171 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0708 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
571 aa  1081    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  80.49 
 
 
572 aa  825    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  61.16 
 
 
568 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  61.89 
 
 
559 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  32.1 
 
 
551 aa  208  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  30.86 
 
 
668 aa  130  9.000000000000001e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  31.4 
 
 
487 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.95 
 
 
462 aa  112  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.05 
 
 
468 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.17 
 
 
487 aa  104  4e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  28.54 
 
 
466 aa  99.4  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  28.54 
 
 
466 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.94 
 
 
475 aa  98.6  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  28.08 
 
 
466 aa  94.7  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.44 
 
 
472 aa  94.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  30.19 
 
 
469 aa  94  6e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.06 
 
 
454 aa  94  6e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  27.07 
 
 
484 aa  92.4  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  28.73 
 
 
441 aa  92.8  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.82 
 
 
454 aa  90.1  9e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  28.17 
 
 
490 aa  89.7  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.65 
 
 
447 aa  89.7  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  29.12 
 
 
445 aa  87.8  4e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  26.48 
 
 
665 aa  87.4  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.92 
 
 
451 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.71 
 
 
554 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.48 
 
 
505 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.28 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.28 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  24.66 
 
 
448 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  30.14 
 
 
632 aa  84.3  0.000000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.91 
 
 
474 aa  84.3  0.000000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.29 
 
 
463 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  26.94 
 
 
669 aa  83.6  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  25.91 
 
 
454 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  23.75 
 
 
456 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.06 
 
 
505 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.5 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.42 
 
 
456 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.75 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.65 
 
 
479 aa  80.5  0.00000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
455 aa  80.5  0.00000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.61 
 
 
448 aa  80.1  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  26.36 
 
 
487 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.45 
 
 
475 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.71 
 
 
543 aa  80.1  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  26.58 
 
 
692 aa  79  0.0000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.65 
 
 
488 aa  78.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.5 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.37 
 
 
479 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.87 
 
 
457 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  35.75 
 
 
452 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
457 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.22 
 
 
456 aa  77  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.66 
 
 
468 aa  77.4  0.0000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  28.54 
 
 
591 aa  77.4  0.0000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.41 
 
 
468 aa  77  0.0000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.22 
 
 
458 aa  77  0.0000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0782  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal  28.2 
 
 
452 aa  76.6  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764259 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  25.45 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  25 
 
 
458 aa  76.6  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  25.45 
 
 
467 aa  76.3  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.29 
 
 
431 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.96 
 
 
499 aa  76.6  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.6 
 
 
473 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  25.45 
 
 
467 aa  75.1  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.5 
 
 
502 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.38 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  24.68 
 
 
781 aa  74.3  0.000000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.12 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  25.53 
 
 
472 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.91 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.14 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  27.59 
 
 
636 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  29.5 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.5 
 
 
502 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  27.85 
 
 
646 aa  73.6  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.86 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.13 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  28.5 
 
 
465 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.76 
 
 
444 aa  70.9  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.72 
 
 
457 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3464  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.68 
 
 
483 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.538459  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.88 
 
 
477 aa  69.3  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  25.7 
 
 
474 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.28 
 
 
456 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  25.81 
 
 
642 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  27.76 
 
 
471 aa  69.3  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  25.21 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  25.21 
 
 
441 aa  68.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.63 
 
 
473 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  27.94 
 
 
452 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1951  flagellar hook-associated protein FliD  30.9 
 
 
492 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.151214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.86 
 
 
500 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  28.07 
 
 
468 aa  67  0.0000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0092  flagellar hook-associated protein  29.38 
 
 
506 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3871  flagellar hook-associated protein  29.38 
 
 
506 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.37 
 
 
453 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.07 
 
 
468 aa  66.2  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  27.8 
 
 
500 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>