195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0761 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0761  flagellar hook-associated protein  100 
 
 		 559 aa  1067    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0867  flagellar hook-associated 2-like  63.77 
 
 		 568 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0708  flagellar hook-associated 2 domain protein  61.81 
 
 		 571 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.208024  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3160  putative flagellar hook-associated protein 2 (HAP2, fliD protein)  59.81 
 
 		 572 aa  594  1e-168  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0737875  normal  0.0817319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  31.17 
 
 		 551 aa  171  4e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5091  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  30.89 
 
 		 471 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2833  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.68 
 
 		 487 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.140245  decreased coverage  0.00782764 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.71 
 
 		 456 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.24 
 
 		 457 aa  107  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  28.88 
 
 		 456 aa  107  7e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  27.57 
 
 		 668 aa  106  1e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.9 
 
 		 451 aa  104  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.05 
 
 		 457 aa  100  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  28.72 
 
 		 469 aa  97.4  7e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.83 
 
 		 454 aa  96.7  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  29.64 
 
 		 487 aa  95.9  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 454 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 454 aa  95.9  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  30.79 
 
 		 445 aa  95.1  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.39 
 
 		 462 aa  95.1  3e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  28.64 
 
 		 466 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.19 
 
 		 456 aa  94  7e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  28.64 
 
 		 466 aa  94  7e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.65 
 
 		 456 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.34 
 
 		 455 aa  92.4  2e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  29.34 
 
 		 466 aa  90.9  6e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.67 
 
 		 447 aa  90.5  8e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.11 
 
 		 456 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3937  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.22 
 
 		 463 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  27.75 
 
 		 487 aa  87.4  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.25 
 
 		 468 aa  86.3  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.23 
 
 		 457 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.81 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  29.87 
 
 		 465 aa  84.7  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  27.81 
 
 		 454 aa  83.6  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.12 
 
 		 554 aa  83.6  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.88 
 
 		 473 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  28.36 
 
 		 632 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  28.21 
 
 		 474 aa  82.8  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  30.65 
 
 		 468 aa  82.4  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.13 
 
 		 468 aa  81.6  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.8 
 
 		 499 aa  82  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  29.87 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  29.87 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  29.87 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  28.04 
 
 		 472 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.77 
 
 		 475 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 470 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.06 
 
 		 453 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1621  flagellar hook-associated protein 2 domain protein  29.04 
 
 		 579 aa  77.8  0.0000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02914  Flagellar capping protein  26.32 
 
 		 471 aa  77.4  0.0000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0732535  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  27.56 
 
 		 498 aa  77.8  0.0000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  26.84 
 
 		 454 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.81 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.81 
 
 		 678 aa  77  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3701  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.94 
 
 		 471 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.72981  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.58 
 
 		 482 aa  76.3  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  29.39 
 
 		 665 aa  76.6  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.77 
 
 		 490 aa  76.6  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.94 
 
 		 448 aa  75.1  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  26.68 
 
 		 488 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.31 
 
 		 475 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 479 aa  74.3  0.000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0102  putative fliD; flagellar hook-associated protein  29.9 
 
 		 505 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895923 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  29.1 
 
 		 471 aa  73.9  0.000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2122  flagellar capping protein  27.1 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.142898  hitchhiker  0.000000946369 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.94 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2175  flagellar capping protein  27.1 
 
 		 467 aa  73.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00699269 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  27.55 
 
 		 468 aa  73.6  0.000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  27.18 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2117  flagellar capping protein  27.1 
 
 		 467 aa  73.2  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.686409  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.2 
 
 		 473 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.67 
 
 		 458 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  27.55 
 
 		 468 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.52 
 
 		 543 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3083  flagellar hook-associated 2-like  25.98 
 
 		 486 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.36 
 
 		 479 aa  72  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.2 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.2 
 
 		 680 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.15 
 
 		 444 aa  71.6  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  25.06 
 
 		 781 aa  70.9  0.00000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  26.91 
 
 		 458 aa  71.2  0.00000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0186  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.64 
 
 		 431 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.175373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3833  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.2 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.959294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  25.56 
 
 		 445 aa  70.5  0.00000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  28.86 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.86 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  25.74 
 
 		 636 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0092  flagellar capping protein  26.16 
 
 		 607 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.47 
 
 		 451 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3638  flagellar hook-associated 2-like protein  21.26 
 
 		 448 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.66953  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.61 
 
 		 502 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  29.19 
 
 		 475 aa  68.9  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.13 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  28.61 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  28.62 
 
 		 500 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  26.42 
 
 		 692 aa  67  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  29.61 
 
 		 441 aa  66.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  26.81 
 
 		 446 aa  66.6  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.44 
 
 		 500 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>