97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0105 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0105  flagellar hook-associated 2 domain protein  100 
 
 
778 aa  1549    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2218  flagellar hook-associated 2-like protein  35.59 
 
 
838 aa  309  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3015  flagellar capping protein  29.47 
 
 
528 aa  183  1e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3201  flagellar capping protein  32.47 
 
 
500 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1783  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.14 
 
 
606 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0666  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.08 
 
 
504 aa  158  3e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00201794 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1653  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.27 
 
 
524 aa  155  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4166  flagellar hook-associated 2 domain protein  30.33 
 
 
510 aa  153  1e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2418  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.2 
 
 
612 aa  140  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0464  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.67 
 
 
519 aa  137  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0442639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0197  flagellar capping protein-like protein  31.5 
 
 
893 aa  118  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1693  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.15 
 
 
611 aa  104  6e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1623  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.04 
 
 
607 aa  101  6e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0312  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.84 
 
 
691 aa  99.8  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0400  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.07 
 
 
594 aa  89.4  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.157699  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.23 
 
 
462 aa  89.7  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1500  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.14 
 
 
591 aa  86.7  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  24.22 
 
 
632 aa  72  0.00000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0353  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.86 
 
 
502 aa  69.7  0.0000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3037  flagellar hook-associated protein 2  27.18 
 
 
469 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0228  flagellar capping protein  27.74 
 
 
441 aa  67.4  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  27.68 
 
 
487 aa  65.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0032  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.96 
 
 
475 aa  65.5  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0176  flagellar hook-associated protein, putative  27.35 
 
 
438 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.293755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  26.36 
 
 
466 aa  64.7  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  26.36 
 
 
466 aa  64.3  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.81 
 
 
466 aa  62.8  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  27.05 
 
 
677 aa  62  0.00000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.9 
 
 
665 aa  59.7  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2941  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.06 
 
 
465 aa  59.3  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.297545  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2571  flagellar capping protein  26.48 
 
 
474 aa  58.9  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0984  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.73 
 
 
469 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25 
 
 
454 aa  57.4  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2997  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.35 
 
 
444 aa  56.6  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00026238 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  24.68 
 
 
456 aa  56.6  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.96 
 
 
455 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.38 
 
 
456 aa  54.7  0.000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  25 
 
 
669 aa  54.7  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.31 
 
 
473 aa  54.7  0.000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0056  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
458 aa  53.1  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.67 
 
 
692 aa  52.8  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.64 
 
 
457 aa  52.4  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4399  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.63 
 
 
478 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.543445  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1120  flagellar hook-associated protein 2, putative  30.98 
 
 
575 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.176879  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  28.8 
 
 
513 aa  52  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  28.8 
 
 
507 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  28.8 
 
 
507 aa  52  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.12 
 
 
456 aa  52.4  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31280  flagellar capping protein  25.91 
 
 
460 aa  52  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.215819  normal  0.292754 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  25.68 
 
 
441 aa  51.6  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2119  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  31.17 
 
 
575 aa  51.2  0.00007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.35 
 
 
449 aa  51.2  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  28.8 
 
 
507 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  28.8 
 
 
507 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  28.8 
 
 
507 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  28.8 
 
 
507 aa  51.2  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0062  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.42 
 
 
472 aa  50.8  0.00009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.17 
 
 
680 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1472  flagellar hook-associated protein FliD  28.14 
 
 
652 aa  50.8  0.00009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.17 
 
 
680 aa  50.8  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.2 
 
 
479 aa  50.4  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3955  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.93 
 
 
448 aa  50.4  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0682222  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3085  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.73 
 
 
477 aa  50.8  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.896986  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  28.27 
 
 
507 aa  50.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.13 
 
 
487 aa  49.7  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3454  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.38 
 
 
448 aa  49.3  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1353  flagellar capping protein  26.03 
 
 
448 aa  49.3  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.86 
 
 
456 aa  49.3  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1895  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.49 
 
 
479 aa  48.9  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50270  flagellar capping protein FliD  28.17 
 
 
474 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.850834  decreased coverage  0.000172706 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.37 
 
 
475 aa  47.8  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.72 
 
 
443 aa  47.4  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  29.55 
 
 
500 aa  47.4  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4396  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  30.54 
 
 
482 aa  47.4  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.446586  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.73 
 
 
476 aa  47  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  22.69 
 
 
448 aa  46.6  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1693  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.04 
 
 
933 aa  46.2  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4376  flagellar cap protein FliD  24.5 
 
 
452 aa  47  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2912  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.64 
 
 
577 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.139401 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1284  flagellar capping protein  29.12 
 
 
468 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0249279  normal  0.208358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1161  flagellar capping protein  29.12 
 
 
468 aa  46.2  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.37 
 
 
473 aa  46.6  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  27.49 
 
 
454 aa  47  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.23 
 
 
457 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2386  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.75 
 
 
686 aa  46.2  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  21.31 
 
 
458 aa  45.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.66 
 
 
451 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.92 
 
 
453 aa  45.4  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.62 
 
 
447 aa  45.4  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  35.64 
 
 
657 aa  45.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2936  flagellar hook-associated 2-like  26.48 
 
 
446 aa  45.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.620131  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1557  flagellar capping protein  23.87 
 
 
458 aa  44.7  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00112262  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.81 
 
 
502 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  27.81 
 
 
502 aa  44.7  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.33 
 
 
473 aa  44.7  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.81 
 
 
502 aa  44.7  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.94 
 
 
454 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>