70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3892 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  100 
 
 		 128 aa  268  1e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4600  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  66.1 
 
 		 125 aa  169  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4372  thioester dehydrase family protein  63.25 
 
 		 124 aa  164  5e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0336  thioester dehydrase family protein  64.66 
 
 		 134 aa  164  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0337  thioester dehydrase family protein  63.25 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3680  thioester dehydrase family protein  63.25 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0346  thioester dehydrase family protein  63.25 
 
 		 124 aa  163  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0321  thioester dehydrase family protein  65.52 
 
 		 125 aa  161  2.0000000000000002e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116692 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0346  thioester dehydrase family protein  63.79 
 
 		 134 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0343  thioester dehydrase family protein  62.93 
 
 		 134 aa  160  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0348  thioester dehydrase family protein  63.48 
 
 		 130 aa  160  6e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0338  thioester dehydrase family protein  62.93 
 
 		 134 aa  159  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0442  thioester dehydrase family protein  60.98 
 
 		 137 aa  157  3e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3515  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  60 
 
 		 123 aa  146  9e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3383  thioester dehydrase family protein  57.89 
 
 		 120 aa  145  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  43.1 
 
 		 563 aa  103  7e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  40.35 
 
 		 559 aa  98.2  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  42.48 
 
 		 524 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0894  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  38.61 
 
 		 114 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.392479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  41.51 
 
 		 124 aa  79.3  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  35.9 
 
 		 557 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  35.42 
 
 		 615 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 565 aa  74.7  0.0000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  34.69 
 
 		 562 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  34.38 
 
 		 568 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004068  (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl carrier protein] dehydratase  33.93 
 
 		 122 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  32.04 
 
 		 561 aa  71.2  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  35.85 
 
 		 551 aa  68.6  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  31.91 
 
 		 563 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.02 
 
 		 129 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4805  putative (3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  37.11 
 
 		 117 aa  67  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  30.85 
 
 		 563 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3890  putative (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  38 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 557 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0113  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-[acyl- carrier-protein] dehydratase  30.11 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  29.59 
 
 		 557 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  27.55 
 
 		 563 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  29.25 
 
 		 591 aa  52.8  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  36.05 
 
 		 518 aa  48.5  0.00003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  30.3 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 570 aa  47  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  25.84 
 
 		 593 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  32.61 
 
 		 580 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0436  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.76 
 
 		 114 aa  45.4  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.28393  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.91 
 
 		 121 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  29.7 
 
 		 518 aa  45.4  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  29.21 
 
 		 565 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1592  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.67 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.462195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  32.69 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0289  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  31.51 
 
 		 464 aa  42.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.013446 
 
 
-
 
NC_004310  BR1152  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.79 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1110  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  28.79 
 
 		 157 aa  42.7  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1785  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.56 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.972016  normal  0.0493804 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4758  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  25.29 
 
 		 145 aa  42  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.12941e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1641  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.46 
 
 		 148 aa  42  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.012004 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03840  hypothetical protein  26.6 
 
 		 127 aa  41.6  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189773  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  28.71 
 
 		 590 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.71 
 
 		 590 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3906  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  20.66 
 
 		 181 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0293502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2038  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  30.21 
 
 		 157 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.263933  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2332  3-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase  25.51 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6494  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  41.46 
 
 		 464 aa  40.8  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000000458063  normal  0.479414 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0607  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.73 
 
 		 155 aa  40.8  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.399391  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2514  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.84 
 
 		 154 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0181011  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0993  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  22.76 
 
 		 148 aa  40.4  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000434139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  31.46 
 
 		 584 aa  40.4  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1245  3-hydroxymyristoyl-acyl carrier protein dehydratase  36.59 
 
 		 157 aa  40  0.009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3015  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  41.46 
 
 		 463 aa  40.4  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000287185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0436  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  23.28 
 
 		 141 aa  40  0.01  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000377622  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2353  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  25.56 
 
 		 141 aa  40  0.01  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0023817  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>