214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3357 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 		 438 aa  859    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  97.95 
 
 		 438 aa  840    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  34.17 
 
 		 437 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.72 
 
 		 431 aa  242  9e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  32.88 
 
 		 445 aa  238  2e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4660  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.16 
 
 		 453 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289972 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3586  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.18 
 
 		 447 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.08 
 
 		 455 aa  160  6e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.63 
 
 		 458 aa  157  4e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0655  flagellar hook-associated protein 2  27.13 
 
 		 428 aa  157  4e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  29.98 
 
 		 438 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.43 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  31.15 
 
 		 441 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0207  flagellar hook-associated protein 2  26.96 
 
 		 425 aa  151  3e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.547733 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 457 aa  145  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  28.24 
 
 		 454 aa  145  1e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.03 
 
 		 457 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.52 
 
 		 448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.23 
 
 		 456 aa  140  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.65 
 
 		 451 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.85 
 
 		 456 aa  139  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.86 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.85 
 
 		 456 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.61 
 
 		 472 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 		 454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.27 
 
 		 448 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  27.11 
 
 		 448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  29.84 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.84 
 
 		 502 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.38 
 
 		 502 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.21 
 
 		 473 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.21 
 
 		 457 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.88 
 
 		 456 aa  130  6e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.03 
 
 		 475 aa  126  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.54 
 
 		 475 aa  125  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.4 
 
 		 447 aa  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.15 
 
 		 449 aa  122  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.08 
 
 		 505 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.31 
 
 		 472 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.08 
 
 		 505 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.49 
 
 		 454 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.4 
 
 		 454 aa  120  7e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  30.61 
 
 		 465 aa  119  7.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.75 
 
 		 500 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.17 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.44 
 
 		 470 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  29.44 
 
 		 466 aa  116  6e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 500 aa  117  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  29.44 
 
 		 466 aa  116  6.9999999999999995e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  27.37 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.37 
 
 		 504 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  30.28 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  30.28 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.21 
 
 		 466 aa  115  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.87 
 
 		 452 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  30.28 
 
 		 468 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.98 
 
 		 502 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.460836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.14 
 
 		 468 aa  114  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  26.61 
 
 		 478 aa  113  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  31.13 
 
 		 471 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25.33 
 
 		 477 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  29.44 
 
 		 468 aa  111  3e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.05 
 
 		 504 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.94 
 
 		 477 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  29.95 
 
 		 458 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.25 
 
 		 554 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2560  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.16 
 
 		 514 aa  108  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  26.92 
 
 		 486 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.67 
 
 		 677 aa  107  4e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.86 
 
 		 468 aa  106  6e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  26.3 
 
 		 474 aa  107  6e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.18 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 		 513 aa  103  5e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  27.15 
 
 		 441 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  27.1 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.56 
 
 		 467 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 487 aa  101  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.87 
 
 		 473 aa  101  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 		 507 aa  101  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  27.59 
 
 		 472 aa  100  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  26.89 
 
 		 507 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.67 
 
 		 474 aa  100  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.65 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.82 
 
 		 444 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.02 
 
 		 499 aa  95.1  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  24.77 
 
 		 458 aa  94.7  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  25.58 
 
 		 487 aa  93.6  6e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.66 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.38 
 
 		 665 aa  91.7  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  27.73 
 
 		 669 aa  92  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.93 
 
 		 678 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.93 
 
 		 678 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  27.69 
 
 		 446 aa  90.9  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  26.39 
 
 		 452 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  31.38 
 
 		 685 aa  90.5  6e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.47 
 
 		 451 aa  90.5  6e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>