More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2751 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  100 
 
 
591 aa  1164    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.7 
 
 
565 aa  273  5.000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  40.57 
 
 
557 aa  270  4e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  35.81 
 
 
559 aa  240  4e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  36.75 
 
 
551 aa  237  6e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 
561 aa  233  8.000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  34.91 
 
 
524 aa  231  3e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
557 aa  227  6e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  36.4 
 
 
557 aa  227  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  36.17 
 
 
562 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  38.08 
 
 
459 aa  220  5e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  35.55 
 
 
459 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  35.64 
 
 
563 aa  216  8e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37.72 
 
 
615 aa  212  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  35.99 
 
 
454 aa  212  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  34.39 
 
 
563 aa  210  5e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  35.21 
 
 
568 aa  207  3e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  35.99 
 
 
454 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  35.99 
 
 
454 aa  205  2e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  35.49 
 
 
455 aa  204  5e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  34.89 
 
 
454 aa  203  9e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  35.75 
 
 
454 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  35.27 
 
 
454 aa  200  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  35.51 
 
 
454 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  35.35 
 
 
453 aa  196  9e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  35.27 
 
 
454 aa  192  2e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  35.02 
 
 
454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  35.02 
 
 
454 aa  191  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  33.82 
 
 
466 aa  189  1e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  34.78 
 
 
454 aa  187  7e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  34.8 
 
 
563 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  36.49 
 
 
563 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  34.96 
 
 
457 aa  172  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  30.94 
 
 
457 aa  164  5.0000000000000005e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
451 aa  145  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  30.89 
 
 
453 aa  145  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  31.89 
 
 
427 aa  142  3e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  32.61 
 
 
450 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  32.13 
 
 
435 aa  131  3e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  24.47 
 
 
518 aa  129  1.0000000000000001e-28  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.61 
 
 
565 aa  120  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  22.96 
 
 
448 aa  117  6.9999999999999995e-25  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30 
 
 
580 aa  116  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.26 
 
 
565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  25.06 
 
 
518 aa  115  3e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.21 
 
 
569 aa  113  9e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 
593 aa  110  5e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  31.46 
 
 
446 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  29.48 
 
 
584 aa  107  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.78 
 
 
609 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  31.67 
 
 
443 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  30.19 
 
 
448 aa  101  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  28.9 
 
 
609 aa  96.3  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  27.97 
 
 
458 aa  94.4  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  28.7 
 
 
590 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.7 
 
 
590 aa  94.4  6e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  28.7 
 
 
501 aa  92.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  27.08 
 
 
393 aa  89  2e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  30.86 
 
 
453 aa  80.9  0.00000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  28.64 
 
 
466 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  28.94 
 
 
345 aa  68.6  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  29.4 
 
 
403 aa  65.9  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  24.08 
 
 
502 aa  64.3  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  28.97 
 
 
124 aa  61.2  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  28.97 
 
 
124 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  28.97 
 
 
124 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  28.97 
 
 
124 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  30.6 
 
 
411 aa  60.8  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0959  AMP-dependent synthetase and ligase  25 
 
 
512 aa  60.8  0.00000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0739056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9272  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  28.12 
 
 
647 aa  59.7  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.93 
 
 
361 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  28.19 
 
 
370 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.1 
 
 
545 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4005  AMP-dependent synthetase and ligase  26.73 
 
 
522 aa  58.5  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2685  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II-like protein  28.46 
 
 
328 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4558  AMP-dependent synthetase and ligase  26.98 
 
 
511 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3839  AMP-dependent synthetase and ligase  25.13 
 
 
506 aa  57.4  0.0000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.223442  normal  0.234006 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0495  putative methyltransferase  27.94 
 
 
798 aa  57.4  0.0000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.722631  normal  0.300307 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4971  AMP-dependent synthetase and ligase  34.75 
 
 
556 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212959 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0089  benzoate-CoA ligase family  25.87 
 
 
515 aa  57  0.0000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1192  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  26.77 
 
 
1004 aa  56.6  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0238022  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1706  AMP-dependent synthetase and ligase  28.15 
 
 
381 aa  56.6  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1177  amino acid adenylation  33.03 
 
 
3137 aa  55.8  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02104  hypothetical protein  32.14 
 
 
1042 aa  56.2  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  24.6 
 
 
495 aa  56.2  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  27.07 
 
 
1139 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1988  AMP-dependent synthetase and ligase  30.86 
 
 
595 aa  56.2  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.627511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2126  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  25.93 
 
 
547 aa  55.8  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.191102  decreased coverage  0.00946818 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.83 
 
 
114 aa  55.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1850  AMP-dependent synthetase and ligase  25.35 
 
 
557 aa  55.5  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0104238  hitchhiker  0.00000000609851 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3476  peptide arylation protein  26.85 
 
 
542 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00809458  hitchhiker  0.00477913 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  25.56 
 
 
1137 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  29.41 
 
 
134 aa  54.3  0.000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1224  benzoate-CoA ligase  25.27 
 
 
549 aa  54.7  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231141  normal  0.0338885 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1557  AMP-dependent synthetase and ligase  24.65 
 
 
544 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6272  AMP-dependent synthetase and ligase  24.65 
 
 
544 aa  54.7  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.417798  normal  0.3516 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1011  long-chain acyl-CoA synthetase  25 
 
 
607 aa  54.3  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  29.41 
 
 
134 aa  54.3  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1744  AMP-dependent synthetase and ligase  26.21 
 
 
488 aa  53.9  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732751  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>