More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0539 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009486  Tpet_0170  flagellin domain-containing protein  84.24 
 
 
387 aa  666    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0514  flagellin domain-containing protein  86.89 
 
 
386 aa  669    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0539  flagellin domain-containing protein  100 
 
 
387 aa  771    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1479  flagellin domain-containing protein  80.51 
 
 
389 aa  627  1e-179  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1811  flagellin domain-containing protein  78.09 
 
 
388 aa  619  1e-176  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.340499  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1478  flagellin domain-containing protein  79.84 
 
 
372 aa  584  1.0000000000000001e-165  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1476  flagellin domain-containing protein  67.95 
 
 
391 aa  528  1e-149  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4189  flagellin domain protein  51 
 
 
385 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0760  flagellin-like  50.62 
 
 
380 aa  325  1e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.382669 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3223  flagellin domain protein  48.45 
 
 
327 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2231  flagellin domain protein  47.41 
 
 
383 aa  305  8.000000000000001e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000159197 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0168  flagellin domain-containing protein  62.21 
 
 
513 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1781  flagellin domain-containing protein  45.79 
 
 
420 aa  298  1e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.964824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0456  flagellin domain-containing protein  47.01 
 
 
404 aa  295  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1664  flagellin domain protein  43.98 
 
 
420 aa  291  2e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31290  flagellin/flagellar hook associated protein  41.79 
 
 
390 aa  251  1e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0355405  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0766  flagellin domain-containing protein  41.4 
 
 
376 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2354  flagellin domain protein  43.61 
 
 
386 aa  243  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2998  flagellin domain protein  42.04 
 
 
391 aa  243  6e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00055355 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1895  flagellin  38.83 
 
 
405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.226617  normal  0.0800037 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1894  flagellin  38.24 
 
 
395 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0808801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1893  flagellin  39.4 
 
 
392 aa  229  6e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.081721 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2867  flagellin-related hook-associated protein  37.41 
 
 
404 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4279  A-type flagellin  36.91 
 
 
387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1351  flagellin domain-containing protein  39.34 
 
 
394 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2866  flagellin-related hook-associated protein  36.17 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1352  flagellin domain-containing protein  38.63 
 
 
393 aa  213  3.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0834  flagellin domain-containing protein  38.8 
 
 
399 aa  211  2e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.9933 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0251  flagellin domain protein  57.58 
 
 
272 aa  209  1e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3036  flagellin domain protein  71.13 
 
 
799 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0198  flagellin-like protein  73.19 
 
 
936 aa  203  4e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03173  flagellin  34.64 
 
 
377 aa  202  6e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0173  flagellin-like  36.7 
 
 
392 aa  202  8e-51  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3024  flagellin domain protein  71.43 
 
 
339 aa  202  9e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1728  flagellin  34.6 
 
 
378 aa  200  3e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01301  flagellin  34.83 
 
 
377 aa  199  5e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2429  flagellin domain-containing protein  68.84 
 
 
713 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0172  flagellin-like  36.96 
 
 
392 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1727  flagellin  36.12 
 
 
377 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2433  flagellin domain-containing protein  66.67 
 
 
548 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0147  flagellin  36.08 
 
 
336 aa  193  4e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2517  flagellin  35.14 
 
 
385 aa  192  6e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0895913  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1780  flagellin  33.67 
 
 
379 aa  192  1e-47  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.315393  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03174  flagellin  35.1 
 
 
377 aa  191  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002804  flagellin protein FlaF  35.03 
 
 
377 aa  190  4e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3233  flagellin domain protein  61.11 
 
 
275 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0670  flagellin domain protein  65.22 
 
 
780 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1985  flagellin-like protein  36.75 
 
 
356 aa  189  8e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1554  flagellin domain protein  37.97 
 
 
379 aa  188  1e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2236  flagellin-like protein  58.93 
 
 
272 aa  189  1e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2866  flagellin  35.43 
 
 
384 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0241  flagellin  35.43 
 
 
384 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17080  flagellin domain protein  63.38 
 
 
282 aa  187  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2873  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1671  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0090  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3952  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3870  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3102  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.586879  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3448  flagellin  33.67 
 
 
388 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0953619  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2237  flagellin-like protein  54.01 
 
 
273 aa  182  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2327  flagellin  33.66 
 
 
379 aa  181  1e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3196  flagellin  34.02 
 
 
383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0223  flagellin  33.33 
 
 
389 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.778808  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5252  flagellin  32.84 
 
 
398 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.102889  normal  0.0240822 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0662  flagellin domain protein  62.32 
 
 
829 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128526 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5089  flagellin  34.98 
 
 
373 aa  175  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.571415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1547  flagellin  35.77 
 
 
367 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000229221  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0315  flagellin domain-containing protein  50.24 
 
 
278 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4306  flagellin domain protein  55.21 
 
 
263 aa  171  2e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240686  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0103  flagellin  34.02 
 
 
381 aa  169  5e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.589379 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3832  flagellin  34.77 
 
 
381 aa  170  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1896  flagellin domain protein  34.57 
 
 
422 aa  169  8e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004160  flagellin protein flaE  33.93 
 
 
374 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000739786  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0075  flagellin domain protein  58.39 
 
 
263 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.904628  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2381  flagellin  33.85 
 
 
369 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2281  flagellin  33.85 
 
 
369 aa  168  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0985  flagellin domain protein  49.72 
 
 
277 aa  167  2e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1835  flagellin  34.42 
 
 
373 aa  166  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000180129  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3850  flagellin domain-containing protein  59.15 
 
 
502 aa  166  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0078  flagellin domain protein  58.99 
 
 
263 aa  166  9e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2599  flagellin domain-containing protein  57.24 
 
 
497 aa  164  2.0000000000000002e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2035  flagellin domain protein  45 
 
 
295 aa  164  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.546619 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0077  flagellin domain protein  58.99 
 
 
266 aa  164  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1726  flagellin  34.51 
 
 
367 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000528146  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3038  flagellin FliC  52 
 
 
276 aa  162  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36095  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1294  flagellin  42.86 
 
 
475 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1115  flagellin/flagellar hook-associated protein  46.34 
 
 
276 aa  161  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1293  flagellin  42.86 
 
 
475 aa  160  3e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3588  flagellin domain-containing protein  32.66 
 
 
392 aa  160  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0076  flagellin domain protein  54.49 
 
 
265 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2367  flagellin  51.9 
 
 
492 aa  160  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.912497  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2202  adenylate kinase  38.75 
 
 
580 aa  159  7e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2036  flagellin domain protein  55.8 
 
 
304 aa  159  9e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.391359 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4397  flagellin domain-containing protein  53.69 
 
 
501 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3086  flagellin domain protein  55.8 
 
 
490 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2038  flagellin domain protein  46.86 
 
 
295 aa  157  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.416457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4400  flagellin domain-containing protein  57.14 
 
 
492 aa  158  2e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1590  flagellin FliC  53.38 
 
 
609 aa  157  3e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4305  flagellin domain protein  59.12 
 
 
262 aa  157  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0943523  normal  0.870572 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>