138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0764 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  100 
 
 
766 aa  1526    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  39.42 
 
 
636 aa  310  5e-83  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  38.93 
 
 
642 aa  308  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  38.62 
 
 
646 aa  308  3e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  30.13 
 
 
607 aa  179  2e-43  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  27.95 
 
 
586 aa  160  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  31.35 
 
 
591 aa  143  9.999999999999999e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.43 
 
 
554 aa  140  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.55 
 
 
462 aa  80.9  0.00000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  31.43 
 
 
487 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  30.36 
 
 
677 aa  73.6  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.08 
 
 
467 aa  70.5  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.41 
 
 
476 aa  70.1  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.19 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1659  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.68 
 
 
550 aa  68.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.52 
 
 
456 aa  67.8  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  28.37 
 
 
462 aa  67.8  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1706  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.17 
 
 
551 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  30.17 
 
 
458 aa  66.6  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  27.75 
 
 
579 aa  65.9  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  26.29 
 
 
438 aa  65.5  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.15 
 
 
438 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.89 
 
 
469 aa  64.7  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.2 
 
 
452 aa  64.7  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  26.44 
 
 
502 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.44 
 
 
502 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.44 
 
 
502 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.3 
 
 
456 aa  64.7  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.43 
 
 
457 aa  64.7  0.000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0070  flagellar hook-associated protein 2 (filament cap protein)  27.78 
 
 
551 aa  64.3  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  29.19 
 
 
454 aa  63.5  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  25.95 
 
 
487 aa  62.8  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.89 
 
 
447 aa  62.4  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.77 
 
 
457 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.15 
 
 
657 aa  62  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.79 
 
 
456 aa  62  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.64 
 
 
473 aa  62  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  29.07 
 
 
669 aa  61.2  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.91 
 
 
471 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.01 
 
 
500 aa  60.8  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.54 
 
 
453 aa  60.5  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.55 
 
 
473 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.69 
 
 
472 aa  59.7  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  30.64 
 
 
441 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  30.64 
 
 
441 aa  60.1  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.36 
 
 
463 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  22.27 
 
 
498 aa  58.9  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.55 
 
 
477 aa  58.9  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.84 
 
 
475 aa  58.5  0.0000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.43 
 
 
500 aa  58.5  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  27.88 
 
 
492 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.41 
 
 
680 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.41 
 
 
680 aa  58.5  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  28.65 
 
 
466 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  27.93 
 
 
495 aa  57.8  0.0000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  28.65 
 
 
466 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.58 
 
 
468 aa  57.8  0.0000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
454 aa  57.4  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
454 aa  57.4  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.72 
 
 
482 aa  57.4  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.97 
 
 
465 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  21.89 
 
 
490 aa  56.6  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.63 
 
 
465 aa  56.2  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
500 aa  56.6  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.71 
 
 
504 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.25 
 
 
455 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.71 
 
 
504 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.16 
 
 
456 aa  55.8  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  28.09 
 
 
466 aa  55.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.56 
 
 
504 aa  55.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.22 
 
 
678 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.22 
 
 
678 aa  55.5  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.99 
 
 
471 aa  55.1  0.000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.95 
 
 
505 aa  54.7  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  23.2 
 
 
685 aa  54.7  0.000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  27.72 
 
 
632 aa  54.7  0.000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.11 
 
 
472 aa  54.7  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0530  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.91 
 
 
1025 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.86 
 
 
456 aa  54.3  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30.29 
 
 
445 aa  53.5  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.58 
 
 
451 aa  53.5  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 
479 aa  53.5  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.71 
 
 
477 aa  53.9  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  28.7 
 
 
458 aa  53.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.78 
 
 
483 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  32.6 
 
 
668 aa  53.1  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.54 
 
 
686 aa  53.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.75 
 
 
451 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.75 
 
 
451 aa  52.8  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  26.74 
 
 
452 aa  52  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.11 
 
 
470 aa  52  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  27.71 
 
 
559 aa  52  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25 
 
 
454 aa  51.6  0.00005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.49 
 
 
441 aa  52  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03169  flagellar capping protein  25.41 
 
 
670 aa  51.6  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  30.97 
 
 
477 aa  51.2  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  27.51 
 
 
551 aa  50.8  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.33 
 
 
448 aa  50.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.11 
 
 
478 aa  50.4  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.35 
 
 
473 aa  50.8  0.0001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>