More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2038 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014151  Cfla_2038  DNA polymerase III, alpha subunit  100 
 
 		 1173 aa  2333    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.12539  normal  0.70219 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2598  error-prone DNA polymerase  38.82 
 
 		 1026 aa  663    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.254359  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3119  error-prone DNA polymerase  38.54 
 
 		 1026 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.684006  normal  0.216364 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21270  DNA polymerase III, alpha subunit  70.61 
 
 		 1117 aa  1539    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0292605  normal  0.169671 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2944  DNA polymerase III subunit alpha  49.74 
 
 		 1105 aa  1002    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  unclonable  0.000126736  decreased coverage  0.0000111947 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2164  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  39.84 
 
 		 1047 aa  654    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0069  error-prone DNA polymerase  37.08 
 
 		 1077 aa  636    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0463  DNA polymerase III, alpha subunit  39.55 
 
 		 1044 aa  637    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2795  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  37.77 
 
 		 1031 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0590978  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4536  DNA polymerase III, alpha subunit  38.18 
 
 		 1040 aa  639    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.183295  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2523  error-prone DNA polymerase  37.86 
 
 		 1031 aa  649    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.494212  normal  0.761235 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3204  DNA polymerase III, alpha subunit  39.72 
 
 		 1074 aa  685    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0855873 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1942  DNA polymerase III, alpha subunit  37.69 
 
 		 1027 aa  643    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0322539 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0828  DNA polymerase III, alpha subunit  39.43 
 
 		 1023 aa  648    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2345  DNA polymerase III, alpha subunit  35.92 
 
 		 1076 aa  665    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.818037  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1187  DNA polymerase III, alpha subunit  55.01 
 
 		 1093 aa  1149    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.0053605  normal  0.0613953 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3149  error-prone DNA polymerase  37.77 
 
 		 1025 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1970  DNA polymerase III, alpha subunit  38.12 
 
 		 1049 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1611  DNA polymerase III, alpha subunit  50.92 
 
 		 1053 aa  956    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6269  DNA polymerase III, alpha subunit  38.56 
 
 		 1049 aa  649    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0338143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4841  error-prone DNA polymerase  39.22 
 
 		 1024 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1210  error-prone DNA polymerase  56.87 
 
 		 1099 aa  1196    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0855057 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1612  DNA polymerase III, alpha subunit  45.56 
 
 		 1132 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.929723  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3466  error-prone DNA polymerase  58.86 
 
 		 1124 aa  1194    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.14636  decreased coverage  0.00222326 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0932  DNA polymerase III, alpha subunit  55.82 
 
 		 1093 aa  1184    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.966242  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15740  DNA polymerase III, alpha subunit  57.04 
 
 		 1141 aa  1145    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.129252  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3155  error-prone DNA polymerase  55.91 
 
 		 1092 aa  1125    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00446252  hitchhiker  0.000661117 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1752  DNA polymerase III, alpha subunit  55.12 
 
 		 1090 aa  1134    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.947156  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13406  error-prone DNA polymerase  56.08 
 
 		 1079 aa  1139    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0998493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2738  error-prone DNA polymerase  39.32 
 
 		 1026 aa  679    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.201336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3765  DNA polymerase III, alpha subunit  37.09 
 
 		 1087 aa  636    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2428  error-prone DNA polymerase  39.03 
 
 		 1026 aa  650    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.370616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4047  DNA polymerase III, alpha subunit  39.57 
 
 		 1070 aa  736    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5393  DNA polymerase III, alpha subunit  35.25 
 
 		 1074 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1325  DNA polymerase III, alpha subunit  37.29 
 
 		 1026 aa  671    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2398  DNA polymerase III, alpha subunit  36.08 
 
 		 1045 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.800911 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1183  error-prone DNA polymerase  56.87 
 
 		 1099 aa  1196    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3292  DNA polymerase III, alpha subunit  37.41 
 
 		 1082 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0677218  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0079  error-prone DNA polymerase  38.05 
 
 		 1077 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0619  DNA polymerase III, alpha subunit  38.03 
 
 		 1033 aa  692    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.130808 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3583  DNA polymerase III subunit alpha  50 
 
 		 1073 aa  1015    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1175  DNA polymerase III, alpha subunit  39.65 
 
 		 1025 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286001  normal  0.0989959 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1831  DNA polymerase III, alpha subunit  37.4 
 
 		 1093 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.715135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5240  DNA polymerase III, alpha subunit  53.04 
 
 		 1127 aa  1043    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0104039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55610  error-prone DNA polymerase  38.26 
 
 		 1031 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0362545 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0202  DNA polymerase III, alpha subunit  37.65 
 
 		 1043 aa  636    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663239 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3380  DNA polymerase III, alpha subunit  35.95 
 
 		 1055 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.176631 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4893  error-prone DNA polymerase  56.34 
 
 		 1087 aa  1219    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0740584 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0995  error-prone DNA polymerase  56.03 
 
 		 1090 aa  1164    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1897  error-prone DNA polymerase  51.58 
 
 		 1145 aa  1036    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211762  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1200  error-prone DNA polymerase  56.87 
 
 		 1099 aa  1196    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1530  error-prone DNA polymerase  56.08 
 
