172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1659 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0070  flagellar hook-associated protein 2 (filament cap protein)  72.18 
 
 
551 aa  786    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1706  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  72.36 
 
 
551 aa  789    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1659  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
550 aa  1085    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  25.75 
 
 
541 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  25.75 
 
 
541 aa  138  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.15 
 
 
452 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.04 
 
 
677 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  31.94 
 
 
669 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.11 
 
 
477 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.25 
 
 
476 aa  107  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.61 
 
 
447 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  28.26 
 
 
692 aa  100  8e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.21 
 
 
451 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  29.04 
 
 
668 aa  97.8  4e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.76 
 
 
475 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.02 
 
 
473 aa  97.1  8e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  27.07 
 
 
498 aa  96.3  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2867  flagellar hook-associated 2-like  26.26 
 
 
502 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0240  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.26 
 
 
502 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.12 
 
 
470 aa  95.1  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.31 
 
 
475 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  27.08 
 
 
488 aa  94.4  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  28.22 
 
 
665 aa  94.4  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0222  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.01 
 
 
502 aa  92  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.99 
 
 
657 aa  90.9  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  26.55 
 
 
500 aa  90.1  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.22 
 
 
479 aa  90.1  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.32 
 
 
456 aa  89.4  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.26 
 
 
457 aa  88.2  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.13 
 
 
456 aa  87.4  6e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.35 
 
 
543 aa  87.4  6e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  26.11 
 
 
454 aa  87  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.79 
 
 
454 aa  87  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  24.72 
 
 
781 aa  86.3  0.000000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.11 
 
 
454 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.94 
 
 
468 aa  86.7  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  28.11 
 
 
452 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.19 
 
 
490 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.74 
 
 
482 aa  85.5  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.53 
 
 
454 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.92 
 
 
453 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  26.78 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.78 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.74 
 
 
456 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.45 
 
 
456 aa  84  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  27 
 
 
499 aa  83.6  0.000000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.94 
 
 
473 aa  82.8  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  27.06 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  29.48 
 
 
632 aa  82.4  0.00000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  22.64 
 
 
586 aa  82  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.29 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.49 
 
 
455 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  24.28 
 
 
591 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.97 
 
 
451 aa  80.9  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  25.78 
 
 
456 aa  80.1  0.00000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.03 
 
 
458 aa  80.1  0.0000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  26.91 
 
 
685 aa  79.3  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.3 
 
 
479 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.2 
 
 
457 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.88 
 
 
468 aa  78.2  0.0000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  27.88 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2535  flagellar hook-associated protein 2 (FliD, filament cap protein)  26.41 
 
 
551 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.16 
 
 
451 aa  78.6  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  27.88 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27.88 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  27.88 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  24.34 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  27.88 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  25.53 
 
 
458 aa  77  0.0000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.28 
 
 
852 aa  76.6  0.000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  24.91 
 
 
456 aa  75.5  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  29.89 
 
 
443 aa  75.5  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0150  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.81 
 
 
500 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0326503  normal  0.285418 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  22.62 
 
 
487 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  22.74 
 
 
462 aa  75.1  0.000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  24.31 
 
 
642 aa  74.7  0.000000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  23.41 
 
 
454 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  24.49 
 
 
646 aa  73.9  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.76 
 
 
678 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 
467 aa  73.6  0.000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.76 
 
 
678 aa  73.6  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17060  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.42 
 
 
448 aa  72.8  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  23.8 
 
 
636 aa  72  0.00000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.27 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  27.95 
 
 
495 aa  72  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  25.84 
 
 
477 aa  71.6  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0764  flagellar filament cap protein FliD  24.17 
 
 
766 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.702512  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  26.79 
 
 
441 aa  71.6  0.00000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4094  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.4 
 
 
473 aa  71.2  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4277  flagellar cap protein FliD  23.56 
 
 
477 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2225  flagellar hook-associated 2 domain protein  21.93 
 
 
487 aa  70.5  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00125533  hitchhiker  5.7852600000000006e-18 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  25.13 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0254  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.3 
 
 
462 aa  70.1  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  25.13 
 
 
441 aa  70.1  0.00000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.06 
 
 
466 aa  69.7  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1034  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.98 
 
 
502 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.460836 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  25 
 
 
484 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2024  flagellar capping protein  26.03 
 
 
471 aa  69.7  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24250  Flagellar hook-associated protein  31.39 
 
 
445 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0939712  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.83 
 
 
438 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>