187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1693 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  93.56 
 
 		 607 aa  1104    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 611 aa  1238    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  46.45 
 
 		 591 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  41.48 
 
 		 594 aa  450  1e-125  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.89 
 
 		 502 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  31.93 
 
 		 838 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  27.58 
 
 		 632 aa  155  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  31.78 
 
 		 500 aa  137  5e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.89 
 
 		 462 aa  130  9.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  31.17 
 
 		 528 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.1 
 
 		 612 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.28 
 
 		 504 aa  120  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.61 
 
 		 606 aa  117  6e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.42 
 
 		 778 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0444  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.32 
 
 		 587 aa  111  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0985336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  26.61 
 
 		 893 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.62 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.35 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.61 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.84 
 
 		 510 aa  99.8  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.61 
 
 		 454 aa  99.8  1e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.65 
 
 		 524 aa  99.4  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.99 
 
 		 456 aa  98.6  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.99 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.03 
 
 		 519 aa  95.9  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  27.54 
 
 		 454 aa  93.6  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.14 
 
 		 474 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.3 
 
 		 500 aa  89.7  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  28.12 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.25 
 
 		 487 aa  88.6  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.53 
 
 		 456 aa  88.6  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  29.61 
 
 		 441 aa  88.2  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.96 
 
 		 456 aa  88.2  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.25 
 
 		 478 aa  86.7  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.92 
 
 		 473 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0807  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.01 
 
 		 831 aa  85.1  0.000000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.96 
 
 		 457 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.19 
 
 		 451 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.17 
 
 		 445 aa  84.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.95 
 
 		 456 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.9 
 
 		 454 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.07 
 
 		 465 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.73 
 
 		 448 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.64 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.92 
 
 		 452 aa  79  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  25.96 
 
 		 469 aa  77  0.0000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.64 
 
 		 531 aa  77  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.15 
 
 		 455 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.83 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.01 
 
 		 490 aa  76.3  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  26.22 
 
 		 446 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.41 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25 
 
 		 447 aa  75.5  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.75 
 
 		 453 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.96 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.6 
 
 		 469 aa  73.9  0.000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.67 
 
 		 458 aa  73.9  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.55 
 
 		 449 aa  73.2  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.3 
 
 		 499 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.99 
 
 		 472 aa  73.2  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  24.42 
 
 		 477 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.91 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.29 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.29 
 
 		 504 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.51 
 
 		 475 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.13 
 
 		 473 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  25.27 
 
 		 498 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.56 
 
 		 472 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.09 
 
 		 473 aa  69.3  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.05 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.09 
 
 		 475 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.36 
 
 		 479 aa  67.8  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  25.5 
 
 		 442 aa  67.8  0.0000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.08 
 
 		 504 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.38 
 
 		 477 aa  67.4  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1472  flagellar hook-associated protein FliD  26.28 
 
 		 652 aa  67.4  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.7 
 
 		 474 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 		 477 aa  66.2  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  24.74 
 
 		 456 aa  65.9  0.000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.93 
 
 		 448 aa  65.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  24.79 
 
 		 460 aa  65.9  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  25.38 
 
 		 666 aa  64.3  0.000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1760  flagellar capping protein  22.66 
 
 		 469 aa  63.2  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.933006  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1528  flagellar capping protein  24.72 
 
 		 456 aa  63.2  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00317028  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  28.4 
 
 		 551 aa  63.2  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  23.78 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  23.78 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  23.78 
 
 		 468 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  24.46 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  23.31 
 
 		 468 aa  62.4  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  24.46 
 
 		 466 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2315  flagellar capping protein  24.33 
 
 		 646 aa  62  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3640  flagellar capping protein  25.5 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1738  flagellar capping protein  24.4 
 
 		 459 aa  61.6  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.37 
 
 		 933 aa  61.6  0.00000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  26.2 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.54 
 
 		 443 aa  61.6  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  23.39 
 
 		 465 aa  61.6  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.31 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  23.62 
 
 		 472 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>