More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4166 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  100 
 
 		 412 aa  803    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  64.32 
 
 		 398 aa  480  1e-134  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  64.03 
 
 		 373 aa  435  1e-121  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  57.6 
 
 		 412 aa  379  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  57.66 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  57.66 
 
 		 369 aa  381  1e-104  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  54 
 
 		 379 aa  377  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  53.5 
 
 		 422 aa  343  2e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  47.08 
 
 		 506 aa  337  1.9999999999999998e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  47.08 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  47.08 
 
 		 506 aa  336  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  50.12 
 
 		 356 aa  328  7e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  80.45 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  80.45 
 
 		 505 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  82.95 
 
 		 506 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  47.24 
 
 		 392 aa  280  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  45.41 
 
 		 395 aa  279  7e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  63.1 
 
 		 502 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  71.1 
 
 		 493 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  46.4 
 
 		 405 aa  275  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  74.86 
 
 		 579 aa  273  3e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  75.56 
 
 		 585 aa  273  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  73.77 
 
 		 568 aa  271  1e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  73.12 
 
 		 545 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1716  flagellin  74.32 
 
 		 572 aa  268  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.363061 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  75 
 
 		 498 aa  264  3e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  41.7 
 
 		 475 aa  262  8.999999999999999e-69  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  73.03 
 
 		 349 aa  258  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  42.17 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  38.4 
 
 		 493 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  38.51 
 
 		 494 aa  252  7e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  39.96 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  39.29 
 
 		 437 aa  248  1e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  80.89 
 
 		 160 aa  248  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  68.72 
 
 		 567 aa  246  6.999999999999999e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  37.92 
 
 		 469 aa  243  5e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  40.94 
 
 		 404 aa  243  6e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  42.79 
 
 		 375 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  43.27 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  43.27 
 
 		 390 aa  233  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  38.93 
 
 		 393 aa  230  3e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  38.65 
 
 		 394 aa  229  5e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.86 
 
 		 404 aa  228  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  37.53 
 
 		 378 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  37.14 
 
 		 377 aa  220  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  37.74 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  37.74 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  36.56 
 
 		 377 aa  216  4e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  39.86 
 
 		 379 aa  216  5.9999999999999996e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  39.66 
 
 		 377 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  37.67 
 
 		 420 aa  215  9.999999999999999e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  37.23 
 
 		 377 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  38.26 
 
 		 377 aa  213  3.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  36.98 
 
 		 377 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  38.46 
 
 		 376 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  37.83 
 
 		 402 aa  210  4e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  37.35 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  37.35 
 
 		 384 aa  208  2e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  35.02 
 
 		 378 aa  205  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  36.06 
 
 		 379 aa  202  6e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  35.46 
 
 		 384 aa  202  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  36.49 
 
 		 375 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  35.41 
 
 		 498 aa  199  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  35.07 
 
 		 384 aa  199  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  65.62 
 
 		 288 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  37.35 
 
 		 387 aa  195  1e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  36.08 
 
 		 482 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  55.56 
 
 		 609 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  37.75 
 
 		 380 aa  191  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  52.21 
 
 		 501 aa  189  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  63.75 
 
 		 278 aa  189  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  33.01 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  58.24 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  63.69 
 
 		 490 aa  186  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  64.33 
 
 		 492 aa  186  9e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  55.38 
 
 		 475 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  59.75 
 
 		 388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  58.05 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  36.97 
 
 		 391 aa  183  4.0000000000000006e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  36.14 
 
 		 390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  62.42 
 
 		 506 aa  183  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  36.42 
 
 		 481 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  56.28 
 
 		 488 aa  181  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  35.49 
 
 		 376 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  62.42 
 
 		 492 aa  179  8e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  34.67 
 
 		 388 aa  177  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  56.52 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  33.95 
 
 		 493 aa  176  8e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  33.74 
 
 		 493 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  62.03 
 
 		 275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  33.1 
 
 		 387 aa  173  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  38.31 
 
 		 385 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  32.39 
 
 		 383 aa  172  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  56.63 
 
 		 472 aa  172  1e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  35.95 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  54.49 
 
 		 471 aa  171  2e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  34.5 
 
 		 386 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  51.61 
 
 		 488 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  34.32 
 
 		 420 aa  170  5e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 		 492 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>