More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1726 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  100 
 
 		 376 aa  747    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  82.45 
 
 		 376 aa  633  1e-180  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  82.18 
 
 		 376 aa  631  1e-180  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  72.41 
 
 		 377 aa  550  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  71.88 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  71.35 
 
 		 377 aa  545  1e-154  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  70.74 
 
 		 402 aa  537  1e-151  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  70.03 
 
 		 377 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  72.15 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  72.15 
 
 		 377 aa  530  1e-149  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  70.03 
 
 		 375 aa  527  1e-148  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  65.52 
 
 		 378 aa  502  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  64.46 
 
 		 377 aa  483  1e-135  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  62.7 
 
 		 379 aa  482  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  64.46 
 
 		 377 aa  484  1e-135  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  64.99 
 
 		 377 aa  483  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  65.08 
 
 		 379 aa  483  1e-135  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  63.54 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  62.66 
 
 		 384 aa  477  1e-133  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  59.84 
 
 		 385 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  61.17 
 
 		 378 aa  445  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  48.66 
 
 		 374 aa  351  1e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  49.2 
 
 		 374 aa  350  2e-95  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  47.63 
 
 		 393 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.26 
 
 		 394 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  46.41 
 
 		 387 aa  305  6e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  43.45 
 
 		 405 aa  279  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  42.96 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  41.81 
 
 		 392 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  40.34 
 
 		 404 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  42.93 
 
 		 319 aa  250  2e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  41.03 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  41.03 
 
 		 390 aa  249  7e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  41.76 
 
 		 319 aa  248  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  40.79 
 
 		 375 aa  236  4e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.18 
 
 		 404 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  38.99 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  39.53 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  39.53 
 
 		 369 aa  225  1e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  41.34 
 
 		 376 aa  225  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  67.68 
 
 		 484 aa  223  4.9999999999999996e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  54.08 
 
 		 517 aa  223  6e-57  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  39.37 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  67.07 
 
 		 485 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  33.27 
 
 		 494 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  37.19 
 
 		 383 aa  219  7.999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  65.22 
 
 		 468 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  63.47 
 
 		 467 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  53.22 
 
 		 516 aa  216  5e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  62.28 
 
 		 492 aa  216  7e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  65.22 
 
 		 481 aa  215  9e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  35.48 
 
 		 420 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  40.85 
 
 		 386 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  63.35 
 
 		 482 aa  213  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  37.02 
 
 		 379 aa  210  3e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  37.94 
 
 		 390 aa  209  6e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  36.48 
 
 		 289 aa  206  5e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  37.74 
 
 		 422 aa  205  9e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  39.13 
 
 		 412 aa  205  9e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.11 
 
 		 687 aa  205  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  59.01 
 
 		 488 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  36.39 
 
 		 386 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  36.95 
 
 		 404 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.34 
 
 		 327 aa  195  9e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  53.16 
 
 		 272 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  53.16 
 
 		 272 aa  195  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  34.84 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  34.84 
 
 		 384 aa  195  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  51.52 
 
 		 475 aa  194  2e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.63 
 
 		 271 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  60 
 
 		 274 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  34.75 
 
 		 462 aa  193  4e-48  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  34.95 
 
 		 388 aa  192  6e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  51.01 
 
 		 475 aa  192  6e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  52.91 
 
 		 271 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 		 294 aa  192  8e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  52.91 
 
 		 271 aa  192  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  60.49 
 
 		 274 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  48.02 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  55.69 
 
 		 490 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 		 270 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  56.89 
 
 		 492 aa  189  7e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  57.32 
 
 		 273 aa  189  9e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  58.64 
 
 		 275 aa  188  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  54.76 
 
 		 492 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  54.29 
 
 		 580 aa  188  1e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 		 275 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  42.4 
 
 		 501 aa  187  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  56.71 
 
 		 273 aa  186  5e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  56.36 
 
 		 273 aa  186  8e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  54.22 
 
 		 493 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  57.06 
 
 		 294 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  36.52 
 
 		 385 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  55.9 
 
 		 282 aa  184  3e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  54.65 
 
 		 272 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  53.61 
 
 		 506 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  57.41 
 
 		 271 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>