149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2418 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
612 aa  1241    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  40.05 
 
 
504 aa  242  2e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  38.44 
 
 
500 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  38.78 
 
 
510 aa  211  3e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  37.76 
 
 
528 aa  211  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  36.45 
 
 
606 aa  204  4e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  37.72 
 
 
519 aa  184  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.16 
 
 
524 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  30.25 
 
 
838 aa  153  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  33.68 
 
 
893 aa  146  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.05 
 
 
778 aa  145  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.25 
 
 
691 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.12 
 
 
607 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.64 
 
 
591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.14 
 
 
611 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
594 aa  107  9e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.82 
 
 
471 aa  96.7  1e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  26.81 
 
 
458 aa  89.4  2e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  26.84 
 
 
456 aa  87  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.04 
 
 
451 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.13 
 
 
462 aa  85.9  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.28 
 
 
455 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  24.77 
 
 
632 aa  81.3  0.00000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.62 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.57 
 
 
453 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  25.79 
 
 
471 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.03 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.49 
 
 
448 aa  77.4  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  26.41 
 
 
487 aa  77  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.56 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.89 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  27.1 
 
 
454 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.6 
 
 
456 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  25.14 
 
 
468 aa  75.1  0.000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.78 
 
 
473 aa  75.1  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.84 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.48 
 
 
456 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.72 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  25.72 
 
 
465 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.19 
 
 
457 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  25.72 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  25.72 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  25.72 
 
 
468 aa  72.8  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.37 
 
 
458 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.73 
 
 
451 aa  70.5  0.00000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  26.42 
 
 
442 aa  70.1  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  25.52 
 
 
458 aa  70.5  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  26.27 
 
 
466 aa  70.1  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.37 
 
 
451 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.45 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  26.27 
 
 
466 aa  69.3  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  26.27 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  23.87 
 
 
445 aa  68.6  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.15 
 
 
475 aa  68.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.44 
 
 
468 aa  68.2  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.65 
 
 
502 aa  68.2  0.0000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.94 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.94 
 
 
467 aa  67.4  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.91 
 
 
502 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.94 
 
 
467 aa  66.6  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  24.48 
 
 
477 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.44 
 
 
482 aa  66.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  24.91 
 
 
502 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.91 
 
 
502 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.08 
 
 
468 aa  66.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.1 
 
 
465 aa  65.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.51 
 
 
477 aa  65.5  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  26.09 
 
 
500 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  24.54 
 
 
474 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.62 
 
 
448 aa  65.1  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.52 
 
 
472 aa  65.1  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25 
 
 
454 aa  64.7  0.000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.1 
 
 
487 aa  63.2  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
475 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.55 
 
 
470 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  23.93 
 
 
488 aa  62  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.94 
 
 
448 aa  62.4  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  23.75 
 
 
441 aa  61.2  0.00000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  25.08 
 
 
469 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1492  flagellar hook-associated protein 2  24.77 
 
 
478 aa  58.9  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2229  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.49 
 
 
531 aa  59.3  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000532748 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.48 
 
 
686 aa  59.3  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  22.5 
 
 
452 aa  58.5  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  33.02 
 
 
575 aa  58.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.21 
 
 
479 aa  57  0.0000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.07 
 
 
499 aa  57  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  21.98 
 
 
490 aa  57  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.31 
 
 
475 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2429  flagellin domain-containing protein  40.7 
 
 
713 aa  55.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.31 
 
 
473 aa  56.2  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.99 
 
 
472 aa  56.2  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  23.29 
 
 
474 aa  55.5  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.16 
 
 
456 aa  55.5  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  26.04 
 
 
572 aa  55.1  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1627  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.01 
 
 
523 aa  55.1  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.354456 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1724  flagellar capping protein  23.57 
 
 
666 aa  53.9  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0724566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  25.62 
 
 
452 aa  53.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.88 
 
 
677 aa  53.5  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  28.35 
 
 
781 aa  53.1  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.28 
 
 
452 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>