More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1053 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  66 
 
 
585 aa  667    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  100 
 
 
568 aa  1093    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  60.29 
 
 
579 aa  550  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  60.79 
 
 
545 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  54.77 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1716  flagellin  57.99 
 
 
572 aa  496  1e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  47.59 
 
 
506 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  47.59 
 
 
506 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  62.35 
 
 
498 aa  330  4e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  89.27 
 
 
349 aa  312  7.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  64.58 
 
 
505 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  77.07 
 
 
505 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  59.52 
 
 
493 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  73.87 
 
 
506 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  79.43 
 
 
502 aa  282  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  79.43 
 
 
506 aa  281  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  68.42 
 
 
373 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  67.41 
 
 
422 aa  274  3e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  78.16 
 
 
369 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  78.16 
 
 
369 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  73.77 
 
 
412 aa  269  8e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  71.51 
 
 
398 aa  253  5.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  80.13 
 
 
160 aa  248  2e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  70.72 
 
 
379 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  72.57 
 
 
412 aa  244  3.9999999999999997e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  66.86 
 
 
356 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  55.8 
 
 
288 aa  196  9e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  64.67 
 
 
278 aa  191  2.9999999999999997e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  29.59 
 
 
513 aa  183  6e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  56.5 
 
 
405 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  55.81 
 
 
609 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  56.35 
 
 
395 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  56.74 
 
 
392 aa  177  6e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  61.73 
 
 
488 aa  177  6e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 
462 aa  176  9e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  58.39 
 
 
388 aa  175  1.9999999999999998e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  54.87 
 
 
275 aa  174  2.9999999999999996e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  45.35 
 
 
501 aa  173  7.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  59.49 
 
 
492 aa  172  1e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  57.39 
 
 
486 aa  171  3e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  47.47 
 
 
497 aa  171  3e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  57.76 
 
 
431 aa  169  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  57.14 
 
 
404 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  58.23 
 
 
492 aa  168  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  53.49 
 
 
475 aa  167  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.69 
 
 
490 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  52.91 
 
 
475 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  56.52 
 
 
437 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  49.03 
 
 
394 aa  164  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  50.24 
 
 
471 aa  164  5.0000000000000005e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  49.73 
 
 
494 aa  164  5.0000000000000005e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  48.57 
 
 
472 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  48.54 
 
 
393 aa  161  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  54.55 
 
 
375 aa  160  6e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  51.72 
 
 
492 aa  159  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  42.64 
 
 
389 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 
467 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  45.04 
 
 
272 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.86 
 
 
276 aa  157  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  54.04 
 
 
384 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  54.04 
 
 
384 aa  158  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  54.66 
 
 
404 aa  157  4e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  52.2 
 
 
383 aa  157  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  40 
 
 
275 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  47.49 
 
 
271 aa  157  4e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  47.49 
 
 
271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  48.11 
 
 
319 aa  157  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  49.48 
 
 
279 aa  157  7e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  55.15 
 
 
283 aa  156  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  54.09 
 
 
469 aa  155  1e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  54.88 
 
 
390 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  46.93 
 
 
271 aa  155  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  54.88 
 
 
390 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  39.02 
 
 
420 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  48.94 
 
 
468 aa  155  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  48.65 
 
 
319 aa  155  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  54.61 
 
 
279 aa  155  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  50.56 
 
 
271 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  50.56 
 
 
271 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  154  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  52.02 
 
 
272 aa  154  5e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  55.92 
 
 
287 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  44.44 
 
 
271 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  47.65 
 
 
580 aa  152  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  47.29 
 
 
488 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  53.02 
 
 
278 aa  151  3e-35  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  53.09 
 
 
294 aa  151  4e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  47.37 
 
 
687 aa  150  5e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  45.45 
 
 
275 aa  150  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  48.82 
 
 
484 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  49.43 
 
 
272 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  49.43 
 
 
272 aa  149  9e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  39.12 
 
 
379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  50.57 
 
 
271 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>