More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1270 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  100 
 
 		 485 aa  931    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  97.11 
 
 		 484 aa  853    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  55.21 
 
 		 481 aa  452  1.0000000000000001e-126  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  54.71 
 
 		 482 aa  451  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  56.37 
 
 		 468 aa  435  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  54.81 
 
 		 394 aa  429  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  54.89 
 
 		 467 aa  424  1e-117  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  53.89 
 
 		 393 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  49.4 
 
 		 488 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  49.33 
 
 		 516 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  48.37 
 
 		 517 aa  379  1e-104  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  48.92 
 
 		 492 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  44.87 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  44.14 
 
 		 492 aa  336  5.999999999999999e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  44.49 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  43.9 
 
 		 475 aa  332  1e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  40.51 
 
 		 497 aa  315  8e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  41.01 
 
 		 493 aa  307  3e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  40.93 
 
 		 506 aa  298  1e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  42.14 
 
 		 494 aa  297  3e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  40.94 
 
 		 501 aa  295  1e-78  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  42.26 
 
 		 492 aa  292  8e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  40.82 
 
 		 490 aa  290  3e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  42.32 
 
 		 492 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0069  flagellar filament protein  38.23 
 
 		 493 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1705  flagellin domain-containing protein  38.03 
 
 		 493 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000174414 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  39.09 
 
 		 498 aa  278  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  39.84 
 
 		 405 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  39.71 
 
 		 395 aa  262  1e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  38.84 
 
 		 388 aa  259  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  39.63 
 
 		 471 aa  257  4e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  40.4 
 
 		 462 aa  257  4e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  39.31 
 
 		 472 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  37.07 
 
 		 492 aa  253  6e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  37.38 
 
 		 488 aa  250  3e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  38.24 
 
 		 486 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  37.14 
 
 		 420 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  51.94 
 
 		 687 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  67.86 
 
 		 379 aa  230  4e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  36.76 
 
 		 404 aa  229  7e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2173  flagellin  37.83 
 
 		 493 aa  227  3e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.569586  hitchhiker  0.00540488 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  69.51 
 
 		 377 aa  226  5.0000000000000005e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  35.56 
 
 		 469 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  68.29 
 
 		 375 aa  226  5.0000000000000005e-58  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  43.18 
 
 		 376 aa  224  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  62.98 
 
 		 387 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  68.9 
 
 		 377 aa  223  6e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  35 
 
 		 502 aa  223  6e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1635  flagellin B  35.02 
 
 		 519 aa  223  6e-57  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  63.89 
 
 		 377 aa  223  8e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  67.68 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  63.89 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  67.68 
 
 		 377 aa  222  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  68.32 
 
 		 402 aa  222  9.999999999999999e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  67.68 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  66.46 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  68.05 
 
 		 379 aa  219  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  65.85 
 
 		 377 aa  219  7e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1636  flagellin B  34.71 
 
 		 518 aa  219  7.999999999999999e-56  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1162  phase-1 flagellin  35 
 
 		 505 aa  219  8.999999999999998e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.287504  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  65.29 
 
 		 271 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  65.29 
 
 		 271 aa  219  1e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  68.32 
 
 		 376 aa  218  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  64.12 
 
 		 272 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  64.12 
 
 		 272 aa  216  7e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  63.07 
 
 		 271 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  63.07 
 
 		 271 aa  216  9e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  59.59 
 
 		 271 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  59.59 
 
 		 271 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  64.02 
 
 		 378 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  63.1 
 
 		 384 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  62.05 
 
 		 385 aa  211  3e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  60.34 
 
 		 270 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2120  flagellin  36.33 
 
 		 502 aa  210  6e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000196793 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  62.5 
 
 		 384 aa  209  7e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  61.45 
 
 		 378 aa  208  2e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  64.12 
 
 		 274 aa  207  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  67.07 
 
 		 376 aa  207  3e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  63.47 
 
 		 275 aa  207  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  62.87 
 
 		 275 aa  206  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  64.6 
 
 		 294 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2229  flagellin domain protein  36.67 
 
 		 481 aa  204  2e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  62.35 
 
 		 274 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  56.57 
 
 		 276 aa  204  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  64.2 
 
 		 273 aa  203  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  63.58 
 
 		 273 aa  203  6e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0568  flagellin B  33.2 
 
 		 496 aa  202  9e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  64.02 
 
 		 294 aa  202  9.999999999999999e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  62.8 
 
 		 273 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  41.74 
 
 		 580 aa  201  3e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  63.31 
 
 		 272 aa  201  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  33.62 
 
 		 404 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  62.35 
 
 		 273 aa  200  5e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  63.41 
 
 		 272 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  58.33 
 
 		 271 aa  199  9e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  42.03 
 
 		 609 aa  199  9e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  62.35 
 
 		 273 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  59.32 
 
 		 272 aa  197  3e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  61.96 
 
 		 272 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  61.08 
 
 		 273 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>