190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_3160 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  80.64 
 
 		 571 aa  805    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  100 
 
 		 572 aa  1078    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  62.66 
 
 		 568 aa  620  1e-176  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  59.81 
 
 		 559 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  33.09 
 
 		 551 aa  211  4e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.01 
 
 		 468 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  31 
 
 		 462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  29.31 
 
 		 487 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 		 487 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.36 
 
 		 505 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  31.36 
 
 		 505 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  30.26 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  29.05 
 
 		 668 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  30.26 
 
 		 466 aa  106  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  31.47 
 
 		 632 aa  103  9e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  28.53 
 
 		 484 aa  101  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.54 
 
 		 475 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.74 
 
 		 466 aa  101  3e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  31.79 
 
 		 469 aa  100  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  27.59 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.56 
 
 		 472 aa  98.6  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.98 
 
 		 456 aa  98.6  3e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.78 
 
 		 457 aa  97.8  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  26.8 
 
 		 665 aa  97.4  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.33 
 
 		 458 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  28.08 
 
 		 454 aa  95.9  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  24.39 
 
 		 448 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.94 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.51 
 
 		 456 aa  95.1  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.98 
 
 		 457 aa  94.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  31.15 
 
 		 487 aa  93.2  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.82 
 
 		 454 aa  92  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.29 
 
 		 463 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  31.86 
 
 		 483 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  28.68 
 
 		 490 aa  92  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.75 
 
 		 554 aa  91.7  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.1 
 
 		 471 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 		 454 aa  91.3  5e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.31 
 
 		 448 aa  90.9  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  29.27 
 
 		 441 aa  90.1  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.86 
 
 		 431 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.33 
 
 		 470 aa  90.1  9e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  30.77 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 454 aa  89.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.39 
 
 		 465 aa  89.7  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  28.04 
 
 		 458 aa  89.4  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  31 
 
 		 680 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.91 
 
 		 451 aa  89.4  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30 
 
 		 502 aa  89  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  31 
 
 		 680 aa  89  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.77 
 
 		 479 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.67 
 
 		 456 aa  88.6  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.97 
 
 		 543 aa  88.6  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  28.76 
 
 		 472 aa  87.8  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.09 
 
 		 447 aa  87.4  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  29.75 
 
 		 502 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.75 
 
 		 502 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.6 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  26.6 
 
 		 474 aa  86.7  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.6 
 
 		 678 aa  86.7  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  25.79 
 
 		 458 aa  85.9  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.45 
 
 		 456 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  28.79 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  26.9 
 
 		 692 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.69 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.59 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.59 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.69 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  27.97 
 
 		 474 aa  84  0.000000000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.95 
 
 		 475 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.59 
 
 		 467 aa  83.2  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.71 
 
 		 457 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  29.09 
 
 		 452 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.95 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.32 
 
 		 448 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.09 
 
 		 473 aa  81.3  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.57 
 
 		 657 aa  80.9  0.00000000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  28.02 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  28.61 
 
 		 591 aa  80.5  0.00000000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  26.62 
 
 		 669 aa  80.1  0.00000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.64 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.87 
 
 		 448 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.81 
 
 		 473 aa  80.1  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  27.42 
 
 		 438 aa  79  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.12 
 
 		 479 aa  79  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.47 
 
 		 477 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.28 
 
 		 452 aa  79.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  26.7 
 
 		 477 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.02 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.75 
 
 		 500 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  28.02 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  28.02 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  28.02 
 
 		 468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.93 
 
 		 453 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  28.82 
 
 		 498 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.98 
 
 		 504 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.42 
 
 		 438 aa  77.4  0.0000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.16 
 
 		 451 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.21 
 
 		 488 aa  77  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  31.45 
 
 		 452 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>