151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2218 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  100 
 
 		 838 aa  1673    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  35.59 
 
 		 778 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  38.38 
 
 		 500 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  33.74 
 
 		 528 aa  206  1e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.75 
 
 		 504 aa  199  2.0000000000000003e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  38.38 
 
 		 519 aa  193  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.05 
 
 		 606 aa  191  5.999999999999999e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.56 
 
 		 524 aa  179  2e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  34.73 
 
 		 510 aa  172  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  37.9 
 
 		 893 aa  167  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.2 
 
 		 612 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.87 
 
 		 611 aa  145  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.76 
 
 		 607 aa  143  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.83 
 
 		 502 aa  132  2.0000000000000002e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.43 
 
 		 462 aa  117  7.999999999999999e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.14 
 
 		 691 aa  113  1.0000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.5 
 
 		 594 aa  92.4  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.48 
 
 		 591 aa  90.9  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.82 
 
 		 469 aa  85.5  0.000000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.8 
 
 		 473 aa  84.3  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.55 
 
 		 454 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.86 
 
 		 475 aa  82  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  29.41 
 
 		 677 aa  79  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  30.1 
 
 		 669 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.94 
 
 		 448 aa  77.8  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  30.55 
 
 		 487 aa  77  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.89 
 
 		 471 aa  77  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.43 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.08 
 
 		 465 aa  75.5  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  23.73 
 
 		 632 aa  75.1  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.37 
 
 		 531 aa  75.1  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.18 
 
 		 487 aa  72  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.18 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.48 
 
 		 482 aa  71.6  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.95 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.89 
 
 		 665 aa  70.9  0.00000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1353  flagellar capping protein  29.43 
 
 		 448 aa  70.9  0.00000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.95 
 
 		 466 aa  70.9  0.00000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.2 
 
 		 447 aa  70.1  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.01 
 
 		 457 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1557  flagellar capping protein  25.37 
 
 		 458 aa  70.1  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112262  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.18 
 
 		 441 aa  69.3  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.94 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.69 
 
 		 457 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.61 
 
 		 466 aa  69.3  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  27.39 
 
 		 495 aa  68.6  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.98 
 
 		 474 aa  68.6  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.76 
 
 		 456 aa  67.8  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  25 
 
 		 498 aa  67  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 478 aa  67  0.000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23 
 
 		 456 aa  66.2  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.55 
 
 		 575 aa  64.7  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  23.47 
 
 		 488 aa  63.9  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.1 
 
 		 473 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  25.98 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.5 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 587 aa  62.4  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.06 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  25.25 
 
 		 502 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.25 
 
 		 502 aa  62  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.25 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 472 aa  62.4  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.25 
 
 		 454 aa  62.4  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  24.44 
 
 		 490 aa  62  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.87 
 
 		 477 aa  60.8  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0807  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.37 
 
 		 831 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  26.44 
 
 		 468 aa  60.5  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.53 
 
 		 472 aa  60.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.75 
 
 		 476 aa  59.7  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.92 
 
 		 453 aa  60.1  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.14 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.38 
 
 		 479 aa  59.3  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.88 
 
 		 457 aa  58.9  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  30.94 
 
 		 477 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  22.87 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.91 
 
 		 487 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  23.72 
 
 		 456 aa  57.8  0.0000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.24 
 
 		 543 aa  57.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  24.59 
 
 		 458 aa  57.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  25.13 
 
 		 465 aa  57.8  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.13 
 
 		 468 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  23.25 
 
 		 487 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.72 
 
 		 454 aa  57.4  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.08 
 
 		 470 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1472  flagellar hook-associated protein FliD  29.1 
 
 		 652 aa  56.2  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1554  flagellar capping protein  27.84 
 
 		 450 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.266528  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1671  flagellar capping protein  27.84 
 
 		 450 aa  56.2  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  23.34 
 
 		 505 aa  56.2  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.72 
 
 		 454 aa  56.2  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  24.87 
 
 		 468 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  24.87 
 
 		 468 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  24.87 
 
 		 468 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.34 
 
 		 505 aa  55.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0148  flagellar hook-associated protein FliD  23 
 
 		 665 aa  54.7  0.000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  27.76 
 
 		 781 aa  54.3  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.5 
 
 		 473 aa  54.3  0.000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  27.47 
 
 		 478 aa  53.9  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  22.5 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  24.28 
 
 		 472 aa  53.5  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.7 
 
 		 499 aa  53.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>