More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0694 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  60.39 
 
 		 557 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  75.22 
 
 		 568 aa  803    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  60.92 
 
 		 563 aa  642    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  70.96 
 
 		 615 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 562 aa  1118    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  60.39 
 
 		 557 aa  638    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  60.78 
 
 		 563 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  61.07 
 
 		 563 aa  597  1e-169  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 559 aa  345  1e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  40.89 
 
 		 563 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  39.77 
 
 		 524 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  42.13 
 
 		 459 aa  302  9e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  39.34 
 
 		 454 aa  299  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  38.88 
 
 		 459 aa  297  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  41.93 
 
 		 453 aa  295  1e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  39.38 
 
 		 557 aa  293  8e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  37.85 
 
 		 454 aa  292  9e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  38.68 
 
 		 455 aa  292  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  38.45 
 
 		 551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  38.41 
 
 		 454 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  38.17 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  38.41 
 
 		 454 aa  280  4e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  39.51 
 
 		 561 aa  280  5e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  38.21 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  38.21 
 
 		 454 aa  280  5e-74  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  38.17 
 
 		 454 aa  280  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  38.06 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  37.97 
 
 		 454 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  34.76 
 
 		 466 aa  272  1e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  37.7 
 
 		 454 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  34.59 
 
 		 457 aa  256  9e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  30.74 
 
 		 565 aa  248  2e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  34.46 
 
 		 451 aa  223  4.9999999999999996e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  36.17 
 
 		 591 aa  222  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  36.67 
 
 		 457 aa  214  2.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  31.5 
 
 		 453 aa  194  4e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  29.52 
 
 		 518 aa  172  1e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  26.37 
 
 		 448 aa  171  4e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  28.69 
 
 		 518 aa  154  2.9999999999999998e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  31.15 
 
 		 427 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  29.78 
 
 		 609 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  30.57 
 
 		 609 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  30.24 
 
 		 584 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.48 
 
 		 565 aa  136  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.7 
 
 		 580 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  30.66 
 
 		 590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  30.66 
 
 		 590 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 570 aa  131  3e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.64 
 
 		 565 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  29 
 
 		 448 aa  125  2e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 593 aa  123  8e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  30.7 
 
 		 501 aa  117  5e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  32.83 
 
 		 443 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  28.28 
 
 		 435 aa  111  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  28.28 
 
 		 450 aa  107  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  30.11 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.93 
 
 		 569 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.62 
 
 		 446 aa  100  8e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  29.43 
 
 		 453 aa  89.7  1e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  29.81 
 
 		 411 aa  89  2e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  28.24 
 
 		 500 aa  89.4  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1859  amino acid adenylation domain-containing protein  26.6 
 
 		 2596 aa  86.3  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0524  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 525 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.319633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  29.97 
 
 		 458 aa  84.3  0.000000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  26.78 
 
 		 490 aa  83.2  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  39.45 
 
 		 120 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  25.93 
 
 		 495 aa  81.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4177  AMP-dependent synthetase and ligase  28.69 
 
 		 546 aa  81.6  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0033  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  30.77 
 
 		 361 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.648797  normal  0.336703 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 493 aa  81.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  29.41 
 
 		 466 aa  81.3  0.00000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  24.86 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  26.9 
 
 		 492 aa  80.5  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0937  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  29.97 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.24401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  26.54 
 
 		 493 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  27.48 
 
 		 561 aa  79.7  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  29.38 
 
 		 506 aa  79  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3731  amino acid adenylation domain-containing protein  27.39 
 
 		 1130 aa  79  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0201667  normal  0.167868 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  25.27 
 
 		 559 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  36.36 
 
 		 123 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0321  AMP-dependent synthetase and ligase  26.09 
 
 		 503 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.289675  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3946  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  38.78 
 
 		 124 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  38.78 
 
 		 124 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4020  AMP-dependent synthetase and ligase  26.82 
 
 		 523 aa  77.8  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.165206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  38.78 
 
 		 124 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  27.02 
 
 		 502 aa  77.4  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  29.19 
 
 		 472 aa  77  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3197  Acyl transferase  32.48 
 
 		 4575 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3491  acyl-CoA synthetase  29.07 
 
 		 467 aa  76.6  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.310406 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 507 aa  76.3  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1943  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.04 
 
 		 560 aa  75.9  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  25.79 
 
 		 519 aa  76.3  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5539  acetate/CoA ligase  28.42 
 
 		 649 aa  75.1  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.105209  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4756  amino acid adenylation domain-containing protein  28.22 
 
 		 1789 aa  75.1  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.171459  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1006  AMP-dependent synthetase and ligase  27.35 
 
 		 585 aa  75.1  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  27.29 
 
 		 515 aa  75.5  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1188  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  26.72 
 
 		 547 aa  74.7  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  35.71 
 
 		 134 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  22.98 
 
 		 485 aa  75.1  0.000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>