185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1706 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_0070  flagellar hook-associated protein 2 (filament cap protein)  99.27 
 
 
551 aa  1078    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1706  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  100 
 
 
551 aa  1084    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000399808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1659  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  72.36 
 
 
550 aa  788    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  24.54 
 
 
541 aa  146  9e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.28 
 
 
452 aa  145  2e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  24.49 
 
 
541 aa  143  9e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.95 
 
 
677 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.59 
 
 
476 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  29.19 
 
 
669 aa  113  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.96 
 
 
473 aa  110  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  28.15 
 
 
692 aa  109  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.57 
 
 
447 aa  103  7e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.27 
 
 
543 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.44 
 
 
477 aa  100  7e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.31 
 
 
451 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  26.62 
 
 
490 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.82 
 
 
482 aa  95.1  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.62 
 
 
479 aa  94  7e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.42 
 
 
488 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  26.63 
 
 
498 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.65 
 
 
475 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 
475 aa  90.9  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.7 
 
 
468 aa  90.5  8e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  27.63 
 
 
665 aa  89  2e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.55 
 
 
473 aa  89.4  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  27.41 
 
 
462 aa  86.7  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.95 
 
 
443 aa  85.1  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.19 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  24.27 
 
 
781 aa  83.2  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  25.77 
 
 
477 aa  83.2  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.46 
 
 
453 aa  82  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  30.77 
 
 
452 aa  82.4  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.24 
 
 
470 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  26.42 
 
 
458 aa  82  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  23.52 
 
 
495 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  28.77 
 
 
668 aa  80.9  0.00000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  24.35 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  24.37 
 
 
456 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.53 
 
 
499 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.53 
 
 
458 aa  80.5  0.00000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.02 
 
 
457 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  23.8 
 
 
456 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  26.88 
 
 
487 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  25.62 
 
 
513 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.36 
 
 
456 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25.85 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  33.06 
 
 
451 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.93 
 
 
454 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.94 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  26.63 
 
 
466 aa  78.2  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  27.1 
 
 
685 aa  77.8  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.22 
 
 
449 aa  77.8  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.48 
 
 
472 aa  77.4  0.0000000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.26 
 
 
451 aa  77  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.94 
 
 
504 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.94 
 
 
504 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  26.39 
 
 
466 aa  76.6  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.67 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 
680 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.09 
 
 
680 aa  76.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.55 
 
 
852 aa  75.9  0.000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  26.42 
 
 
472 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.16 
 
 
438 aa  75.1  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  24.22 
 
 
591 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  26.15 
 
 
466 aa  75.5  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25.13 
 
 
500 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.7 
 
 
456 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  22.96 
 
 
586 aa  74.3  0.000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.17 
 
 
454 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  27.67 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.218616 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  27.67 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  32.1 
 
 
441 aa  73.6  0.000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  27.67 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.8 
 
 
455 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.427592 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.67 
 
 
468 aa  73.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  28.16 
 
 
468 aa  73.2  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.95 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27.67 
 
 
465 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.95 
 
 
507 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.45 
 
 
467 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  24.36 
 
 
487 aa  72.4  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  23.12 
 
 
438 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.57 
 
 
457 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  29.2 
 
 
456 aa  72  0.00000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  25.61 
 
 
636 aa  71.2  0.00000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  25.73 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.78 
 
 
457 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25.46 
 
 
437 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 
456 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  25.73 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  25.73 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  25.73 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  25.73 
 
 
507 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1147  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.91 
 
 
554 aa  70.5  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.75 
 
 
479 aa  70.1  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1382  flagellar capping protein  24.84 
 
 
646 aa  70.1  0.0000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  25.59 
 
 
441 aa  70.1  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  25.59 
 
 
441 aa  70.1  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001172  flagellar hook-associated protein FliD  28.46 
 
 
445 aa  69.3  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0573  flagellar capping protein  24.67 
 
 
642 aa  69.3  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>