217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_0277 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  100 
 
 		 438 aa  859    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  97.95 
 
 		 438 aa  840    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  34.4 
 
 		 437 aa  250  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  33.41 
 
 		 445 aa  246  6.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.5 
 
 		 453 aa  205  1e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.1 
 
 		 447 aa  176  7e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.79 
 
 		 455 aa  170  6e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 458 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  30.65 
 
 		 438 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.49 
 
 		 453 aa  161  2e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  27.35 
 
 		 428 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  31.74 
 
 		 441 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.67 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.98 
 
 		 457 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  26.85 
 
 		 425 aa  152  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.86 
 
 		 451 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.19 
 
 		 448 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.71 
 
 		 454 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.01 
 
 		 454 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.71 
 
 		 456 aa  147  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.33 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 472 aa  143  5e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 456 aa  143  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.93 
 
 		 448 aa  142  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  27.1 
 
 		 456 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  26.97 
 
 		 448 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.29 
 
 		 456 aa  133  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  30.3 
 
 		 502 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.3 
 
 		 502 aa  133  6e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.84 
 
 		 502 aa  132  9e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.07 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.43 
 
 		 505 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 473 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.53 
 
 		 505 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 475 aa  126  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.11 
 
 		 470 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.55 
 
 		 449 aa  124  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.99 
 
 		 447 aa  124  4e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.9 
 
 		 502 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 454 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 475 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.84 
 
 		 465 aa  122  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.11 
 
 		 454 aa  121  3e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.25 
 
 		 500 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.7 
 
 		 472 aa  120  3.9999999999999996e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  31.6 
 
 		 471 aa  120  7e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.75 
 
 		 500 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.37 
 
 		 468 aa  117  3e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  30.52 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  28.7 
 
 		 466 aa  117  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  30.52 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  30.52 
 
 		 468 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  28.57 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  28.7 
 
 		 466 aa  117  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.67 
 
 		 452 aa  116  8.999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  27.05 
 
 		 478 aa  115  2.0000000000000002e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  29.67 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  27.18 
 
 		 677 aa  114  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.2 
 
 		 514 aa  113  6e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30.19 
 
 		 458 aa  113  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.31 
 
 		 468 aa  113  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.16 
 
 		 477 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.34 
 
 		 554 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  26.39 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.39 
 
 		 504 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.36 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.23 
 
 		 474 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  26.57 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.83 
 
 		 504 aa  107  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  26.57 
 
 		 507 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  26.57 
 
 		 507 aa  106  7e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  26.57 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.64 
 
 		 467 aa  104  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  26.5 
 
 		 486 aa  105  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25.22 
 
 		 477 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  26.57 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  26.57 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  26.36 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  26.57 
 
 		 507 aa  105  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  27.59 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.44 
 
 		 473 aa  103  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 487 aa  102  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.12 
 
 		 444 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.56 
 
 		 657 aa  100  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.02 
 
 		 462 aa  99.8  9e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  26.85 
 
 		 441 aa  99.8  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  26.05 
 
 		 487 aa  98.6  2e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.73 
 
 		 678 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.73 
 
 		 678 aa  97.4  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  27.92 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.47 
 
 		 499 aa  97.1  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  27.92 
 
 		 506 aa  97.1  6e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  28.46 
 
 		 781 aa  96.7  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3197  flagellar hook-associated protein 2  28.51 
 
 		 508 aa  96.7  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.24 
 
 		 451 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2874  flagellar hook-associated protein 2  27.71 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3953  flagellar hook-associated protein  27.71 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3101  flagellar hook-associated protein 2  27.71 
 
 		 506 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>