More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1258 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  100 
 
 
545 aa  1054    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2158  flagellin  62.07 
 
 
579 aa  582  1.0000000000000001e-165  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1716  flagellin  63.65 
 
 
572 aa  563  1.0000000000000001e-159  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.363061 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1053  flagellin  60.79 
 
 
568 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2698  flagellin  57.83 
 
 
585 aa  507  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.132656 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27700  Flagellin  48.17 
 
 
567 aa  390  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  93.71 
 
 
498 aa  325  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2022  putative flagellin  89.44 
 
 
349 aa  316  6e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  82.78 
 
 
505 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1285  phase-1 flagellin  82.78 
 
 
505 aa  304  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.540983  normal  0.0231264 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  60.27 
 
 
502 aa  293  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2114  flagellin  76.19 
 
 
506 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.168497 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  73.85 
 
 
506 aa  283  5.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  71.98 
 
 
493 aa  283  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  67.53 
 
 
422 aa  280  6e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  76.27 
 
 
373 aa  273  5.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  78.74 
 
 
369 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  78.74 
 
 
369 aa  272  1e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  73.12 
 
 
412 aa  269  8.999999999999999e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  69.07 
 
 
398 aa  253  6e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2023  flagellin  80.77 
 
 
160 aa  249  7e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  64.29 
 
 
379 aa  248  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  69.68 
 
 
412 aa  245  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  60.38 
 
 
356 aa  243  9e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  34.81 
 
 
517 aa  217  4e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  34.64 
 
 
516 aa  215  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  65.43 
 
 
288 aa  194  4e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2522  flagellin domain-containing protein  64.67 
 
 
278 aa  192  1e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  47.41 
 
 
609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  53.23 
 
 
405 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  52.25 
 
 
392 aa  182  2e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  55.98 
 
 
395 aa  180  5.999999999999999e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  61.73 
 
 
488 aa  178  2e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  58.64 
 
 
462 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  58.39 
 
 
388 aa  176  9e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  59.24 
 
 
275 aa  173  9e-42  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  57.95 
 
 
486 aa  172  1e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  42.86 
 
 
493 aa  172  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  57.76 
 
 
431 aa  171  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  57.23 
 
 
501 aa  170  5e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  57.14 
 
 
404 aa  170  6e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  53.22 
 
 
497 aa  169  1e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  56.69 
 
 
490 aa  167  4e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  56.52 
 
 
437 aa  167  5e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  55.97 
 
 
506 aa  166  1.0000000000000001e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  47.96 
 
 
279 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  47.81 
 
 
394 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  54.07 
 
 
492 aa  164  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  51.76 
 
 
494 aa  163  7e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  57.89 
 
 
471 aa  162  1e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  47.37 
 
 
393 aa  162  1e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  54.55 
 
 
375 aa  162  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  52.98 
 
 
472 aa  161  3e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  40.93 
 
 
389 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  55.35 
 
 
492 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  55.43 
 
 
272 aa  160  5e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  47.94 
 
 
319 aa  160  8e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  54.04 
 
 
384 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  54.04 
 
 
384 aa  159  9e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  53.37 
 
 
283 aa  159  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.15 
 
 
276 aa  159  1e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  52.2 
 
 
383 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  52.94 
 
 
482 aa  159  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  48.13 
 
 
271 aa  159  1e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  50.91 
 
 
275 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  54.66 
 
 
404 aa  159  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  48.45 
 
 
319 aa  159  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  48.13 
 
 
271 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  52.35 
 
 
481 aa  157  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  50.27 
 
 
272 aa  158  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  54.09 
 
 
469 aa  157  4e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  54.61 
 
 
279 aa  157  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  54.88 
 
 
390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  47.59 
 
 
271 aa  157  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  54.88 
 
 
390 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  49.75 
 
 
271 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  52.35 
 
 
467 aa  156  1e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  49.75 
 
 
271 aa  155  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  50.94 
 
 
388 aa  156  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  46.49 
 
 
271 aa  155  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  55.92 
 
 
287 aa  155  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  39.76 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  38.96 
 
 
377 aa  154  5e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  53.02 
 
 
278 aa  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  46.35 
 
 
420 aa  153  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  49.25 
 
 
271 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  49.25 
 
 
271 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  47.65 
 
 
580 aa  152  1e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  50.59 
 
 
468 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  48.9 
 
 
270 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  45.74 
 
 
687 aa  152  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  53.09 
 
 
294 aa  152  2e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  47.64 
 
 
488 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  46.49 
 
 
271 aa  151  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>