More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1357 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 272 aa  532  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  89.71 
 
 		 273 aa  477  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  86.03 
 
 		 272 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  85.29 
 
 		 272 aa  454  1e-127  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  85.29 
 
 		 273 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  85.66 
 
 		 272 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  84.67 
 
 		 274 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  84.56 
 
 		 273 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  84.56 
 
 		 273 aa  447  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  84.56 
 
 		 273 aa  448  1e-125  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  83.94 
 
 		 274 aa  449  1e-125  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  84.93 
 
 		 272 aa  443  1e-123  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  82.72 
 
 		 273 aa  443  1e-123  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  82.72 
 
 		 272 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  81.75 
 
 		 275 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  81.75 
 
 		 275 aa  437  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  80.88 
 
 		 273 aa  434  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  84.93 
 
 		 273 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  80.15 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  83.46 
 
 		 271 aa  421  1e-117  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  80.15 
 
 		 271 aa  422  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  80.15 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  83.46 
 
 		 270 aa  418  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  80.15 
 
 		 271 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  77.21 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  77.21 
 
 		 272 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  78.68 
 
 		 271 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  78.68 
 
 		 271 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  52.73 
 
 		 274 aa  258  8e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  50.73 
 
 		 276 aa  256  4e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  52 
 
 		 274 aa  254  9e-67  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.69 
 
 		 280 aa  253  3e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  48.47 
 
 		 294 aa  248  9e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  51.26 
 
 		 271 aa  238  5.999999999999999e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  51.26 
 
 		 271 aa  238  8e-62  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  49.26 
 
 		 272 aa  237  2e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  48.47 
 
 		 294 aa  237  2e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  50.9 
 
 		 271 aa  236  3e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  48.19 
 
 		 276 aa  235  6e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  48.21 
 
 		 279 aa  233  3e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  50.55 
 
 		 271 aa  233  3e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  48.21 
 
 		 279 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  45.31 
 
 		 319 aa  228  6e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  47.33 
 
 		 272 aa  228  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 		 271 aa  226  3e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  45 
 
 		 319 aa  225  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  48.73 
 
 		 271 aa  225  5.0000000000000005e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 		 271 aa  225  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  47.14 
 
 		 278 aa  225  7e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  48.01 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  51.24 
 
 		 283 aa  224  1e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  48.06 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  45.94 
 
 		 283 aa  220  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  45.93 
 
 		 273 aa  220  1.9999999999999999e-56  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  44.66 
 
 		 272 aa  218  6e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  52.28 
 
 		 283 aa  218  7e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  47.92 
 
 		 289 aa  218  8.999999999999998e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  45.93 
 
 		 272 aa  217  1e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  48.19 
 
 		 276 aa  217  2e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  48.23 
 
 		 282 aa  216  2e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  46.69 
 
 		 263 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  46.52 
 
 		 262 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  44.77 
 
 		 275 aa  215  5e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  45.45 
 
 		 286 aa  214  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  46.72 
 
 		 281 aa  211  7e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  47.08 
 
 		 263 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  47.52 
 
 		 282 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  44.71 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  43.3 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  47.37 
 
 		 285 aa  209  3e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  45.96 
 
 		 278 aa  209  5e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  45.09 
 
 		 263 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  44.89 
 
 		 281 aa  207  1e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  43.42 
 
 		 282 aa  205  5e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  44.03 
 
 		 272 aa  205  6e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  42.34 
 
 		 273 aa  205  7e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  41.84 
 
 		 295 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1283  flagellin domain-containing protein  45.05 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.87042 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  45 
 
 		 281 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  46.79 
 
 		 377 aa  203  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  63.91 
 
 		 484 aa  201  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  46.04 
 
 		 314 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  46.15 
 
 		 266 aa  201  9.999999999999999e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  50.18 
 
 		 284 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  63.31 
 
 		 485 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  45.45 
 
 		 274 aa  200  1.9999999999999998e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  44.95 
 
 		 287 aa  200  3e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  65.43 
 
 		 468 aa  198  9e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  44.36 
 
 		 265 aa  198  9e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  61.9 
 
 		 481 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  37.35 
 
 		 327 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  60.23 
 
 		 467 aa  195  7e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3957  flagellin domain-containing protein  44.03 
 
 		 267 aa  195  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  52.07 
 
 		 394 aa  194  9e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  40.26 
 
 		 304 aa  194  9e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3956  flagellin domain-containing protein  42.65 
 
 		 272 aa  194  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  41.55 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1284  flagellin domain-containing protein  43.87 
 
 		 273 aa  192  6e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.922847 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  44.48 
 
 		 279 aa  191  9e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>