More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1356 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 273 aa  536  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  89.71 
 
 		 272 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  87.91 
 
 		 273 aa  468  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  87.55 
 
 		 273 aa  463  1e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  85.71 
 
 		 273 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  85.29 
 
 		 272 aa  455  1e-127  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  84.62 
 
 		 273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  83.88 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  85.29 
 
 		 272 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  83.09 
 
 		 272 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  83.82 
 
 		 272 aa  444  1.0000000000000001e-124  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  82.78 
 
 		 273 aa  442  1e-123  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  81.09 
 
 		 275 aa  437  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  83.46 
 
 		 272 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  81.09 
 
 		 275 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  84.62 
 
 		 273 aa  435  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  80.66 
 
 		 274 aa  434  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  81.02 
 
 		 274 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  79.12 
 
 		 272 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  79.12 
 
 		 272 aa  424  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  80.51 
 
 		 271 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  80.51 
 
 		 271 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  79.78 
 
 		 271 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  79.78 
 
 		 271 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  78.31 
 
 		 271 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  78.31 
 
 		 271 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  81.99 
 
 		 270 aa  413  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  80.88 
 
 		 271 aa  410  1e-113  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.07 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  49.09 
 
 		 276 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  48.47 
 
 		 294 aa  250  2e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  48.32 
 
 		 294 aa  249  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  50.36 
 
 		 274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  48.53 
 
 		 272 aa  237  1e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  48.91 
 
 		 274 aa  237  2e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  48.09 
 
 		 272 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  47.83 
 
 		 276 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  49.64 
 
 		 271 aa  233  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  47.86 
 
 		 279 aa  232  5e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  49.64 
 
 		 271 aa  232  6e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  49.28 
 
 		 271 aa  230  2e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  47.52 
 
 		 279 aa  229  2e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  48.16 
 
 		 263 aa  228  7e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 		 271 aa  228  7e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  43.3 
 
 		 319 aa  228  8e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  45.79 
 
 		 273 aa  228  1e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  48.61 
 
 		 289 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.44 
 
 		 319 aa  227  2e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  47.14 
 
 		 278 aa  226  3e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  48 
 
 		 271 aa  224  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  45.42 
 
 		 272 aa  223  2e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  47.64 
 
 		 271 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 		 271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  45.96 
 
 		 262 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  45.42 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  50.18 
 
 		 283 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  48.06 
 
 		 287 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  44.88 
 
 		 283 aa  216  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  47.04 
 
 		 281 aa  216  4e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  48.59 
 
 		 282 aa  216  5e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  45.7 
 
 		 290 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  45.93 
 
 		 281 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  44.79 
 
 		 286 aa  213  2.9999999999999995e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  47.89 
 
 		 282 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  50.18 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  44.79 
 
 		 288 aa  212  5.999999999999999e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  45.13 
 
 		 277 aa  211  7.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  45.22 
 
 		 263 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  45.2 
 
 		 278 aa  211  9e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  47.37 
 
 		 285 aa  209  5e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  44.49 
 
 		 263 aa  208  8e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  43.68 
 
 		 275 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  42.86 
 
 		 282 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  44.49 
 
 		 265 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  44.85 
 
 		 266 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  44.4 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  41.97 
 
 		 273 aa  206  4e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  44.29 
 
 		 287 aa  205  5e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  41.81 
 
 		 295 aa  203  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  46.38 
 
 		 276 aa  203  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  48.07 
 
 		 284 aa  201  8e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  45.36 
 
 		 281 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  62.96 
 
 		 481 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  41.91 
 
 		 304 aa  198  6e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  39.26 
 
 		 327 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  43.96 
 
 		 273 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  41.61 
 
 		 272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  61.08 
 
 		 485 aa  196  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  42.7 
 
 		 314 aa  196  5.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1375  flagellin  42.16 
 
 		 271 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000344656  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  61.08 
 
 		 484 aa  194  9e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  44.49 
 
 		 377 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  53.76 
 
 		 375 aa  193  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  41.48 
 
 		 267 aa  193  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0057  flagellin domain-containing protein  44.32 
 
 		 264 aa  192  4e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0196  flagellin domain-containing protein  41.14 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  58.52 
 
 		 467 aa  192  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 		 394 aa  191  8e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3455  flagellin domain-containing protein  41.76 
 
 		 270 aa  191  9e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>