49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0530 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0530  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
1025 aa  2080    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.83 
 
 
575 aa  245  3e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.49 
 
 
577 aa  241  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  31.08 
 
 
575 aa  223  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.16 
 
 
686 aa  154  8e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  27.74 
 
 
579 aa  152  4e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.25 
 
 
451 aa  67  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.03 
 
 
462 aa  63.5  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  29.47 
 
 
500 aa  57.8  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  24.68 
 
 
456 aa  57.4  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.08 
 
 
479 aa  55.8  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.97 
 
 
453 aa  55.5  0.000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  36.59 
 
 
452 aa  54.7  0.000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  31.91 
 
 
766 aa  54.7  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.61 
 
 
594 aa  53.9  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  24.35 
 
 
646 aa  54.7  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  27.48 
 
 
487 aa  52  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  31.52 
 
 
668 aa  52  0.00005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.72 
 
 
514 aa  52  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  25 
 
 
665 aa  52  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.31 
 
 
447 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  27.31 
 
 
498 aa  49.7  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  24.27 
 
 
454 aa  49.7  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  27.07 
 
 
632 aa  49.7  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.88 
 
 
678 aa  48.9  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.88 
 
 
678 aa  48.9  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  34.04 
 
 
471 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  25.22 
 
 
487 aa  48.5  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  29.35 
 
 
477 aa  48.1  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.09 
 
 
473 aa  47.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.37 
 
 
456 aa  47.8  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.64 
 
 
488 aa  47.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.48 
 
 
587 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  25.22 
 
 
486 aa  47  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  28.72 
 
 
646 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.39 
 
 
457 aa  46.6  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.37 
 
 
456 aa  47.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  28.72 
 
 
642 aa  47  0.002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  24.4 
 
 
441 aa  47  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.33 
 
 
482 aa  46.2  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  28.72 
 
 
636 aa  46.2  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  21.52 
 
 
457 aa  45.8  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.73 
 
 
490 aa  45.4  0.005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  23.89 
 
 
471 aa  45.4  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.29 
 
 
456 aa  45.1  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  20.53 
 
 
663 aa  45.1  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  41.38 
 
 
472 aa  44.7  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  21.9 
 
 
457 aa  44.7  0.009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  29.09 
 
 
838 aa  44.7  0.01  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>