200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1147 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
554 aa  1074    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  36.12 
 
 
586 aa  340  2.9999999999999998e-92  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  35.2 
 
 
591 aa  336  7e-91  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  34.62 
 
 
607 aa  327  4.0000000000000003e-88  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  33.02 
 
 
646 aa  277  4e-73  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  32.92 
 
 
636 aa  274  3e-72  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  33.07 
 
 
642 aa  271  2.9999999999999997e-71  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  33.77 
 
 
462 aa  184  3e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  33.51 
 
 
445 aa  150  8e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  31.48 
 
 
458 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  31.43 
 
 
766 aa  145  1e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.33 
 
 
453 aa  125  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.87 
 
 
447 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.2 
 
 
657 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.02 
 
 
454 aa  118  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.32 
 
 
451 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.92 
 
 
441 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  28.94 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.02 
 
 
498 aa  111  4.0000000000000004e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  31.34 
 
 
438 aa  110  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.89 
 
 
473 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.67 
 
 
475 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.51 
 
 
458 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.25 
 
 
438 aa  107  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.78 
 
 
452 aa  107  7e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.82 
 
 
472 aa  107  7e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.4 
 
 
471 aa  107  8e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.97 
 
 
448 aa  105  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.41 
 
 
468 aa  104  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.12 
 
 
466 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  30.12 
 
 
466 aa  102  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.89 
 
 
434 aa  102  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  28.54 
 
 
487 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.34 
 
 
455 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  30.35 
 
 
466 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  30.56 
 
 
665 aa  101  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.32 
 
 
474 aa  101  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.61 
 
 
448 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.53 
 
 
478 aa  100  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  26.93 
 
 
448 aa  99.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
448 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.82 
 
 
482 aa  99  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  26.34 
 
 
568 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  31.25 
 
 
465 aa  97.8  4e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.88 
 
 
692 aa  97.1  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.61 
 
 
467 aa  97.1  8e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  29.46 
 
 
452 aa  96.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.92 
 
 
444 aa  95.9  2e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.36 
 
 
431 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.52 
 
 
449 aa  95.1  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  26.66 
 
 
541 aa  94.7  4e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  31.21 
 
 
781 aa  94.4  5e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.32 
 
 
472 aa  94  6e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.21 
 
 
471 aa  93.6  8e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.42 
 
 
677 aa  93.6  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.52 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  31.52 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  31.52 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  31.52 
 
 
468 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  29.02 
 
 
541 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  29.61 
 
 
472 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.62 
 
 
479 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.56 
 
 
473 aa  92.8  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  28.75 
 
 
572 aa  92.4  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.29 
 
 
456 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  31.25 
 
 
468 aa  90.9  5e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.75 
 
 
457 aa  90.9  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  28.25 
 
 
669 aa  90.1  9e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  35.71 
 
 
579 aa  89.7  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.82 
 
 
477 aa  90.1  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.08 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.93 
 
 
462 aa  89  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.43 
 
 
457 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.99 
 
 
469 aa  88.2  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.88 
 
 
456 aa  88.2  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.34 
 
 
475 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  27.47 
 
 
454 aa  87.8  4e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.08 
 
 
456 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  26.8 
 
 
467 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  26.8 
 
 
467 aa  87  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  26.8 
 
 
467 aa  86.3  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.81 
 
 
463 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.36 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.9 
 
 
468 aa  85.9  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.05 
 
 
469 aa  85.1  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  30.24 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.23 
 
 
487 aa  85.1  0.000000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.57 
 
 
468 aa  85.1  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
443 aa  85.5  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.88 
 
 
456 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.24 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.24 
 
 
680 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  29.72 
 
 
471 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  26.93 
 
 
454 aa  84  0.000000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.75 
 
 
457 aa  84.3  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.49 
 
 
852 aa  82.4  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.11 
 
 
465 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.25 
 
 
451 aa  82.8  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.24 
 
 
479 aa  82.4  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.07 
 
 
487 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>