.6 
 
 
454 aa  103  6e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.89 
 
 
554 aa  103  7e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.45 
 
 
456 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.21 
 
 
456 aa  103  8e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  25.9 
 
 
445 aa  102  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  24.66 
 
 
441 aa  102  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  28.54 
 
 
498 aa  102  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.47 
 
 
452 aa  100  7e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.19 
 
 
475 aa  99  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.03 
 
 
678 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.88 
 
 
448 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.92 
 
 
657 aa  98.2  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.03 
 
 
678 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  24.18 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.97 
 
 
680 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.97 
 
 
680 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.19 
 
 
473 aa  97.8  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  24.11 
 
 
454 aa  97.1  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.47 
 
 
451 aa  96.3  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.65 
 
 
488 aa  94.7  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.78 
 
 
455 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  24.95 
 
 
471 aa  91.3  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  24.67 
 
 
452 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  25.11 
 
 
471 aa  90.9  4e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  23.16 
 
 
454 aa  90.5  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  27.02 
 
 
632 aa  90.1  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  27.16 
 
 
646 aa  89.7  8e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  26.46 
 
 
472 aa  89.4  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.59 
 
 
664 aa  89.7  1e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  25 
 
 
499 aa  87.8  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  27.3 
 
 
636 aa  86.7  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.33 
 
 
482 aa  86.7  7e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  22.92 
 
 
442 aa  85.9  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  23.96 
 
 
487 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  27.3 
 
 
642 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  24.74 
 
 
465 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  27.24 
 
 
484 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  29.19 
 
 
685 aa  82.4  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  24.2 
 
 
487 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  28.37 
 
 
781 aa  82.4  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  25.83 
 
 
458 aa  82  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.3 
 
 
475 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  21.47 
 
 
486 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  26.81 
 
 
579 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  23.84 
 
 
575 aa  80.5  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.75 
 
 
463 aa  80.1  0.00000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  19.74 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  23.64 
 
 
471 aa  78.2  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.74 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  26.3 
 
 
607 aa  77.4  0.0000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.48 
 
 
502 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.1 
 
 
468 aa  77  0.0000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  26.27 
 
 
502 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.27 
 
 
502 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  24.1 
 
 
468 aa  77  0.0000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  24.52 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  23.08 
 
 
438 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  24.52 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  25.53 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.11 
 
 
470 aa  77  0.0000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  24.52 
 
 
468 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.29 
 
 
477 aa  76.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.46 
 
 
500 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  25.53 
 
 
466 aa  76.3  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.46 
 
 
514 aa  76.3  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  24.34 
 
 
438 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  24.11 
 
 
441 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.09 
 
 
487 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  23.43 
 
 
477 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.48 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.9 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.55 
 
 
431 aa  74.3  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.81 
 
 
447 aa  74.3  0.000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  26.97 
 
 
467 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  25.27 
 
 
452 aa  73.2  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  26.74 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  26.74 
 
 
467 aa  72.8  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  25.58 
 
 
668 aa  72.4  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.61 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  24.36 
 
 
437 aa  72.4  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.17 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.17 
 
 
453 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  21.84 
 
 
468 aa  70.5  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  27.3 
 
 
591 aa  70.1  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.01 
 
 
473 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>