More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3238 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3238  flagellin  100 
 
 
273 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  89.34 
 
 
272 aa  475  1e-133  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  87.5 
 
 
272 aa  474  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  90.11 
 
 
273 aa  467  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  86.4 
 
 
272 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  86.08 
 
 
273 aa  462  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  85.71 
 
 
273 aa  462  1e-129  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  84.62 
 
 
273 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  84.56 
 
 
272 aa  447  1e-125  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  82.72 
 
 
272 aa  449  1e-125  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  83.88 
 
 
273 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  84.62 
 
 
273 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  82.78 
 
 
273 aa  442  1e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  82.72 
 
 
272 aa  443  1e-123  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  80.73 
 
 
275 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  80.29 
 
 
274 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  80.36 
 
 
275 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  79.93 
 
 
274 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  82.35 
 
 
271 aa  420  1e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  83.09 
 
 
270 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  76.19 
 
 
272 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  78.31 
 
 
271 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  76.19 
 
 
272 aa  411  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  78.31 
 
 
271 aa  412  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  76.47 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  76.47 
 
 
271 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  76.47 
 
 
271 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  76.47 
 
 
271 aa  403  1e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  51.27 
 
 
276 aa  262  4e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  54.29 
 
 
280 aa  255  6e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  48.65 
 
 
294 aa  252  5.000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  48.99 
 
 
294 aa  251  1e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  48.53 
 
 
272 aa  241  1e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  49.64 
 
 
274 aa  240  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  49.1 
 
 
279 aa  240  2e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  48.19 
 
 
276 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  48.75 
 
 
279 aa  236  3e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  48.55 
 
 
274 aa  233  3e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  47.31 
 
 
278 aa  229  3e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  49.47 
 
 
283 aa  229  4e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  43.61 
 
 
319 aa  228  7e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  47.33 
 
 
272 aa  227  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  50.53 
 
 
283 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  43.12 
 
 
319 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  48.96 
 
 
289 aa  224  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  46.18 
 
 
271 aa  224  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  48.28 
 
 
282 aa  223  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  46.18 
 
 
271 aa  223  2e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  46.21 
 
 
277 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  45.82 
 
 
271 aa  221  7e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  49.28 
 
 
276 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  47.78 
 
 
290 aa  221  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  45.14 
 
 
288 aa  221  9.999999999999999e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  48.04 
 
 
278 aa  220  1.9999999999999999e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  47.45 
 
 
263 aa  219  3e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  46.85 
 
 
286 aa  218  7.999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  49.29 
 
 
282 aa  218  1e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  46.91 
 
 
271 aa  217  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  45.61 
 
 
287 aa  214  8e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  44.65 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  46.15 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  46.15 
 
 
271 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  43.51 
 
 
272 aa  214  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  46.18 
 
 
271 aa  213  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  45.82 
 
 
271 aa  212  4.9999999999999996e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  46.9 
 
 
285 aa  211  1e-53  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  43.26 
 
 
282 aa  210  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  49.3 
 
 
283 aa  209  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  45.99 
 
 
263 aa  208  7e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  44.64 
 
 
281 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  43.36 
 
 
287 aa  207  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  44.81 
 
 
281 aa  207  2e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  43.17 
 
 
273 aa  206  2e-52  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  43.66 
 
 
272 aa  206  3e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  45.59 
 
 
263 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  43.01 
 
 
281 aa  206  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  45.59 
 
 
266 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  42.6 
 
 
275 aa  205  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  44.85 
 
 
262 aa  205  6e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  44.22 
 
 
295 aa  204  1e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  64.5 
 
 
468 aa  201  8e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  45.65 
 
 
274 aa  201  9.999999999999999e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  62.8 
 
 
485 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  63.41 
 
 
484 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  42.35 
 
 
278 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  42.86 
 
 
279 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  41.94 
 
 
278 aa  199  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  41.99 
 
 
278 aa  199  6e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  60.61 
 
 
481 aa  198  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  42.5 
 
 
279 aa  198  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  43.27 
 
 
273 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  43.8 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  45.59 
 
 
265 aa  197  1.0000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  40.92 
 
 
304 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  42.14 
 
 
279 aa  197  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  45.61 
 
 
284 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  41.84 
 
 
295 aa  196  3e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  62.13 
 
 
467 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  41.5 
 
 
293 aa  195  8.000000000000001e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  41.96 
 
 
256 aa  194  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>