More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SNSL254_A2120 on replicon NC_011080
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  80.31 
 
 
506 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  100 
 
 
502 aa  989    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  80.2 
 
 
506 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  80.31 
 
 
506 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  72.47 
 
 
493 aa  672    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  69.65 
 
 
506 aa  614  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  54.68 
 
 
498 aa  435  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  54.68 
 
 
505 aa  436  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  54.55 
 
 
505 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  51.07 
 
 
412 aa  381  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  62.85 
 
 
373 aa  287  2.9999999999999996e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  60.29 
 
 
579 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  79.43 
 
 
568 aa  282  9e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  81.98 
 
 
369 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  81.98 
 
 
369 aa  277  3e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  72.04 
 
 
422 aa  276  6e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  80.68 
 
 
412 aa  274  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  73.77 
 
 
349 aa  265  2e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  85.26 
 
 
160 aa  262  1e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  38.97 
 
 
475 aa  261  2e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  38.97 
 
 
475 aa  260  3e-68  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  36.65 
 
 
497 aa  252  1e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  68.21 
 
 
398 aa  250  4e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  72.09 
 
 
567 aa  248  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  38.25 
 
 
493 aa  248  2e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  58.88 
 
 
356 aa  239  1e-61  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  69.32 
 
 
379 aa  236  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  71.25 
 
 
288 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  70 
 
 
278 aa  210  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  34.69 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  62.35 
 
 
405 aa  191  2e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  55.1 
 
 
609 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  56.99 
 
 
388 aa  188  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  55.73 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  58.43 
 
 
392 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  61.4 
 
 
275 aa  184  3e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  63.69 
 
 
492 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  60 
 
 
488 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  61.78 
 
 
501 aa  181  2e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  45.16 
 
 
276 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  60.25 
 
 
404 aa  179  8e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  60.62 
 
 
462 aa  179  9e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  53.27 
 
 
494 aa  178  2e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  61.64 
 
 
490 aa  177  3e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  61.15 
 
 
492 aa  176  7e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  58.39 
 
 
404 aa  172  1e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  59.24 
 
 
506 aa  171  2e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  59.12 
 
 
431 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  57.96 
 
 
437 aa  168  2e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  55.23 
 
 
492 aa  168  2.9999999999999998e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  58.72 
 
 
486 aa  167  2.9999999999999998e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  52.72 
 
 
469 aa  167  5e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  51.92 
 
 
471 aa  166  9e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  51.18 
 
 
472 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  53.76 
 
 
492 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  56.96 
 
 
278 aa  163  6e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  56.44 
 
 
375 aa  162  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  56.52 
 
 
279 aa  161  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  33.62 
 
 
404 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  57.89 
 
 
279 aa  160  4e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 
272 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  50.53 
 
 
272 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  57.72 
 
 
278 aa  160  7e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  54.88 
 
 
390 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  54.88 
 
 
390 aa  159  1e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  51 
 
 
467 aa  159  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  56.07 
 
 
272 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  57.05 
 
 
283 aa  158  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  52.05 
 
 
687 aa  157  3e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  52 
 
 
272 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  54.12 
 
 
394 aa  158  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  49.48 
 
 
271 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  49.48 
 
 
271 aa  157  4e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  52.27 
 
 
271 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  52.27 
 
 
271 aa  157  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
468 aa  155  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  51.58 
 
 
272 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  51.69 
 
 
270 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  55.49 
 
 
290 aa  155  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  51.7 
 
 
271 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  51.7 
 
 
271 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  52.33 
 
 
482 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  48.31 
 
 
271 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  53.53 
 
 
393 aa  155  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  42.91 
 
 
383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  52.35 
 
 
481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  51.18 
 
 
484 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  51.18 
 
 
488 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  39.41 
 
 
271 aa  153  7e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  56.58 
 
 
286 aa  153  8e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  52.2 
 
 
388 aa  153  8e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
271 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  48.31 
 
 
271 aa  152  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  54.76 
 
 
287 aa  152  1e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>