More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU3038 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  100 
 
 
276 aa  530  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  66.3 
 
 
314 aa  334  9e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4095  flagellin domain-containing protein  63.9 
 
 
276 aa  307  1.0000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  57.76 
 
 
278 aa  292  4e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  57.4 
 
 
278 aa  291  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  55.96 
 
 
279 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  55.96 
 
 
279 aa  288  7e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  56.68 
 
 
278 aa  287  2e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  57.25 
 
 
272 aa  286  2e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  54.87 
 
 
279 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  55.8 
 
 
263 aa  281  1e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  55.6 
 
 
263 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  54.12 
 
 
279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.71 
 
 
276 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  51.24 
 
 
282 aa  271  6e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  53.19 
 
 
279 aa  271  1e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  55.12 
 
 
277 aa  269  2.9999999999999997e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  54.18 
 
 
278 aa  269  2.9999999999999997e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  54.71 
 
 
266 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  52.2 
 
 
295 aa  266  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  57.09 
 
 
271 aa  264  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  57.09 
 
 
271 aa  263  2e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  56.73 
 
 
271 aa  263  3e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  55.99 
 
 
280 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  53.62 
 
 
263 aa  258  6e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  50.34 
 
 
293 aa  258  8e-68  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  53.99 
 
 
262 aa  257  1e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  51.92 
 
 
283 aa  256  3e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  53.62 
 
 
265 aa  256  3e-67  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  50.51 
 
 
295 aa  256  4e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  53.99 
 
 
271 aa  251  9.000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2950  flagellin domain protein  49.32 
 
 
296 aa  251  1e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0676667 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  50.54 
 
 
275 aa  250  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  48.69 
 
 
304 aa  248  8e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1622  flagellin domain protein  49.49 
 
 
295 aa  247  1e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  52.54 
 
 
271 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  53.26 
 
 
271 aa  246  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  50.35 
 
 
286 aa  246  2e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  50.18 
 
 
273 aa  245  4.9999999999999997e-64  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1502  flagellin  48.14 
 
 
297 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0786  flagellin domain protein  48.81 
 
 
295 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.130043 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  52.88 
 
 
274 aa  245  6.999999999999999e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  53.26 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  53.26 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  50.68 
 
 
290 aa  243  1.9999999999999999e-63  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0244  flagellin domain protein  47.3 
 
 
298 aa  243  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0481639 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  49.3 
 
 
287 aa  243  3e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  50.18 
 
 
272 aa  243  3e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1501  flagellin  47.8 
 
 
297 aa  242  3.9999999999999997e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.888195  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1709  flagellin  47.8 
 
 
297 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00621943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  45.32 
 
 
327 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2430  flagellin domain protein  45.28 
 
 
308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1147  flagellin domain-containing protein  46.44 
 
 
297 aa  239  2.9999999999999997e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.271109  normal  0.29908 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  47.14 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2385  flagellin domain protein  46.65 
 
 
315 aa  238  9e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  49.66 
 
 
294 aa  238  1e-61  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0790  flagellin domain-containing protein  46.44 
 
 
297 aa  238  1e-61  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.585349  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  50.7 
 
 
285 aa  236  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  52.13 
 
 
278 aa  236  3e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  51.77 
 
 
282 aa  236  4e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1570  flagellin, putative  47.33 
 
 
297 aa  235  6e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.940004  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  50.36 
 
 
275 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  50 
 
 
273 aa  234  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  52.63 
 
 
283 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  50 
 
 
275 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
272 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1028  flagellin domain protein  45.51 
 
 
302 aa  233  3e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  49.64 
 
 
274 aa  231  9e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  49.81 
 
 
272 aa  231  1e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  49.45 
 
 
271 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  49.45 
 
 
271 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  51.6 
 
 
274 aa  229  3e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  49.43 
 
 
272 aa  229  3e-59  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 
271 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  49.09 
 
 
271 aa  228  6e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  49.28 
 
 
274 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  47.99 
 
 
275 aa  228  1e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  49.29 
 
 
282 aa  226  4e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  47.47 
 
 
294 aa  226  4e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  49.1 
 
 
272 aa  225  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1638  flagellin domain-containing protein  46.28 
 
 
298 aa  224  8e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.588406  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1004  flagellar filament core protein  43.21 
 
 
286 aa  224  1e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  50 
 
 
273 aa  224  1e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  48.36 
 
 
271 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  48.36 
 
 
271 aa  224  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2282  flagellin domain protein  47.6 
 
 
295 aa  223  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.581446  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2280  flagellin domain protein  48.34 
 
 
295 aa  223  3e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  48.42 
 
 
288 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  46.67 
 
 
281 aa  222  4e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  48.55 
 
 
273 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2938  flagellin-like protein  48.35 
 
 
272 aa  221  9.999999999999999e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.843721 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  48.55 
 
 
272 aa  220  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  47.27 
 
 
274 aa  220  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  48.01 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  48.74 
 
 
272 aa  219  3.9999999999999997e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  45.31 
 
 
319 aa  218  7.999999999999999e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  47.1 
 
 
272 aa  217  1e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  50.72 
 
 
276 aa  218  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  48.19 
 
 
273 aa  218  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>