More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1780 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  100 
 
 
379 aa  759    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  75.84 
 
 
384 aa  587  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  75.84 
 
 
384 aa  585  1e-166  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  72.82 
 
 
379 aa  556  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  69.58 
 
 
377 aa  512  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  69.31 
 
 
377 aa  508  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  66.4 
 
 
377 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  70.11 
 
 
377 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  70.11 
 
 
377 aa  489  1e-137  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  66.67 
 
 
376 aa  485  1e-136  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  64.81 
 
 
377 aa  480  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  65.34 
 
 
377 aa  478  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  65.34 
 
 
377 aa  479  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  66.67 
 
 
376 aa  480  1e-134  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  64.55 
 
 
375 aa  474  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  64.38 
 
 
402 aa  473  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  61.48 
 
 
378 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  62.43 
 
 
377 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  65.08 
 
 
376 aa  452  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  60.42 
 
 
378 aa  446  1.0000000000000001e-124  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  56.99 
 
 
385 aa  427  1e-118  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  48.14 
 
 
374 aa  343  2e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  47.61 
 
 
374 aa  340  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  49.26 
 
 
394 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  48.87 
 
 
393 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  48.33 
 
 
387 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  44.28 
 
 
405 aa  281  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  42.64 
 
 
395 aa  273  4.0000000000000004e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  42.86 
 
 
392 aa  261  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  41.98 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  41.98 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  42.82 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  41.1 
 
 
375 aa  241  1e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  38.87 
 
 
376 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  37.1 
 
 
437 aa  232  7.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  37.73 
 
 
431 aa  228  1e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  39.79 
 
 
356 aa  227  2e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  40.74 
 
 
319 aa  226  6e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  41.23 
 
 
386 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  68.05 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  68.05 
 
 
485 aa  219  5e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  36.27 
 
 
383 aa  219  8.999999999999998e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  37.04 
 
 
380 aa  217  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  36.41 
 
 
390 aa  215  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  66.47 
 
 
467 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  64.37 
 
 
481 aa  211  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  34.59 
 
 
420 aa  210  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  65.27 
 
 
468 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  66.27 
 
 
516 aa  208  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  63.91 
 
 
517 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  62.64 
 
 
482 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  61.93 
 
 
492 aa  206  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  37.63 
 
 
327 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  36.09 
 
 
379 aa  204  2e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  63.35 
 
 
488 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  36.09 
 
 
391 aa  199  6e-50  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  59.41 
 
 
687 aa  199  7e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  36.46 
 
 
373 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  36.53 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  46.46 
 
 
483 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  35.7 
 
 
369 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  35.34 
 
 
404 aa  195  1e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  35.7 
 
 
369 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  33.25 
 
 
387 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  34.66 
 
 
388 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  33.67 
 
 
387 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.28 
 
 
389 aa  189  5.999999999999999e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  56.8 
 
 
494 aa  188  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  59.38 
 
 
404 aa  186  6e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  57.4 
 
 
490 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  59.64 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  59.64 
 
 
271 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  57.58 
 
 
506 aa  184  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  56.8 
 
 
493 aa  184  3e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 
272 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  58.28 
 
 
294 aa  182  7e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  59.26 
 
 
271 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  59.26 
 
 
271 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  52.08 
 
 
271 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  52.08 
 
 
271 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  55.62 
 
 
492 aa  181  2e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  56.36 
 
 
501 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  33.59 
 
 
384 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  33.59 
 
 
384 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  52.41 
 
 
475 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  58.75 
 
 
273 aa  179  9e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  56.63 
 
 
492 aa  179  1e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  34.02 
 
 
383 aa  179  1e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  56.17 
 
 
282 aa  178  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  56.89 
 
 
273 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  56.4 
 
 
274 aa  178  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  55.06 
 
 
273 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  55.81 
 
 
275 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  51.87 
 
 
475 aa  177  3e-43  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  36.63 
 
 
385 aa  177  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  55.23 
 
 
275 aa  176  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  56.4 
 
 
274 aa  176  6e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  54.72 
 
 
580 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  59.49 
 
 
272 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>