More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2202 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  100 
 
 		 580 aa  1128    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2200  flagellin FliC  60.34 
 
 		 587 aa  613  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1658  flagellin domain-containing protein  35.38 
 
 		 498 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  42.27 
 
 		 497 aa  217  5e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  58.73 
 
 		 475 aa  216  7e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  58.73 
 
 		 475 aa  216  9.999999999999999e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2947  flagellin  34.35 
 
 		 506 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.46563e-22 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2966  flagellin  34.35 
 
 		 506 aa  213  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000177141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0059  flagellin domain-containing protein  63.53 
 
 		 272 aa  208  2e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.202005 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2592  flagellin domain-containing protein  60.59 
 
 		 494 aa  201  3e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.539107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  42.22 
 
 		 609 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  60.59 
 
 		 492 aa  200  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  54.55 
 
 		 485 aa  199  7.999999999999999e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0630  flagellin-like  57.51 
 
 		 472 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.918791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0082  flagellin domain-containing protein  57.44 
 
 		 272 aa  198  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.171449 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  53.48 
 
 		 484 aa  198  3e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  58.24 
 
 		 492 aa  197  6e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  52.31 
 
 		 387 aa  196  1e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3570  flagellin domain-containing protein  45.42 
 
 		 294 aa  196  1e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  54.05 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  55.43 
 
 		 377 aa  195  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0698  flagellin domain-containing protein  41.03 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.911513  normal  0.224965 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50290  flagellin type B  41.14 
 
 		 488 aa  195  2e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00503074  decreased coverage  0.000184596 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  57.8 
 
 		 276 aa  194  3e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  58.24 
 
 		 501 aa  194  4e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3571  flagellin domain-containing protein  56.48 
 
 		 294 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4401  flagellin domain-containing protein  58.82 
 
 		 492 aa  192  2e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  58.76 
 
 		 462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0631  flagellin-like  56.32 
 
 		 471 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  56.38 
 
 		 405 aa  191  2.9999999999999997e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  54.91 
 
 		 379 aa  190  5e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  62.42 
 
 		 490 aa  190  5e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  40.29 
 
 		 492 aa  190  8e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  57.89 
 
 		 388 aa  189  8e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  56.14 
 
 		 481 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1490  flagellin  58.39 
 
 		 516 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3087  flagellin domain protein  58.24 
 
 		 493 aa  189  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  53.76 
 
 		 393 aa  188  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1114  flagellin/flagellar hook-associated protein  56.99 
 
 		 280 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4398  flagellin domain-containing protein  60.51 
 
 		 506 aa  187  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.308154  normal  0.749909 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  53.71 
 
 		 375 aa  186  7e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  53.23 
 
 		 394 aa  186  9e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0700  flagellin domain-containing protein  61.25 
 
 		 486 aa  186  1.0000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.255578 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  58.39 
 
 		 517 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  49.56 
 
 		 431 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  54.97 
 
 		 482 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  58.13 
 
 		 392 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  55.68 
 
 		 395 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  44.44 
 
 		 402 aa  184  5.0000000000000004e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  54.71 
 
 		 468 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0506  flagellin domain-containing protein  61.15 
 
 		 492 aa  183  7e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  48.31 
 
 		 404 aa  183  7e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  54.12 
 
 		 467 aa  183  7e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  50.75 
 
 		 276 aa  182  1e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1039  flagellin domain protein  49 
 
 		 278 aa  182  1e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0072  flagellin domain-containing protein  53.16 
 
 		 271 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18333 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3077  flagellin domain-containing protein  53.53 
 
 		 271 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.100619  normal  0.484151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2945  flagellin domain-containing protein  53.53 
 
 		 271 aa  182  1e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  45.66 
 
 		 378 aa  182  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0065  flagellin domain-containing protein  52.63 
 
 		 271 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.028485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0070  flagellin domain-containing protein  52.11 
 
 		 271 aa  182  2e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0971133 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0507  flagellin domain-containing protein  57.14 
 
 		 469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0064  flagellin domain-containing protein  52.11 
 
 		 271 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0289914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0073  flagellin domain-containing protein  52.63 
 
 		 271 aa  181  4e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.18595 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0066  flagellin domain-containing protein  52.63 
 
 		 271 aa  180  4.999999999999999e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0569033 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  52.38 
 
 		 319 aa  180  7e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2948  flagellin domain-containing protein  49.48 
 
 		 271 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3084  flagellin domain-containing protein  49.48 
 
 		 271 aa  180  7e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.469407  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  54.29 
 
 		 376 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  54.39 
 
 		 420 aa  179  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3085  flagellin-like  54.79 
 
 		 274 aa  179  1e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  51.35 
 
 		 375 aa  179  1e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  52 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  52 
 
 		 376 aa  178  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  43.98 
 
 		 377 aa  178  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  56.05 
 
 		 404 aa  177  4e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2951  flagellin domain-containing protein  47.52 
 
 		 272 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3089  flagellin domain-containing protein  47.52 
 
 		 272 aa  176  7e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  52.91 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  52.91 
 
 		 384 aa  176  8e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  54.72 
 
 		 379 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  52 
 
 		 377 aa  176  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1448  flagellin domain protein  57.23 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.424798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  51.48 
 
 		 377 aa  176  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  52.57 
 
 		 377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  52.57 
 
 		 377 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  51.32 
 
 		 319 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2950  flagellin domain-containing protein  47.94 
 
 		 271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3088  flagellin domain-containing protein  47.94 
 
 		 271 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3939  flagellin domain-containing protein  52.35 
 
 		 483 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.484456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  52.66 
 
 		 272 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  53.89 
 
 		 380 aa  174  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  51.43 
 
 		 378 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  50.54 
 
 		 327 aa  173  7.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4378  flagellin FliC  49.71 
 
 		 687 aa  173  9e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  52 
 
 		 377 aa  173  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  51.85 
 
 		 389 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  50.93 
 
 		 384 aa  171  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0068  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 271 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0535962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0069  flagellin domain-containing protein  50 
 
 		 271 aa  171  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104757 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>