More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4248 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4248  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1268 aa  2501    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.416607 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  38.23 
 
 		 1026 aa  550  1e-155  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  37.74 
 
 		 1026 aa  549  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  35.87 
 
 		 1070 aa  543  1e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  37.72 
 
 		 1026 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  36.59 
 
 		 1025 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  38.3 
 
 		 1093 aa  538  1e-151  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  38.99 
 
 		 1026 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  37.16 
 
 		 1031 aa  525  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  34.48 
 
 		 1085 aa  521  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  37.35 
 
 		 1024 aa  520  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  36.95 
 
 		 1074 aa  521  1e-146  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  38.35 
 
 		 1061 aa  516  1.0000000000000001e-145  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  36.65 
 
 		 1053 aa  517  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2744  error-prone DNA polymerase  38.2 
 
 		 1071 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  36.66 
 
 		 1075 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  37.15 
 
 		 1031 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1033 aa  514  1e-144  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  35.42 
 
 		 1099 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0445  error-prone DNA polymerase  38.54 
 
 		 1084 aa  516  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.553328  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  37.38 
 
 		 1084 aa  516  1e-144  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  38.1 
 
 		 1049 aa  516  1e-144  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0510  error-prone DNA polymerase  38.65 
 
 		 1072 aa  514  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  35.53 
 
 		 1099 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0527  error-prone DNA polymerase  38.65 
 
 		 1072 aa  515  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  35.53 
 
 		 1099 aa  516  1e-144  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0692  error-prone DNA polymerase  38.54 
 
 		 1072 aa  512  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.310882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2213  error-prone DNA polymerase  38.46 
 
 		 1071 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271039  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2826  error-prone DNA polymerase  38.46 
 
 		 1071 aa  512  1e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.27708  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  38.78 
 
 		 1049 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  38.1 
 
 		 1064 aa  509  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  37.55 
 
 		 1068 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  36.32 
 
 		 1072 aa  507  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5159  DNA polymerase III, alpha subunit  35.26 
 
 		 1087 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.572913  normal  0.312122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  36.88 
 
 		 1090 aa  508  9.999999999999999e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2886  error-prone DNA polymerase  38.2 
 
 		 1071 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.811803  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  35.54 
 
 		 1098 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3145  error-prone DNA polymerase  38.44 
 
 		 1063 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0114  error-prone DNA polymerase  38.44 
 
 		 1063 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  37.04 
 
 		 1031 aa  506  1e-141  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  36.67 
 
 		 1059 aa  503  1e-141  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  38.61 
 
 		 1044 aa  506  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1474  error-prone DNA polymerase  38.44 
 
 		 1063 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2902  error-prone DNA polymerase  38.44 
 
 		 1063 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2837  error-prone DNA polymerase  38.24 
 
 		 1071 aa  505  1e-141  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  35.02 
 
 		 1087 aa  504  1e-141  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  35.93 
 
 		 1116 aa  501  1e-140  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  35.85 
 
 		 1049 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  37.24 
 
 		 1043 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  34.38 
 
 		 1087 aa  498  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  38.34 
 
 		 1049 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  34.97 
 
 		 1026 aa  497  1e-139  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0477  error-prone DNA polymerase  37.96 
 
 		 1071 aa  496  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.278622  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  37.05 
 
 		 1047 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2599  DNA polymerase III, alpha subunit  35.28 
 
 		 1040 aa  494  9.999999999999999e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1532  DNA polymerase III, alpha subunit  36.94 
 
 		 1099 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0291245  normal  0.633763 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3147  DNA polymerase III, alpha subunit  36.47 
 
 		 1059 aa  496  9.999999999999999e-139  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  36.01 
 
 		 1068 aa  494  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  34.68 
 
 		 1082 aa  495  9.999999999999999e-139  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  35.57 
 
 		 1096 aa  495  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  37.92 
 
 		 1025 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  35.36 
 
 		 1116 aa  493  9.999999999999999e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  35.84 
 
 		 1073 aa  490  1e-137  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  32.71 
 
 		 1074 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  39.9 
 
 		 1132 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.929723  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2294  DNA polymerase III alpha chain  33.1 
 
 		 1097 aa  490  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5036  DNA polymerase III, alpha subunit  36.21 
 
 		 1071 aa  490  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.38358  normal  0.080697 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5603  DNA polymerase III, alpha subunit  34.34 
 
 		 1099 aa  493  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00446711 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  34.73 
 
 		 1036 aa  493  1e-137  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2672  DNA polymerase III, alpha subunit  37.31 
 
 		 1076 aa  493  1e-137  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.087577 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4576  DNA polymerase III, alpha subunit  36.32 
 
 		 1071 aa  489  1e-136  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.427966 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  35.15 
 
 		 1015 aa  488  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  35.15 
 
 		 1020 aa  489  1e-136  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  35.79 
 
 		 1026 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  38.14 
 
 		 1049 aa  488  1e-136  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  32.96 
 
 		 1076 aa  484  1e-135  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  33.47 
 
 		 1055 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  35.71 
 
 		 1118 aa  484  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.115871  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  35.01 
 
 		 1092 aa  485  1e-135  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2038  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1173 aa  486  1e-135  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.70219 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  33.4 
 
 		 1090 aa  486  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2944  DNA polymerase III subunit alpha  36.03 
 
 		 1105 aa  484  1e-135  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000126736  decreased coverage  0.0000111947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  33.57 
 
 		 1045 aa  480  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  35.28 
 
 		 1027 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  37.42 
 
 		 1023 aa  482  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  34.73 
 
 		 1093 aa  483  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3263  DNA polymerase III, alpha subunit  33.43 
 
 		 1126 aa  483  1e-134  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  36.06 
 
 		 1079 aa  483  1e-134  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  36.47 
 
 		 1145 aa  481  1e-134  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21270  DNA polymerase III, alpha subunit  34.97 
 
 		 1117 aa  483  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0292605  normal  0.169671 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2248  DNA polymerase III, alpha subunit  39.05 
 
 		 1133 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.649933  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4488  error-prone DNA polymerase  35.88 
 
 		 1079 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.458186  normal  0.527092 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4536  DNA polymerase III, alpha subunit  35.08 
 
 		 1040 aa  479  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183295  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4621  error-prone DNA polymerase  35.88 
 
 		 1079 aa  477  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743632  normal  0.186746 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  36.57 
 
 		 1145 aa  474  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2336  DNA polymerase III, alpha subunit  38.92 
 
 		 1142 aa  476  1e-132  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479232  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  35.29 
 
 		 1124 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5094  DNA polymerase III, alpha subunit  35.71 
 
 		 1070 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.695828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1384  DNA polymerase III, alpha subunit  36.29 
 
 		 1193 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.38254  hitchhiker  0.00082485 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4291  DNA polymerase III, alpha subunit  35.65 
 
 		 1077 aa  473  1.0000000000000001e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271094  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>