 		 1098 aa  1196    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94615 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1441  DNA polymerase III, alpha subunit  66.23 
 
 		 1185 aa  1455    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0417795  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2287  DNA polymerase III, alpha subunit  62.26 
 
 		 1194 aa  1321    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.361309  normal  0.995988 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2732  DNA polymerase III, alpha subunit  39.9 
 
 		 1044 aa  658    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.421518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3239  error-prone DNA polymerase  58.69 
 
 		 1124 aa  1199    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.023295  normal  0.114564 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1071  DNA polymerase III, alpha subunit  38.58 
 
 		 1145 aa  634  1e-180  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.049044 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1934  error-prone DNA polymerase  37.3 
 
 		 1026 aa  633  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0139985  normal  0.548087 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6871  DNA polymerase III, alpha subunit  38.25 
 
 		 1049 aa  635  1e-180  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0451671  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6769  DNA polymerase III, alpha subunit  37.99 
 
 		 1049 aa  630  1e-179  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1095  DNA polymerase III, alpha subunit  37.77 
 
 		 1044 aa  627  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2336  DNA polymerase III, alpha subunit  45.57 
 
 		 1142 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.479232  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2903  DNA polymerase III, alpha subunit  37.15 
 
 		 1109 aa  626  1e-178  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279122 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2248  DNA polymerase III, alpha subunit  45.69 
 
 		 1133 aa  628  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.649933  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2531  DNA polymerase III, alpha subunit  36.24 
 
 		 1085 aa  622  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465943 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4461  DNA polymerase III, alpha subunit  36.52 
 
 		 1117 aa  620  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.681559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4053  DNA polymerase III, alpha subunit  36.97 
 
 		 1116 aa  618  1e-175  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5157  DNA polymerase III, alpha subunit  37.52 
 
 		 1072 aa  619  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4496  DNA polymerase III, alpha subunit  38.15 
 
 		 1075 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0964877  normal  0.0589388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1028  pantoate-beta-alanine ligase  34.78 
 
 		 1029 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1227  DNA polymerase III, alpha subunit  38.63 
 
 		 1084 aa  610  1e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1948  DNA polymerase III, alpha subunit  39.77 
 
 		 1075 aa  612  1e-173  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1546  DNA polymerase III, alpha subunit  36.32 
 
 		 1020 aa  609  1e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00297592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2802  DNA polymerase III, alpha subunit  35.6 
 
 		 1090 aa  612  1e-173  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.549156 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0973  DNA polymerase III, alpha subunit  36.17 
 
 		 1039 aa  609  1e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.309607  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2380  error-prone DNA polymerase  39.17 
 
 		 1036 aa  608  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.106216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3021  DNA polymerase III, alpha subunit  35.84 
 
 		 1116 aa  608  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1558  DNA polymerase III, alpha subunit  35.63 
 
 		 1097 aa  606  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.156224 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1903  error-prone DNA polymerase  37.13 
 
 		 1110 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.989909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1767  DNA polymerase III, alpha subunit  38.58 
 
 		 1061 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148891  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1871  DNA polymerase III, alpha subunit, putative  36.32 
 
 		 1015 aa  608  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02092  error-prone DNA polymerase  38.07 
 
 		 1083 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.529934  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1331  DNA polymerase III, alpha subunit  36.54 
 
 		 1049 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.235182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3809  DNA polymerase III, alpha subunit  37.1 
 
 		 1096 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.595243  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1863  DNA-directed DNA polymerase  36.46 
 
 		 1030 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0330088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3998  DNA polymerase III, alpha subunit  36.49 
 
 		 1116 aa  605  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1967  DNA polymerase III, alpha subunit  38.4 
 
 		 1064 aa  600  1e-170  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785197  normal  0.846182 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2388  DNA polymerase III, alpha subunit  37.55 
 
 		 1068 aa  600  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.743991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4896  DNA polymerase III, alpha subunit  38.12 
 
 		 1041 aa  601  1e-170  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.71874  normal  0.291391 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5201  DNA polymerase III, alpha subunit  36.49 
 
 		 1053 aa  601  1e-170  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0149235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1119  DNA polymerase III, alpha subunit  39.52 
 
 		 1196 aa  597  1e-169  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0282531  normal  0.883779 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3263  DNA polymerase III, alpha subunit  35.56 
 
 		 1126 aa  597  1e-169  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.230885  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2200  DNA polymerase III, alpha subunit  45.08 
 
 		 1197 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.846036  normal  0.413997 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4291  DNA polymerase III, alpha subunit  36.27 
 
 		 1077 aa  597  1e-169  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.271094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0808  DNA polymerase III, alpha subunit  36.79 
 
 		 1059 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.881912  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6156  error-prone DNA polymerase  37.62 
 
 		 1068 aa  593  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.80972  normal  0.557426 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3563  error-prone DNA polymerase  35.96 
 
 		 1165 aa  595  1e-168  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.863163  normal  0.552046 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2255  error-prone DNA polymerase  35.66 
 
 		 1175 aa  591  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1733  error-prone DNA polymerase  37.3 
 
 		 1112 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.647587  hitchhiker  0.00382273 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2666  error-prone DNA polymerase  35.84 
 
 		 1164 aa  592  1e-167  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>