189 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0867 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  100 
 
 
568 aa  1076    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  62.66 
 
 
572 aa  632  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  63.53 
 
 
559 aa  612  9.999999999999999e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  61.28 
 
 
571 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  30.98 
 
 
551 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  31.37 
 
 
487 aa  107  9e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.69 
 
 
554 aa  103  8e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.33 
 
 
448 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.89 
 
 
457 aa  100  6e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.81 
 
 
451 aa  100  7e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  29.84 
 
 
469 aa  98.2  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.14 
 
 
468 aa  97.8  5e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  30.09 
 
 
474 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.81 
 
 
462 aa  94.4  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.98 
 
 
454 aa  94.4  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.98 
 
 
454 aa  94.4  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  28.37 
 
 
668 aa  93.6  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  27.53 
 
 
456 aa  93.2  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.89 
 
 
471 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.3 
 
 
502 aa  92  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.44 
 
 
456 aa  91.3  4e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  29.56 
 
 
502 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.56 
 
 
502 aa  90.9  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.38 
 
 
454 aa  90.5  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  30.25 
 
 
498 aa  88.2  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  27.63 
 
 
466 aa  88.2  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  27.89 
 
 
466 aa  87.8  5e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.69 
 
 
447 aa  87.4  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.82 
 
 
475 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  27.89 
 
 
466 aa  86.3  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.84 
 
 
445 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  28.53 
 
 
458 aa  85.5  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.95 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  27.53 
 
 
490 aa  85.1  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  30.15 
 
 
505 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.75 
 
 
487 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  29.57 
 
 
472 aa  83.6  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
457 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.65 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.65 
 
 
468 aa  82.8  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.39 
 
 
472 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.71 
 
 
475 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  27.37 
 
 
607 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.99 
 
 
505 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  24.07 
 
 
579 aa  80.5  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.3 
 
 
453 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  26.95 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.2 
 
 
473 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.61 
 
 
482 aa  79.3  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.37 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.5 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.11 
 
 
454 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.16 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.23 
 
 
465 aa  79  0.0000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.61 
 
 
441 aa  78.2  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.69 
 
 
488 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.17 
 
 
657 aa  77  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  24.27 
 
 
437 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.47 
 
 
457 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  25.53 
 
 
632 aa  75.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.93 
 
 
458 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.54 
 
 
448 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  26.02 
 
 
665 aa  74.7  0.000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2523  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.79 
 
 
472 aa  74.7  0.000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.67 
 
 
680 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.47 
 
 
678 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.65 
 
 
467 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  26.84 
 
 
781 aa  73.6  0.00000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.65 
 
 
467 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.47 
 
 
678 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.04 
 
 
452 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.67 
 
 
680 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.65 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  27.03 
 
 
474 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.29 
 
 
473 aa  72  0.00000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  27.09 
 
 
471 aa  72  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.22 
 
 
479 aa  71.2  0.00000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  26.43 
 
 
591 aa  71.6  0.00000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  26.92 
 
 
445 aa  71.2  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25.93 
 
 
454 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  23.27 
 
 
448 aa  70.5  0.00000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  26.29 
 
 
458 aa  70.1  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  24.29 
 
 
642 aa  70.1  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.01 
 
 
431 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.81 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  24.51 
 
 
636 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.2 
 
 
451 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.07 
 
 
471 aa  67.4  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0994  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.18 
 
 
434 aa  67.4  0.0000000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.864471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1112  flagellar biosynthesis filament capping protein, enables filament assembly  28.85 
 
 
442 aa  67  0.0000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.27 
 
 
451 aa  66.6  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  25.48 
 
 
462 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.08 
 
 
444 aa  65.1  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  31.41 
 
 
669 aa  64.7  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  25 
 
 
477 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  31.58 
 
 
646 aa  64.7  0.000000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  26.77 
 
 
465 aa  64.7  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  27.08 
 
 
468 aa  64.7  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  27.25 
 
 
486 aa  64.3  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.16 
 
 
479 aa  64.3  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>