More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0631 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  97.45 
 
 
472 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  100 
 
 
471 aa  884    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  51.49 
 
 
493 aa  374  1e-102  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  49.9 
 
 
490 aa  368  1e-100  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  49.12 
 
 
501 aa  361  1e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  50.41 
 
 
475 aa  355  1e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  50.41 
 
 
475 aa  354  2e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  51.09 
 
 
492 aa  354  2e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  47.96 
 
 
405 aa  344  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  47.6 
 
 
506 aa  338  9.999999999999999e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  46 
 
 
492 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  47.35 
 
 
392 aa  335  1e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  47.63 
 
 
462 aa  331  2e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  46.33 
 
 
404 aa  327  3e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  46.22 
 
 
494 aa  321  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  44.31 
 
 
497 aa  319  7e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  45.96 
 
 
404 aa  317  2e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  61.46 
 
 
609 aa  315  8e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  41.78 
 
 
516 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  45.66 
 
 
486 aa  306  4.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  40.45 
 
 
517 aa  297  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  42.28 
 
 
481 aa  292  9e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  43.14 
 
 
488 aa  291  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  43.24 
 
 
469 aa  287  2e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  44.3 
 
 
390 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  44.3 
 
 
390 aa  288  2e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  40.12 
 
 
493 aa  282  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  40.85 
 
 
482 aa  282  1e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  43.14 
 
 
488 aa  281  2e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  39.92 
 
 
493 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  40.89 
 
 
484 aa  279  6e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  40.69 
 
 
485 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  41.31 
 
 
467 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  41.53 
 
 
437 aa  273  7e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  40.7 
 
 
498 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  41.51 
 
 
468 aa  270  4e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  38.48 
 
 
492 aa  266  4e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  41.02 
 
 
502 aa  265  1e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  39.26 
 
 
505 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  40.2 
 
 
505 aa  261  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  40.08 
 
 
506 aa  259  7e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  40.38 
 
 
506 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  40.38 
 
 
506 aa  258  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  39.45 
 
 
493 aa  252  1e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  38.69 
 
 
420 aa  251  2e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  60.49 
 
 
388 aa  249  6e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  39.03 
 
 
483 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  39.77 
 
 
498 aa  236  8e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  41.14 
 
 
422 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  41.86 
 
 
412 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0151  flagellin domain-containing protein  39.17 
 
 
516 aa  231  3e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.125081  normal  0.382062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  36.94 
 
 
379 aa  229  7e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  36.89 
 
 
545 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  54.25 
 
 
395 aa  223  8e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  34.3 
 
 
502 aa  217  4e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  69.01 
 
 
492 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  59.16 
 
 
279 aa  206  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  59.9 
 
 
279 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  58.33 
 
 
278 aa  205  2e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  61.08 
 
 
431 aa  199  6e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  60.54 
 
 
276 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  50.98 
 
 
492 aa  193  6e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  56.32 
 
 
580 aa  192  2e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  56.02 
 
 
387 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  55.49 
 
 
687 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  49.56 
 
 
375 aa  187  3e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  61.96 
 
 
288 aa  187  5e-46  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  48.4 
 
 
393 aa  186  7e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  57.29 
 
 
272 aa  186  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  57.67 
 
 
283 aa  186  9e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  59.9 
 
 
280 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  62.96 
 
 
290 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  57.99 
 
 
276 aa  183  5.0000000000000004e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  48 
 
 
394 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  57.61 
 
 
272 aa  182  9.000000000000001e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  59.51 
 
 
278 aa  181  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  64 
 
 
286 aa  182  2e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  33.2 
 
 
496 aa  181  2.9999999999999997e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1536  flagellin  32.31 
 
 
460 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000428862  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  64.19 
 
 
287 aa  179  7e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  30.1 
 
 
519 aa  179  7e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  55 
 
 
567 aa  179  1e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2297  flagellin B  29.5 
 
 
499 aa  177  5e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  53.52 
 
 
287 aa  176  7e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  45.88 
 
 
404 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  57.32 
 
 
282 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  56.96 
 
 
272 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  63.09 
 
 
278 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  56.96 
 
 
272 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  54.05 
 
 
369 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  54.59 
 
 
273 aa  172  1e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  54.05 
 
 
369 aa  172  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  54.49 
 
 
412 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  34.58 
 
 
481 aa  171  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  59.12 
 
 
274 aa  171  2e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  56.33 
 
 
271 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  55.7 
 
 
271 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  56.33 
 
 
271 aa  171  4e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  56.96 
 
 
283 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  55.7 
 
 
271 aa  170  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>