122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0400 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
594 aa  1178    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  49.66 
 
 
591 aa  561  1e-158  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  41.48 
 
 
611 aa  423  1e-117  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  41.54 
 
 
607 aa  415  1e-114  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  34.59 
 
 
502 aa  201  3e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.54 
 
 
504 aa  109  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.92 
 
 
606 aa  108  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.04 
 
 
612 aa  105  3e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.75 
 
 
462 aa  104  4e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  26.71 
 
 
838 aa  99  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  26.96 
 
 
500 aa  98.6  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.07 
 
 
778 aa  96.7  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.47 
 
 
510 aa  87  9e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
473 aa  83.6  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.21 
 
 
587 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.85 
 
 
487 aa  80.1  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  24.87 
 
 
458 aa  79.3  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  27.27 
 
 
445 aa  75.1  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28 
 
 
474 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.18 
 
 
524 aa  74.3  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  26 
 
 
441 aa  72.8  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.9 
 
 
473 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.03 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.11 
 
 
519 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  27.58 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  26.5 
 
 
632 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.23 
 
 
531 aa  68.6  0.0000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  25.07 
 
 
487 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  29.45 
 
 
438 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.03 
 
 
452 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.16 
 
 
468 aa  65.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  32.31 
 
 
490 aa  65.5  0.000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.16 
 
 
468 aa  65.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  22.2 
 
 
893 aa  64.3  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.96 
 
 
468 aa  63.9  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.96 
 
 
468 aa  63.9  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  29.96 
 
 
468 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  29.96 
 
 
468 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  29.96 
 
 
468 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.96 
 
 
465 aa  63.9  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  27.41 
 
 
471 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  22.89 
 
 
486 aa  62.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  27.67 
 
 
441 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.04 
 
 
457 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.38 
 
 
478 aa  60.5  0.00000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  26.76 
 
 
467 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  26.76 
 
 
467 aa  60.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.83 
 
 
477 aa  59.7  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  24.93 
 
 
498 aa  58.9  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.08 
 
 
466 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.63 
 
 
680 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.08 
 
 
466 aa  59.3  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.63 
 
 
680 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  26.47 
 
 
467 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.6 
 
 
469 aa  57.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.47 
 
 
479 aa  58.2  0.0000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  26.79 
 
 
466 aa  57.4  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  25.93 
 
 
456 aa  57.4  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1554  flagellar capping protein  25.57 
 
 
450 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1671  flagellar capping protein  25.57 
 
 
450 aa  57.4  0.0000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  25.76 
 
 
487 aa  56.6  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.54 
 
 
451 aa  56.6  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.07 
 
 
454 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.07 
 
 
454 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.15 
 
 
479 aa  56.2  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.62 
 
 
504 aa  56.6  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.11 
 
 
479 aa  56.2  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  24.83 
 
 
471 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.19 
 
 
482 aa  55.5  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.22 
 
 
453 aa  55.1  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.32 
 
 
504 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.32 
 
 
504 aa  54.3  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 
456 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0530  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.61 
 
 
1025 aa  53.9  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  27.21 
 
 
484 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3568  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  21.35 
 
 
546 aa  53.9  0.000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.888241  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.56 
 
 
686 aa  53.9  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  24.59 
 
 
454 aa  53.5  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.57 
 
 
691 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 
500 aa  53.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  31.07 
 
 
442 aa  52  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002808  flagellar hook-associated protein FliD  24.17 
 
 
663 aa  51.6  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.69 
 
 
457 aa  51.2  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  24.59 
 
 
666 aa  51.2  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.93 
 
 
477 aa  51.2  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.77 
 
 
456 aa  51.2  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  23.65 
 
 
452 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  27.04 
 
 
646 aa  50.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.85 
 
 
455 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  29.41 
 
 
687 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  29.53 
 
 
575 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.41 
 
 
657 aa  50.1  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0807  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.95 
 
 
831 aa  50.4  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  26.56 
 
 
477 aa  49.7  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  22.78 
 
 
500 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.63 
 
 
499 aa  48.5  0.0003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  31.93 
 
 
528 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2353  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.35 
 
 
430 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.77 
 
 
434 aa  48.9  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.23 
 
 
454 aa  48.1  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>