More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1727 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  100 
 
 		 377 aa  752    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  84.08 
 
 		 377 aa  637    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  84.35 
 
 		 377 aa  640    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  82.23 
 
 		 377 aa  627  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  84.35 
 
 		 377 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  84.35 
 
 		 377 aa  617  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  73.81 
 
 		 376 aa  553  1e-156  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  72.94 
 
 		 376 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  71.62 
 
 		 375 aa  538  9.999999999999999e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  71.28 
 
 		 402 aa  533  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  69.76 
 
 		 377 aa  525  1e-148  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  69.5 
 
 		 377 aa  523  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  71.35 
 
 		 376 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  66.67 
 
 		 378 aa  498  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  66.4 
 
 		 379 aa  494  9.999999999999999e-139  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  65.87 
 
 		 379 aa  489  1e-137  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  64.89 
 
 		 378 aa  486  1e-136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  64.49 
 
 		 384 aa  484  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  63.97 
 
 		 384 aa  481  1e-134  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  63.3 
 
 		 385 aa  476  1e-133  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  63.66 
 
 		 377 aa  470  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  51.87 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  51.34 
 
 		 374 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 393 aa  330  4e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  49.87 
 
 		 394 aa  328  8e-89  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  45.13 
 
 		 387 aa  296  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  43.22 
 
 		 392 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  42.96 
 
 		 395 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  40.14 
 
 		 405 aa  265  1e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  43.5 
 
 		 319 aa  260  3e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.62 
 
 		 319 aa  257  3e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40.62 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40.62 
 
 		 390 aa  240  2.9999999999999997e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  38.82 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.12 
 
 		 404 aa  236  6e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  42.01 
 
 		 376 aa  230  3e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  38.44 
 
 		 380 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  41.12 
 
 		 386 aa  226  6e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  59.22 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  38.29 
 
 		 356 aa  221  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  67.68 
 
 		 485 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  67.07 
 
 		 484 aa  220  3e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  37.18 
 
 		 420 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  35.15 
 
 		 437 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  57.77 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  35.52 
 
 		 431 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  37.44 
 
 		 375 aa  217  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  38.33 
 
 		 404 aa  213  4.9999999999999996e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  36.92 
 
 		 383 aa  213  5.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  60.69 
 
 		 482 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  61.85 
 
 		 481 aa  212  9e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  38.56 
 
 		 390 aa  212  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  36.95 
 
 		 327 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  53.02 
 
 		 517 aa  209  6e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  62.05 
 
 		 687 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  52.16 
 
 		 516 aa  207  3e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  37.8 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  37.8 
 
 		 369 aa  205  1e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  59.28 
 
 		 492 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  59.51 
 
 		 488 aa  200  3e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  37.82 
 
 		 422 aa  199  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  63.35 
 
 		 271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  63.35 
 
 		 271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  47.35 
 
 		 483 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 		 271 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 		 271 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  62.11 
 
 		 271 aa  195  9e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  36.12 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  60.87 
 
 		 272 aa  194  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  35.64 
 
 		 391 aa  192  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  36.25 
 
 		 412 aa  192  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  37.74 
 
 		 412 aa  192  1e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  60.49 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  59.51 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  35.57 
 
 		 386 aa  191  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  57.23 
 
 		 475 aa  190  2.9999999999999997e-47  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3587  flagellin domain-containing protein  36.67 
 
 		 345 aa  189  5.999999999999999e-47  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  34.73 
 
 		 387 aa  189  8e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  56.63 
 
 		 475 aa  189  9e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  33.83 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  33.83 
 
 		 384 aa  189  9e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  50.51 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  60.49 
 
 		 274 aa  187  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  35.09 
 
 		 389 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  36.7 
 
 		 372 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 		 274 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  34.55 
 
 		 379 aa  187  4e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  59.88 
 
 		 275 aa  186  4e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  59.01 
 
 		 270 aa  186  6e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  61.11 
 
 		 273 aa  186  6e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  59.51 
 
 		 273 aa  186  7e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  59.26 
 
 		 275 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  58.9 
 
 		 272 aa  184  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 		 273 aa  183  3e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 		 273 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.29 
 
 		 490 aa  183  5.0000000000000004e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  36.75 
 
 		 385 aa  182  7e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  53.61 
 
 		 492 aa  182  1e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>