More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2354 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  100 
 
 		 386 aa  754    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  57.47 
 
 		 376 aa  363  2e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  50.74 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  46.31 
 
 		 380 aa  278  1e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2998  flagellin domain protein  48.38 
 
 		 391 aa  273  5.000000000000001e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055355 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  43.36 
 
 		 387 aa  266  4e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  41.63 
 
 		 389 aa  266  4e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  42.96 
 
 		 383 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  43.38 
 
 		 391 aa  259  5.0000000000000005e-68  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  43.89 
 
 		 387 aa  256  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  41.73 
 
 		 388 aa  256  5e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0834  flagellin domain-containing protein  45.35 
 
 		 399 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.9933 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  42.2 
 
 		 420 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  41.85 
 
 		 386 aa  253  4.0000000000000004e-66  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  42.39 
 
 		 387 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  41.67 
 
 		 372 aa  243  5e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  42.39 
 
 		 327 aa  243  6e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  43.5 
 
 		 393 aa  237  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1337  flagellin-like  45.32 
 
 		 388 aa  236  4e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  43.5 
 
 		 394 aa  235  8e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  40.24 
 
 		 404 aa  235  9e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  40.72 
 
 		 404 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  41.18 
 
 		 405 aa  235  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  41.37 
 
 		 377 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  43.49 
 
 		 385 aa  232  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1779  flagellin  40.55 
 
 		 377 aa  229  4e-59  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000663504  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  41.58 
 
 		 392 aa  229  5e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  41.48 
 
 		 379 aa  227  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  38.74 
 
 		 420 aa  227  3e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  39.21 
 
 		 377 aa  226  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2319  flagellin  39.34 
 
 		 402 aa  223  4.9999999999999996e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  39.86 
 
 		 395 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  39.71 
 
 		 404 aa  223  6e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  40.15 
 
 		 379 aa  222  7e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  39.55 
 
 		 377 aa  222  8e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  37.45 
 
 		 497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  38.64 
 
 		 377 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  38.56 
 
 		 377 aa  219  5e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2325  flagellin  40.35 
 
 		 377 aa  217  2.9999999999999998e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03171  flagellin  39.36 
 
 		 376 aa  216  5.9999999999999996e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002805  flagellin protein FlaD  37.87 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004161  flagellin protein FlaD  37.87 
 
 		 377 aa  214  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0793606  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  36.41 
 
 		 378 aa  214  2.9999999999999995e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06165  flagellin  40.1 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.750692  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01001  flagellin  40.1 
 
 		 390 aa  211  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.157876  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01300  flagellin  37.32 
 
 		 384 aa  210  3e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002806  flagellin protein flaA  39.09 
 
 		 376 aa  210  3e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.938557  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2318  flagellin  36.57 
 
 		 375 aa  209  7e-53  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004162  flagellin protein FlaC  36.61 
 
 		 384 aa  209  9e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.930757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2317  flagellin  38.62 
 
 		 378 aa  207  3e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1726  flagellin  41.01 
 
 		 376 aa  205  1e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02917  flagellin  39.64 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.459128  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02916  flagellin  39.48 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.11854  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1981  flagellin domain-containing protein  37.29 
 
 		 462 aa  204  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  36.89 
 
 		 385 aa  203  5e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  61.93 
 
 		 277 aa  199  6e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1626  flagellin domain protein  71.43 
 
 		 529 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.371874 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1450  flagellin domain protein  37.01 
 
 		 431 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.712124  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  37.69 
 
 		 356 aa  188  1e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1400  flagellin domain protein  36.62 
 
 		 375 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  36.39 
 
 		 374 aa  187  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3024  flagellin domain protein  40.61 
 
 		 339 aa  186  6e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01302  flagellin  35.31 
 
 		 374 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1547  flagellin  36.04 
 
 		 367 aa  181  1e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000229221  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  52.34 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  58.79 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  35.87 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0173  flagellin-like  35.7 
 
 		 392 aa  178  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  53.14 
 
 		 295 aa  178  2e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2037  flagellin domain protein  60.24 
 
 		 293 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.414815 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  60.51 
 
 		 272 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1726  flagellin  35.29 
 
 		 367 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1835  flagellin  35.4 
 
 		 373 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000180129  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  36.95 
 
 		 373 aa  173  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0147  flagellin  34.46 
 
 		 336 aa  173  5e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0172  flagellin-like  35.21 
 
 		 392 aa  171  2e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  37.28 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  37.28 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  35.88 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  35.88 
 
 		 369 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4166  flagellin  35.48 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  56.49 
 
 		 275 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2940  flagellin domain-containing protein  36.47 
 
 		 412 aa  166  8e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2835  flagellin domain-containing protein  58.06 
 
 		 492 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00759619 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  35.53 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1340  flagellin domain-containing protein  55.42 
 
 		 468 aa  162  6e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  55.41 
 
 		 263 aa  160  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1270  flagellin domain-containing protein  51.4 
 
 		 485 aa  161  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.712359 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1757  flagellin  31.49 
 
 		 447 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1341  flagellin domain-containing protein  53.61 
 
 		 467 aa  160  4e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1273  flagellin domain-containing protein  50.28 
 
 		 484 aa  159  5e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.560654 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1173  flagellin domain-containing protein  51.12 
 
 		 481 aa  159  5e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000144043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  45.54 
 
 		 276 aa  159  7e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1172  flagellin domain-containing protein  50.56 
 
 		 482 aa  159  8e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.503015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  56.41 
 
 		 272 aa  159  9e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1488  flagellin  44.63 
 
 		 517 aa  158  1e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0113  flagellin domain protein  48.69 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.232529  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  56.74 
 
 		 936 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  57.45 
 
 		 799 aa  157  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2433  flagellin domain-containing protein  60.14 
 
 		 548 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>