More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_3703 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  100 
 
 		 284 aa  550  1e-156  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  66.9 
 
 		 282 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  67.61 
 
 		 282 aa  330  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  64.08 
 
 		 283 aa  315  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  63.38 
 
 		 283 aa  306  3e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  52.82 
 
 		 279 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  51.41 
 
 		 279 aa  255  5e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 278 aa  246  2e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  51.94 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  51.94 
 
 		 272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  49.83 
 
 		 294 aa  243  1.9999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  47.72 
 
 		 283 aa  237  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  47.89 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  48.65 
 
 		 294 aa  233  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  48.41 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  47.18 
 
 		 276 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  49.47 
 
 		 272 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  48.29 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 290 aa  234  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  49.82 
 
 		 273 aa  233  3e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  51.38 
 
 		 285 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  48.42 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  48.42 
 
 		 271 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  49.47 
 
 		 274 aa  232  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 		 271 aa  231  8.000000000000001e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  48.07 
 
 		 274 aa  231  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  48.77 
 
 		 274 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 		 275 aa  230  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  48.26 
 
 		 276 aa  229  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  49.82 
 
 		 275 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  49.47 
 
 		 272 aa  228  7e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  47.08 
 
 		 287 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  46.69 
 
 		 286 aa  226  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  48.94 
 
 		 273 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  48.07 
 
 		 274 aa  226  3e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  48.42 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  48.41 
 
 		 273 aa  226  3e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  50.18 
 
 		 272 aa  226  3e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  49.47 
 
 		 272 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  48.06 
 
 		 273 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  47.02 
 
 		 278 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  48.76 
 
 		 270 aa  221  7e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  49.47 
 
 		 271 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  47.02 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  48.24 
 
 		 273 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  46.32 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  46.67 
 
 		 278 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  45.94 
 
 		 273 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  47.59 
 
 		 280 aa  217  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  45.86 
 
 		 273 aa  216  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.38 
 
 		 319 aa  216  4e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  45.94 
 
 		 272 aa  215  5e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  46.43 
 
 		 275 aa  214  9e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.28 
 
 		 319 aa  214  9.999999999999999e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  44.91 
 
 		 287 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  46.89 
 
 		 272 aa  211  9e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  46.83 
 
 		 314 aa  208  7e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  46.83 
 
 		 272 aa  208  8e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  44.41 
 
 		 289 aa  207  2e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.45 
 
 		 277 aa  206  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  47.33 
 
 		 278 aa  205  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  46.34 
 
 		 278 aa  203  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  44.15 
 
 		 295 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  43.58 
 
 		 293 aa  203  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  45.09 
 
 		 281 aa  202  4e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  44.56 
 
 		 279 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  43.8 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  44.56 
 
 		 279 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  42.71 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  41.97 
 
 		 304 aa  200  3e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  45.26 
 
 		 271 aa  197  1.0000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  43.66 
 
 		 279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  45.23 
 
 		 271 aa  197  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  45.23 
 
 		 271 aa  196  3e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  44.72 
 
 		 276 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  43.62 
 
 		 275 aa  195  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  41.38 
 
 		 282 aa  195  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  44.88 
 
 		 271 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  45.26 
 
 		 271 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  41.9 
 
 		 263 aa  192  5e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  44.91 
 
 		 271 aa  192  6e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  43.16 
 
 		 273 aa  191  1e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  56.99 
 
 		 687 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  43.01 
 
 		 274 aa  190  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0063  flagellin domain-containing protein  43.42 
 
 		 272 aa  189  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  43.27 
 
 		 272 aa  189  4e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  42.7 
 
 		 272 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  38.07 
 
 		 356 aa  188  9e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  38.86 
 
 		 349 aa  187  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  43.9 
 
 		 270 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  42.16 
 
 		 281 aa  186  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  44.37 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  44.37 
 
 		 271 aa  185  7e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3958  flagellin domain-containing protein  43.82 
 
 		 268 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  46.1 
 
 		 273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  42.25 
 
 		 266 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  44.68 
 
 		 272 aa  183  3e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>