80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4372 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  100 
 
 		 124 aa  256  5.0000000000000005e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  92.68 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  92.68 
 
 		 124 aa  241  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  91.87 
 
 		 124 aa  239  1e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  88.79 
 
 		 134 aa  213  5.9999999999999996e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  87.93 
 
 		 134 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  87.07 
 
 		 134 aa  210  5.999999999999999e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  87.07 
 
 		 134 aa  208  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  83.62 
 
 		 137 aa  201  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  67.24 
 
 		 125 aa  167  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  66.39 
 
 		 120 aa  165  1e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  63.25 
 
 		 128 aa  164  5e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  62.07 
 
 		 125 aa  159  1e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  60 
 
 		 123 aa  151  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  63.16 
 
 		 130 aa  150  7e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  42.34 
 
 		 563 aa  94  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  44.34 
 
 		 559 aa  90.9  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  43.88 
 
 		 561 aa  90.5  6e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  41.12 
 
 		 524 aa  88.6  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  39.13 
 
 		 124 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.18 
 
 		 114 aa  82  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  39.09 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  36.79 
 
 		 568 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  35.04 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  37 
 
 		 615 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.95 
 
 		 565 aa  77.4  0.00000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 562 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.48 
 
 		 563 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  34.58 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  34.23 
 
 		 117 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 557 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  36.73 
 
 		 557 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  30.56 
 
 		 563 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  31.9 
 
 		 557 aa  65.5  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  30.36 
 
 		 551 aa  62  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  28.97 
 
 		 591 aa  61.2  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  29.09 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  30.61 
 
 		 563 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.9 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  35.85 
 
 		 109 aa  51.6  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  29.29 
 
 		 593 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.71 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5399  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000134104  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5076  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000655329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5551  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000963148  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4961  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  1.28459e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5401  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000205722  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0677  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  28.71 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5454  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000048346  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  32.65 
 
 		 132 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3797  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.39 
 
 		 144 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000652918  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2332  3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  27.18 
 
 		 142 aa  44.3  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115799  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3097  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  33.01 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000414078  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.52 
 
 		 121 aa  44.3  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4963  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.95 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000238321  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5116  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.95 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000186876  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5357  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.95 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5508  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.95 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000439699  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  32.94 
 
 		 518 aa  42.4  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0071  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  30.26 
 
 		 462 aa  42.7  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0351  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.82 
 
 		 140 aa  42  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.030563  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0436  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.32 
 
 		 141 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000377622  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1905  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.88 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000023951  normal  0.338471 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1728  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  30.86 
 
 		 142 aa  41.6  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.770808  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2173  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000210444  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1081  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  32.84 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2135  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.26 
 
 		 146 aa  41.6  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000000114205  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 570 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  36.26 
 
 		 518 aa  41.2  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  27.96 
 
 		 565 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2747  hypothetical protein  32.22 
 
 		 105 aa  40.8  0.006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.168123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  29.41 
 
 		 584 aa  40.8  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.03 
 
 		 565 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1586  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  26.19 
 
 		 145 aa  40.8  0.006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000412753  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3042  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.39 
 
 		 146 aa  40.8  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.462423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0289  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  28.99 
 
 		 464 aa  40.4  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.013446 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0666  cylZ protein  25.27 
 
 		 158 aa  40.4  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1527  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.76 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000569467  decreased coverage  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1706  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.76 
 
 		 169 aa  40.4  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0205263  normal  0.629658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0217  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.73 
 
 		 143 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>