177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0070 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0070  flagellar hook-associated protein 2 (filament cap protein)  100 
 
 		 551 aa  1086    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1706  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  99.27 
 
 		 551 aa  1078    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000399808 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1659  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  72.18 
 
 		 550 aa  785    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1292  hypothetical protein  24.54 
 
 		 541 aa  145  2e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1447  flagellar hook-associated 2 domain protein  31.02 
 
 		 452 aa  143  8e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.355628  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1291  hypothetical protein  24.54 
 
 		 541 aa  142  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2365  flagellar hook-associated protein 2  26.71 
 
 		 677 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0504  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.09 
 
 		 476 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1339  flagellar hook-associated 2-like  28.93 
 
 		 669 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.542838  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0619  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.89 
 
 		 473 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2198  flagellar capping protein-like  27.65 
 
 		 692 aa  104  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2889  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.3 
 
 		 447 aa  101  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0213  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.06 
 
 		 543 aa  99.4  2e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.878749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0703  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  27.18 
 
 		 477 aa  98.2  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0307046  normal  0.26193 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1343  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.04 
 
 		 451 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4165  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.56 
 
 		 482 aa  94.4  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1011  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.92 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5254  flagellar filament capping protein  25.97 
 
 		 490 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.782787  normal  0.0469121 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0624  flagellar hook-associated 2 domain protein  26.7 
 
 		 468 aa  91.7  3e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2267  flagellar hook-associated 2-like protein  26.65 
 
 		 498 aa  92  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0368748  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4456  flagellar hook-associated protein 2, N-terminal:flagellar hook-associated 2, C-terminal:flagellin hook IN  28.02 
 
 		 488 aa  91.3  4e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0155  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.8 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.760359  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2990  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.39 
 
 		 475 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000444262 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0168  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.55 
 
 		 473 aa  87.4  6e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1592  flagellar hook-associated protein 2  27.37 
 
 		 665 aa  87  7e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0202  flagellar hook-associated protein 2-like  27.1 
 
 		 462 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0765  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  32.95 
 
 		 443 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2590  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.95 
 
 		 657 aa  82.8  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2865  flagellar capping protein  25.52 
 
 		 477 aa  81.3  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0632  flagellar hook-associated 2-like  23.34 
 
 		 495 aa  80.5  0.00000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685512  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1979  flagellar hook-associated protein 2  26.15 
 
 		 458 aa  80.1  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1354  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  28.72 
 
 		 453 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.271885  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1341  flagellar hook-associated protein 2-like  30.04 
 
 		 452 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0133046  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2304  flagellar hook-associated 2-like protein  24.09 
 
 		 454 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.422085 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1491  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.99 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1984  flagellar hook-associated 2-like protein  28.49 
 
 		 668 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2033  flagellar hook-associated 2-like protein  27.01 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1449  flagellar hook-associated 2-like  23.82 
 
 		 781 aa  78.6  0.0000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000641782  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1536  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.27 
 
 		 499 aa  77.8  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.885136  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1544  flagellar hook-associated protein 2  25.39 
 
 		 513 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0444  flagellar hook-associated protein 2-like  26.56 
 
 		 487 aa  76.6  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1317  flagellar hook-associated 2-like protein  25.61 
 
 		 454 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2933  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.1 
 
 		 456 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1430  flagellar hook-associated 2 domain protein  23.87 
 
 		 456 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.643436  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0383  flagellar hook-associated protein 2  26.86 
 
 		 685 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.374086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3342  flagellar hook-associated protein 2  26.68 
 
 		 472 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.952882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2034  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.93 
 
 		 449 aa  75.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.842459 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2612  flagellar hook-associated 2 domain protein  32.23 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000540549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2583  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.5 
 
 		 457 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0114  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.17 
 
 		 852 aa  75.1  0.000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2382  flagellar capping protein  26.15 
 
 		 466 aa  74.7  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2516  flagellar hook-associated 2 domain protein  28.61 
 
 		 451 aa  74.7  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00442431  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6604  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.7 
 
 		 504 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.433714 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3235  flagellar hook-associated protein FliD  23.29 
 
 		 456 aa  74.3  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7620  flagellar hook-associated protein 2  25.13 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.238604 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3672  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.83 
 
 		 680 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1892  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.23 
 
 		 472 aa  74.3  0.000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.250953 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4749  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.83 
 
 		 680 aa  74.3  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.18263 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3075  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.41 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.22222  normal  0.298346 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1175  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.17 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000468888  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2943  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.41 
 
 		 454 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1275  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.39 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5757  flagellar hook-associated 2-like  24.7 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6122  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.7 
 
 		 504 aa  73.6  0.000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.288503 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2283  flagellar capping protein  25.91 
 
 		 466 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.733506  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0778  flagellar capping protein  23.99 
 
 		 591 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1359  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  24.57 
 
 		 457 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2159  flagellar capping protein  27.18 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0506  flagellar hook-associated 2-like protein  31.48 
 
 		 441 aa  71.6  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.251572  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1715  flagellar capping protein  27.18 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.207421 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2022  flagellar capping protein  25.67 
 
 		 466 aa  72  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1257  flagellar capping protein  27.18 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.218616 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1722  flagellar hook-associated 2 domain protein  27.18 
 
 		 468 aa  71.6  0.00000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.906603  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2457  flagellar hook-associated protein 2  25.73 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0813181  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2699  flagellar capping protein  27.18 
 
 		 465 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.171502 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1054  flagellar capping protein  27.67 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.47056  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1190  flagellar hook-associated protein  25.73 
 
 		 507 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1611  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25 
 
 		 456 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3357  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  23.91 
 
 		 438 aa  71.2  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.507353  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3073  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  25.78 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1335  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  22.19 
 
 		 456 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.16041  normal  0.0944335 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1264  flagellar hook-associated protein  25.5 
 
 		 507 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1035  flagellar capping protein  22.63 
 
 		 586 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.951897  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04956  flagellar capping protein  25.46 
 
 		 437 aa  70.1  0.0000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1374  flagellar hook-associated protein 2  25.5 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0101917  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2922  flagellar hook-associated 2-like protein  28.95 
 
 		 456 aa  69.3  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0360  flagellar hook-associated protein 2  25.5 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0638  flagellar hook-associated protein 2  25.5 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0988194  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0932  flagellar hook-associated protein 2  25.5 
 
 		 507 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4442  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.13 
 
 		 678 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4575  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.13 
 
 		 678 aa  68.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.401744 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0633  flagellar hook-associated 2 domain protein  25.19 
 
 		 467 aa  69.3  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000260812 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5642  flagellar hook-associated protein 2  23.85 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3811  flagellar hook-associated 2 domain-containing protein  26.5 
 
 		 479 aa  68.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01000  flagellar protein  25.53 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0813723  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0765  flagellar hook-associated 2-like  26.87 
 
 		 632 aa  68.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0210508 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06166  flagellar protein  25.53 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0277  lateral flagellar hook associated protein 2  22.86 
 
 		 438 aa  68.2  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0170554  normal  0.892607 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0652  flagellar capping protein  25.2 
 
 		 636 aa  67.8  0.0000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1529  flagellar hook-associated 2-like  27.86 
 
 		 484 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.746516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>