More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_3850 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
502 aa  1017    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  36.65 
 
 
513 aa  262  1e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  33.71 
 
 
488 aa  209  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  32.72 
 
 
517 aa  205  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  33.02 
 
 
516 aa  202  9.999999999999999e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  33.4 
 
 
488 aa  201  1.9999999999999998e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  68.79 
 
 
380 aa  193  6e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3024  flagellin domain protein  70.29 
 
 
339 aa  189  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  65.75 
 
 
799 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  59.51 
 
 
391 aa  187  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  67.14 
 
 
327 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  65 
 
 
273 aa  183  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  66.67 
 
 
420 aa  181  2e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2429  flagellin domain-containing protein  67.39 
 
 
713 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  57.89 
 
 
404 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2433  flagellin domain-containing protein  64.29 
 
 
548 aa  179  8e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  65.22 
 
 
272 aa  179  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  65.94 
 
 
936 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  30.65 
 
 
483 aa  172  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  63.04 
 
 
780 aa  172  9e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  62.41 
 
 
387 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  60.56 
 
 
282 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  63.77 
 
 
385 aa  171  3e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  56.13 
 
 
386 aa  171  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  63.97 
 
 
275 aa  169  8e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  62.32 
 
 
272 aa  169  8e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  56.13 
 
 
388 aa  168  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  54.84 
 
 
389 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  59.15 
 
 
387 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  53.95 
 
 
420 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  53.85 
 
 
274 aa  162  1e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  61.03 
 
 
278 aa  160  4e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  58.57 
 
 
383 aa  160  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  58.27 
 
 
376 aa  159  9e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  55.71 
 
 
274 aa  159  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  53.1 
 
 
485 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  52.41 
 
 
484 aa  158  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0662  flagellin domain protein  55.8 
 
 
829 aa  156  7e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128526 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  57.25 
 
 
372 aa  153  5e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  55 
 
 
580 aa  153  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  37.23 
 
 
378 aa  152  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  37.55 
 
 
377 aa  152  1e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  56.52 
 
 
263 aa  152  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  48.45 
 
 
393 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  52.53 
 
 
263 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  53.15 
 
 
492 aa  151  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  51.5 
 
 
265 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  55.07 
 
 
294 aa  151  3e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  47.7 
 
 
467 aa  151  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  37.14 
 
 
377 aa  151  3e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  53.1 
 
 
276 aa  150  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  51.75 
 
 
475 aa  150  4e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  51.05 
 
 
404 aa  150  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  50.6 
 
 
263 aa  150  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  51.75 
 
 
475 aa  150  5e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  39.13 
 
 
469 aa  150  5e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  56.83 
 
 
271 aa  150  5e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.83 
 
 
394 aa  150  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  38.98 
 
 
402 aa  150  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  52.45 
 
 
497 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  52.23 
 
 
262 aa  149  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  43.93 
 
 
609 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  53.9 
 
 
319 aa  148  2.0000000000000003e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  39.08 
 
 
375 aa  148  2.0000000000000003e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  56.12 
 
 
271 aa  148  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  51.28 
 
 
266 aa  149  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  48.02 
 
 
494 aa  148  3e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  50.34 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  38.62 
 
 
377 aa  147  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  55.73 
 
 
271 aa  147  5e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  41.4 
 
 
471 aa  147  6e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  38.98 
 
 
377 aa  145  1e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  47.8 
 
 
377 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1039  flagellin domain protein  50.68 
 
 
278 aa  145  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  54.96 
 
 
271 aa  145  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  36.61 
 
 
378 aa  145  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  51.05 
 
 
492 aa  145  1e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  55.07 
 
 
390 aa  145  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  58.96 
 
 
356 aa  145  2e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  48.28 
 
 
404 aa  144  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  53.52 
 
 
293 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  54.96 
 
 
271 aa  144  3e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  52.82 
 
 
295 aa  144  4e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  38.56 
 
 
377 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  38.56 
 
 
377 aa  144  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  52.14 
 
 
294 aa  144  4e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.41 
 
 
276 aa  143  6e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  39.06 
 
 
388 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  51.05 
 
 
490 aa  143  6e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  48.97 
 
 
376 aa  143  6e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  38.66 
 
 
377 aa  143  7e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  48.08 
 
 
377 aa  143  7e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  47.59 
 
 
492 aa  143  8e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  53.96 
 
 
271 aa  143  8e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  51.43 
 
 
276 aa  143  9e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  51.08 
 
 
319 aa  143  9e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  49.65 
 
 
501 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  50.35 
 
 
472 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  47.47 
 
 
482 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  48.97 
 
 
376 aa  142  9.999999999999999e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>