More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3088 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_3088  flagellin-like  100 
 
 
274 aa  529  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  89.42 
 
 
274 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3087  flagellin-like  72.99 
 
 
276 aa  375  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  55.78 
 
 
294 aa  300  2e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  55.63 
 
 
294 aa  295  6e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  50.94 
 
 
319 aa  283  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  50.47 
 
 
319 aa  277  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  54.01 
 
 
271 aa  272  4.0000000000000004e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  53.65 
 
 
271 aa  271  8.000000000000001e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  53.65 
 
 
271 aa  270  2e-71  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.88 
 
 
276 aa  267  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  52.14 
 
 
280 aa  261  1e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  53.79 
 
 
272 aa  259  2e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  53.03 
 
 
272 aa  258  7e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  51.28 
 
 
271 aa  256  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1357  flagellin domain-containing protein  52 
 
 
272 aa  254  9e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  52.36 
 
 
272 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  52.36 
 
 
272 aa  253  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  50.92 
 
 
271 aa  252  4.0000000000000004e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  50.55 
 
 
271 aa  250  2e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  51.82 
 
 
271 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3076  flagellin  51.45 
 
 
273 aa  247  1e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  51.82 
 
 
271 aa  247  1e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  51.82 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  51.82 
 
 
271 aa  244  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3075  flagellin  50.55 
 
 
272 aa  243  1.9999999999999999e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  47.99 
 
 
275 aa  243  3e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1609  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
272 aa  241  6e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  50.73 
 
 
271 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3237  flagellin  50.55 
 
 
272 aa  241  7e-63  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  50.73 
 
 
271 aa  241  7e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1314  flagellin-like protein  50.36 
 
 
273 aa  241  7.999999999999999e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  49.27 
 
 
272 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2586  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2307  flagellin-like protein  48.91 
 
 
273 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1427  flagellin domain protein  49.28 
 
 
275 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1315  flagellin-like protein  49.45 
 
 
272 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2936  flagellin domain-containing protein  49.28 
 
 
275 aa  238  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1428  flagellin domain protein  49.45 
 
 
274 aa  238  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1356  flagellin domain-containing protein  48.91 
 
 
273 aa  237  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1332  flagellin domain-containing protein  49.28 
 
 
273 aa  235  6e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.344872  normal  0.0535715 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2585  flagellin domain-containing protein  50.54 
 
 
271 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1333  flagellin domain-containing protein  50.36 
 
 
270 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.885776  normal  0.0549852 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1608  flagellin domain-containing protein  50 
 
 
273 aa  233  2.0000000000000002e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.649774  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3238  flagellin  48.55 
 
 
273 aa  233  3e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  45.82 
 
 
272 aa  233  3e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  47.62 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  47.62 
 
 
271 aa  232  4.0000000000000004e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104757 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3813  flagellin domain-containing protein  50.71 
 
 
279 aa  232  4.0000000000000004e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2935  flagellin domain-containing protein  48.73 
 
 
274 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0622  flagellin domain protein  49.65 
 
 
287 aa  230  2e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2306  flagellin-like protein  48.36 
 
 
272 aa  229  3e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.228125 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  48.72 
 
 
262 aa  228  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3814  flagellin domain-containing protein  49.82 
 
 
278 aa  227  1e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  49.64 
 
 
265 aa  226  4e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0630  flagellin domain protein  47.78 
 
 
281 aa  225  6e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.892831  hitchhiker  0.00000486769 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3812  flagellin domain-containing protein  49.29 
 
 
279 aa  224  8e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  44.93 
 
 
273 aa  224  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  51.6 
 
 
276 aa  224  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  49.28 
 
 
263 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1489  flagellin  48.41 
 
 
283 aa  223  3e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  44.72 
 
 
282 aa  223  3e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  45.92 
 
 
295 aa  220  1.9999999999999999e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  46.78 
 
 
295 aa  219  3e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  40.8 
 
 
327 aa  220  3e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  44.86 
 
 
293 aa  218  6e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1949  flagellin  48.76 
 
 
282 aa  218  7e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372231  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0617  flagellin domain-containing protein  48.42 
 
 
283 aa  218  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  44.88 
 
 
304 aa  218  8.999999999999998e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2887  flagellin domain protein  47.74 
 
 
278 aa  218  8.999999999999998e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  48.36 
 
 
263 aa  218  8.999999999999998e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  48.18 
 
 
263 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0077  flagellin domain-containing protein  47.64 
 
 
274 aa  217  2e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.104255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  47.99 
 
 
266 aa  216  5e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0784  flagellin, C-terminal:flagellin, N-terminal  45.79 
 
 
273 aa  215  5e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00605686 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0631  flagellin domain protein  45.93 
 
 
281 aa  215  5e-55  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000536021 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0062  flagellin domain-containing protein  47.08 
 
 
256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  47.1 
 
 
277 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3466  flagellin  47.33 
 
 
282 aa  212  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1009  flagellin domain-containing protein  46.53 
 
 
286 aa  211  1e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2570  flagellin domain protein  47.02 
 
 
288 aa  210  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1527  flagellin  46.18 
 
 
283 aa  210  3e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0071  flagellin domain-containing protein  44.87 
 
 
377 aa  209  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0550639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0442  flagellin-like  47.27 
 
 
314 aa  209  4e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2611  flagellin domain protein  45.16 
 
 
278 aa  207  1e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000409959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1342  flagellin-like  45.16 
 
 
278 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0308098  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2515  flagellin domain protein  45.16 
 
 
278 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0378301  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0618  flagellin domain-containing protein  45.55 
 
 
290 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1581  flagellin domain protein  44.85 
 
 
275 aa  206  5e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  43.57 
 
 
278 aa  205  5e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1339  flagellin-like  45.52 
 
 
279 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000247158  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2519  flagellin domain protein  44.6 
 
 
279 aa  205  6e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000201488  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1039  flagellin domain protein  41.28 
 
 
278 aa  205  7e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2615  flagellin domain protein  44.24 
 
 
279 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000113225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1986  flagellin-like protein  47 
 
 
285 aa  204  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.462318  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3703  flagellin  46.83 
 
 
284 aa  203  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1010  flagellin domain-containing protein  44.1 
 
 
287 aa  202  5e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04961  hypothetical protein  43.1 
 
 
289 aa  201  8e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001174  flagellin protein flaA  42.76 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2989  flagellin  43.91 
 
 
272 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000626303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>