More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_4378 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  100 
 
 		 687 aa  1299    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  65.37 
 
 		 467 aa  239  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  65.37 
 
 		 468 aa  236  9e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  42.04 
 
 		 488 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  66.27 
 
 		 393 aa  230  8e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  45.37 
 
 		 481 aa  229  1e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  65.9 
 
 		 485 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  44.78 
 
 		 482 aa  228  3e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  68.07 
 
 		 516 aa  227  5.0000000000000005e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  65.68 
 
 		 394 aa  227  7e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  62.23 
 
 		 387 aa  225  3e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  66.27 
 
 		 484 aa  225  3e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  38.74 
 
 		 492 aa  220  7e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  65.66 
 
 		 517 aa  217  7e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  38.85 
 
 		 501 aa  215  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  63.86 
 
 		 379 aa  212  2e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  65.09 
 
 		 483 aa  210  9e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  45.89 
 
 		 402 aa  208  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  66.67 
 
 		 282 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  54.15 
 
 		 377 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  54.15 
 
 		 377 aa  208  3e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  66.67 
 
 		 282 aa  207  4e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  62.05 
 
 		 377 aa  207  4e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  44.81 
 
 		 377 aa  207  4e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  40 
 
 		 493 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  54.15 
 
 		 377 aa  207  7e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  45.85 
 
 		 377 aa  207  8e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  63.98 
 
 		 492 aa  206  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  54.15 
 
 		 377 aa  205  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  53.93 
 
 		 378 aa  205  2e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  62.35 
 
 		 377 aa  206  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  62.73 
 
 		 376 aa  204  3e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  63.58 
 
 		 294 aa  204  7e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  46.88 
 
 		 384 aa  203  8e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  62.11 
 
 		 376 aa  203  9e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  53.66 
 
 		 377 aa  202  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  62.58 
 
 		 294 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  62.42 
 
 		 283 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  57.31 
 
 		 475 aa  202  1.9999999999999998e-50  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  36.68 
 
 		 506 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  42.27 
 
 		 404 aa  201  3e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  62.42 
 
 		 375 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  60.24 
 
 		 378 aa  201  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  56.73 
 
 		 475 aa  201  5e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  42.13 
 
 		 494 aa  201  5e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  57.65 
 
 		 384 aa  200  7e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  59.41 
 
 		 379 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  59.65 
 
 		 276 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  58.58 
 
 		 272 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  58.58 
 
 		 272 aa  198  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  39.89 
 
 		 462 aa  197  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  39.43 
 
 		 497 aa  197  6e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  57.99 
 
 		 271 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  57.99 
 
 		 271 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 270 aa  195  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  42.61 
 
 		 404 aa  193  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  62.11 
 
 		 376 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  61.78 
 
 		 490 aa  192  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  56.73 
 
 		 275 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  55.42 
 
 		 385 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 		 271 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 		 271 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  56.14 
 
 		 275 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  59.75 
 
 		 388 aa  191  5e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  43.56 
 
 		 609 aa  190  9e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  56.99 
 
 		 284 aa  190  9e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  58.86 
 
 		 492 aa  190  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  56.65 
 
 		 274 aa  189  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  56.21 
 
 		 271 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  55 
 
 		 280 aa  189  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  56.21 
 
 		 271 aa  189  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  55.38 
 
 		 472 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  56.07 
 
 		 274 aa  188  4e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  57.23 
 
 		 273 aa  188  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  55.49 
 
 		 471 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  56.14 
 
 		 271 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  60.78 
 
 		 283 aa  185  3e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  53.37 
 
 		 273 aa  185  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  57.65 
 
 		 273 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  58.23 
 
 		 492 aa  184  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  54.55 
 
 		 273 aa  182  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  54.91 
 
 		 272 aa  182  2e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  58.13 
 
 		 273 aa  182  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  55.97 
 
 		 405 aa  181  4e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  55.49 
 
 		 272 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  50.83 
 
 		 279 aa  180  7e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  50.28 
 
 		 279 aa  179  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  55.49 
 
 		 273 aa  178  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  54.71 
 
 		 272 aa  178  3e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  50.67 
 
 		 319 aa  178  3e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  49.5 
 
 		 272 aa  178  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  51.03 
 
 		 272 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  52.73 
 
 		 272 aa  177  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  56.88 
 
 		 273 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  51.57 
 
 		 319 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  55.23 
 
 		 272 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  55.03 
 
 		 488 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  52.66 
 
 		 437 aa  175  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  58.97 
 
 		 273 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  57.14 
 
 		 274 aa  174  5e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>