More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2570 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  100 
 
 
288 aa  553  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  71.53 
 
 
278 aa  354  1e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  65.97 
 
 
275 aa  344  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  50.51 
 
 
278 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  50.34 
 
 
279 aa  263  2e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
279 aa  260  2e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.76 
 
 
276 aa  257  2e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  52.6 
 
 
290 aa  254  2.0000000000000002e-66  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  52.26 
 
 
285 aa  250  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  51.72 
 
 
283 aa  249  3e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  50.68 
 
 
294 aa  249  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  50.68 
 
 
287 aa  248  7e-65  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  50.17 
 
 
294 aa  247  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  53.85 
 
 
280 aa  246  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  50.7 
 
 
286 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  48.95 
 
 
273 aa  238  8e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  49.45 
 
 
272 aa  234  2.0000000000000002e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  45.6 
 
 
304 aa  233  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  49.65 
 
 
283 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  49.12 
 
 
276 aa  231  1e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  49.31 
 
 
287 aa  230  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  46.53 
 
 
275 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  50 
 
 
278 aa  228  6e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  46.18 
 
 
275 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
272 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
272 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  48.42 
 
 
274 aa  227  1e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  45.14 
 
 
273 aa  226  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  45.67 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  45.67 
 
 
272 aa  227  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  47.92 
 
 
273 aa  227  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  46.53 
 
 
271 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  48.44 
 
 
272 aa  226  4e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  46.53 
 
 
271 aa  226  4e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  44.79 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  49.47 
 
 
282 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  45.67 
 
 
273 aa  225  6e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 
271 aa  225  8e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  46.18 
 
 
273 aa  224  9e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  48.42 
 
 
282 aa  224  1e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  45.61 
 
 
266 aa  224  1e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  47.22 
 
 
272 aa  224  1e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 
271 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  42.81 
 
 
319 aa  224  2e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  48.07 
 
 
314 aa  223  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  45.67 
 
 
282 aa  223  2e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  48.77 
 
 
271 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  45.92 
 
 
295 aa  223  2e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  45.26 
 
 
263 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  44.48 
 
 
273 aa  223  4e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  47.55 
 
 
276 aa  222  4e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  48 
 
 
272 aa  223  4e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  45.61 
 
 
295 aa  222  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  44.86 
 
 
272 aa  222  6e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  47.02 
 
 
274 aa  222  6e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
271 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
271 aa  222  7e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  42.99 
 
 
319 aa  222  7e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  48.25 
 
 
271 aa  221  9.999999999999999e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  46.85 
 
 
271 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
271 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
271 aa  219  5e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  46.58 
 
 
293 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  47.22 
 
 
271 aa  219  5e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  45.49 
 
 
273 aa  218  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
276 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  57.08 
 
 
422 aa  218  1e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  44.79 
 
 
273 aa  218  1e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  43.3 
 
 
272 aa  216  2e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  45.14 
 
 
273 aa  217  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  48.2 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  46.53 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3343  flagellin  48.07 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  47.59 
 
 
284 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  65.75 
 
 
506 aa  214  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  43.4 
 
 
273 aa  214  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  42.46 
 
 
327 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  71.25 
 
 
502 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  43.4 
 
 
274 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  62.12 
 
 
493 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  46.18 
 
 
271 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  47.08 
 
 
281 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  43.86 
 
 
263 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  71.25 
 
 
506 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  71.25 
 
 
506 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  71.25 
 
 
506 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  46.53 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  46.53 
 
 
271 aa  213  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  46.53 
 
 
273 aa  212  5.999999999999999e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  45.83 
 
 
270 aa  212  5.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0156  flagellin  46.02 
 
 
274 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.447267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  44.21 
 
 
265 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0169  flagellin  46.02 
 
 
274 aa  211  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.521055  normal  0.980179 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  45.07 
 
 
279 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  43.4 
 
 
274 aa  210  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  45.1 
 
 
273 aa  210  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  44.72 
 
 
279 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  44.72 
 
 
279 aa  209  4e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  42.71 
 
 
272 aa  209  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  47.02 
 
 
283 aa  208  7e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>