More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1488 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1488  flagellin  100 
 
 		 517 aa  984    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  93.8 
 
 		 516 aa  875    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  48.76 
 
 		 468 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  48.65 
 
 		 484 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  48.08 
 
 		 467 aa  375  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  47.98 
 
 		 485 aa  368  1e-100  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  48.39 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  46.39 
 
 		 488 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  47.42 
 
 		 492 aa  357  3.9999999999999996e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  46.14 
 
 		 482 aa  349  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  45.28 
 
 		 481 aa  342  1e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  44.53 
 
 		 483 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  43.48 
 
 		 475 aa  317  3e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  43.48 
 
 		 475 aa  316  7e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  43.13 
 
 		 493 aa  309  9e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  41.83 
 
 		 494 aa  293  4e-78  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  42.08 
 
 		 501 aa  289  9e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  41.51 
 
 		 497 aa  288  2e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  40.04 
 
 		 506 aa  274  3e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  38.4 
 
 		 492 aa  266  8e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  39.58 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  68.5 
 
 		 394 aa  259  1e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  39.46 
 
 		 405 aa  258  2e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  56.78 
 
 		 393 aa  256  7e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  40.04 
 
 		 472 aa  254  3e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  38.73 
 
 		 488 aa  248  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  37.19 
 
 		 498 aa  239  8e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  36.55 
 
 		 506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  36.55 
 
 		 506 aa  236  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2912  flagellin  36.18 
 
 		 506 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0214026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  36.43 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  36.07 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  36.03 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  35.9 
 
 		 502 aa  224  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  36.97 
 
 		 469 aa  223  4e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  67.47 
 
 		 387 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  60.2 
 
 		 402 aa  218  2e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  61.05 
 
 		 375 aa  218  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  65.66 
 
 		 687 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  66.87 
 
 		 377 aa  217  5e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1258  flagellin  35.4 
 
 		 545 aa  216  9e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0516151 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  62.36 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  61.8 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  60.99 
 
 		 377 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  62.36 
 
 		 377 aa  213  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  32.65 
 
 		 502 aa  211  3e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  54.13 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  54.13 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  60.99 
 
 		 377 aa  210  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  53.02 
 
 		 377 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  54.08 
 
 		 376 aa  209  8e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  63.1 
 
 		 379 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  52.14 
 
 		 378 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  63.91 
 
 		 379 aa  208  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1723  flagellin domain protein  35.92 
 
 		 498 aa  207  4e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.774515  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  68.79 
 
 		 490 aa  207  4e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  47.02 
 
 		 377 aa  206  6e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  64.42 
 
 		 377 aa  206  9e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  54.64 
 
 		 385 aa  206  1e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  43.01 
 
 		 609 aa  204  4e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  62.73 
 
 		 378 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  60.71 
 
 		 384 aa  200  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.07 
 
 		 276 aa  199  9e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  33.78 
 
 		 420 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  64.42 
 
 		 294 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  56.02 
 
 		 272 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  56.02 
 
 		 272 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  64.38 
 
 		 492 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  44.81 
 
 		 462 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  60.12 
 
 		 384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  56.32 
 
 		 271 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  56.98 
 
 		 270 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  56.32 
 
 		 271 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  59.41 
 
 		 271 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  59.41 
 
 		 271 aa  196  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  36.16 
 
 		 471 aa  194  4e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  31.67 
 
 		 513 aa  193  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  58.14 
 
 		 271 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  58.14 
 
 		 271 aa  193  8e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  60.95 
 
 		 404 aa  192  1e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  62.73 
 
 		 294 aa  192  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  56.99 
 
 		 282 aa  190  7e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  61.88 
 
 		 492 aa  189  1e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  59.75 
 
 		 404 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  62.11 
 
 		 319 aa  187  6e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  58.39 
 
 		 580 aa  186  8e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  56.47 
 
 		 273 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  58.02 
 
 		 273 aa  184  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  60.25 
 
 		 587 aa  183  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  44.81 
 
 		 388 aa  183  7e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  55.93 
 
 		 274 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  62.73 
 
 		 274 aa  182  2e-44  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  55.36 
 
 		 275 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  55.37 
 
 		 274 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  54.76 
 
 		 275 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  57.14 
 
 		 272 aa  179  8e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  61.84 
 
 		 283 aa  179  1e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.5 
 
 		 280 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  55.69 
 
 		 273 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  57.32 
 
 		 273 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>