191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0984 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
469 aa  912    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1627  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.09 
 
 
523 aa  202  9e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2353  flagellar hook-associated 2 domain protein  36.15 
 
 
430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.99 
 
 
449 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.85 
 
 
444 aa  186  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  32.32 
 
 
460 aa  173  5e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.13 
 
 
443 aa  170  4e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0835  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.03 
 
 
664 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.22 
 
 
462 aa  124  3e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  29.57 
 
 
458 aa  122  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.61 
 
 
447 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  29.01 
 
 
452 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  26.26 
 
 
469 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  28.51 
 
 
456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.57 
 
 
451 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.36 
 
 
451 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  27.51 
 
 
632 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  26.72 
 
 
442 aa  110  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.62 
 
 
452 aa  109  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.42 
 
 
451 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.96 
 
 
453 aa  107  5e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.34 
 
 
455 aa  107  5e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.71 
 
 
457 aa  106  9e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.66 
 
 
477 aa  105  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.29 
 
 
456 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.3 
 
 
448 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  25.6 
 
 
446 aa  100  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  24.85 
 
 
487 aa  99.4  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  25.46 
 
 
462 aa  99.8  1e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.69 
 
 
458 aa  98.2  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.65 
 
 
445 aa  97.4  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  27.38 
 
 
487 aa  96.7  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.38 
 
 
454 aa  96.7  9e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.64 
 
 
448 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.77 
 
 
475 aa  94.4  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.88 
 
 
457 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  26.64 
 
 
458 aa  93.6  7e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  24.43 
 
 
500 aa  92.4  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.46 
 
 
463 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.4 
 
 
482 aa  91.3  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.75 
 
 
471 aa  90.5  5e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.43 
 
 
473 aa  90.9  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.93 
 
 
487 aa  90.1  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.91 
 
 
456 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.95 
 
 
657 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  28.61 
 
 
677 aa  87.4  5e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  27.75 
 
 
438 aa  87.4  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.2 
 
 
476 aa  87  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.48 
 
 
490 aa  86.7  8e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.11 
 
 
456 aa  86.7  9e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.05 
 
 
554 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.61 
 
 
665 aa  84.7  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.38 
 
 
479 aa  85.1  0.000000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.95 
 
 
933 aa  84.3  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.45 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.39 
 
 
504 aa  84  0.000000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  27.27 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  27.27 
 
 
441 aa  84  0.000000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.51 
 
 
438 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.86 
 
 
478 aa  83.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.49 
 
 
466 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.11 
 
 
510 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28 
 
 
431 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
454 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3568  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.5 
 
 
546 aa  81.6  0.00000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.888241  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  24.13 
 
 
528 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.15 
 
 
519 aa  81.3  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0084  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.95 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0800  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.07 
 
 
500 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.29 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.29 
 
 
466 aa  80.5  0.00000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  26.67 
 
 
465 aa  80.1  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  24.84 
 
 
441 aa  79.7  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.15 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.15 
 
 
454 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.42 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  24.76 
 
 
575 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.58 
 
 
448 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.06 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25.81 
 
 
437 aa  78.2  0.0000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  26.06 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  26.06 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  26.06 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  21.57 
 
 
472 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  25.86 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.7 
 
 
577 aa  76.3  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.69 
 
 
479 aa  75.5  0.000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.72 
 
 
473 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.71 
 
 
531 aa  73.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.6 
 
 
611 aa  73.9  0.000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.95 
 
 
472 aa  73.9  0.000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.49 
 
 
457 aa  73.9  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.29 
 
 
680 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.29 
 
 
680 aa  73.6  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.41 
 
 
454 aa  73.2  0.000000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  24.85 
 
 
452 aa  72.8  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  29.07 
 
 
781 aa  73.2  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  25.31 
 
 
668 aa  70.9  0.00000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
487 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  26.23 
 
 
477 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>