181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0778 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  66.27 
 
 
586 aa  783    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  100 
 
 
591 aa  1173    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  37.93 
 
 
607 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.2 
 
 
554 aa  323  5e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  33.23 
 
 
646 aa  301  3e-80  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  32.56 
 
 
636 aa  294  2e-78  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  32.26 
 
 
642 aa  286  1.0000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  31.35 
 
 
766 aa  143  9e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  30.08 
 
 
462 aa  140  4.999999999999999e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.9 
 
 
451 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.23 
 
 
462 aa  107  7e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.54 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  25.69 
 
 
458 aa  97.4  7e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  25.56 
 
 
445 aa  96.3  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.63 
 
 
466 aa  93.6  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.67 
 
 
477 aa  93.6  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.13 
 
 
482 aa  92.8  2e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.7 
 
 
466 aa  92.4  2e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.56 
 
 
466 aa  91.7  4e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  26.17 
 
 
498 aa  91.3  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.29 
 
 
472 aa  90.1  9e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  27.87 
 
 
669 aa  89.7  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  27.84 
 
 
665 aa  88.2  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.18 
 
 
468 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.18 
 
 
468 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.54 
 
 
490 aa  87.8  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.1 
 
 
467 aa  87  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.82 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.82 
 
 
678 aa  85.9  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.29 
 
 
474 aa  85.9  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.87 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  24.77 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.36 
 
 
453 aa  84  0.000000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3640  flagellar capping protein  28.13 
 
 
439 aa  83.6  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  25.89 
 
 
781 aa  83.2  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  24.46 
 
 
487 aa  83.2  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.92 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.44 
 
 
499 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.19 
 
 
500 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.61 
 
 
500 aa  81.6  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  28.61 
 
 
572 aa  81.3  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1517  flagellar capping protein  25.74 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.12 
 
 
479 aa  80.9  0.00000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  25.77 
 
 
441 aa  80.5  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.04 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.52 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1659  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.08 
 
 
550 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.51 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  27 
 
 
456 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1528  flagellar capping protein  25.37 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00317028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.12 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.12 
 
 
467 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1554  flagellar capping protein  28.76 
 
 
450 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1671  flagellar capping protein  28.76 
 
 
450 aa  77  0.0000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1816  flagellar capping protein  25.47 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.4 
 
 
447 aa  77  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.21 
 
 
680 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.12 
 
 
467 aa  76.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.21 
 
 
680 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.83 
 
 
456 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.65 
 
 
454 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.79 
 
 
455 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  27.23 
 
 
513 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  25.51 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.51 
 
 
502 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.97 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
470 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
502 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.49 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1738  flagellar capping protein  25.36 
 
 
459 aa  73.9  0.000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.3 
 
 
657 aa  73.9  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.58 
 
 
465 aa  73.2  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  23.58 
 
 
668 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1760  flagellar capping protein  24.42 
 
 
469 aa  72.4  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.27 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.74 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1706  flagellar capping protein  23.54 
 
 
460 aa  72  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.56 
 
 
454 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  24.94 
 
 
505 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.86 
 
 
456 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  24.7 
 
 
692 aa  70.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.12 
 
 
571 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  26.63 
 
 
438 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.12 
 
 
478 aa  69.7  0.0000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.79 
 
 
476 aa  69.7  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.3 
 
 
434 aa  70.1  0.0000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1706  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.22 
 
 
551 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399808 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.63 
 
 
458 aa  70.1  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.83 
 
 
468 aa  69.7  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.58 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.34 
 
 
677 aa  69.3  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  24.71 
 
 
472 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.5 
 
 
505 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.57 
 
 
479 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  24.94 
 
 
441 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.58 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.31 
 
 
475 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  27.93 
 
 
495 aa  68.6  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.32 
 
 
514 aa  68.2  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>