58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03840 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03840  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  256  1e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189773  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1081  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  51.4 
 
 		 123 aa  114  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1765  dehydratase  49.49 
 
 		 122 aa  103  9e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1871  hypothetical protein  35.59 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  33.06 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2110  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  36.46 
 
 		 123 aa  68.2  0.00000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.689445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0077  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  40 
 
 		 158 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000035396  unclonable  1.10697e-19 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0915  hypothetical protein  30.61 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4174  hypothetical protein  39.29 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4573  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  34.21 
 
 		 129 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  41.07 
 
 		 565 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  37.5 
 
 		 584 aa  42.7  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  36.21 
 
 		 590 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3298  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  33.33 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.609016 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2794  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.53 
 
 		 163 aa  42.4  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  36.21 
 
 		 590 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1985  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  32.35 
 
 		 149 aa  42.4  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00660772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 557 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  42.11 
 
 		 615 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3892  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.6 
 
 		 128 aa  41.6  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  27.91 
 
 		 551 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  35 
 
 		 557 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  30.26 
 
 		 557 aa  42  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  38.6 
 
 		 568 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2110  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  29.7 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0260713  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  32.76 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2354  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.73 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2655  hypothetical protein  27.38 
 
 		 132 aa  41.2  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  40 
 
 		 563 aa  41.6  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2265  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  26.21 
 
 		 150 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.700306  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10898  (3R)-hydroxymyristoyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, putative  30.68 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08166  UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase  35.71 
 
 		 467 aa  41.2  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  38.98 
 
 		 580 aa  41.2  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3521  putative 3-hydroxymyristoyl-acyl carrier protein dehydratase FabZ-like protein  29.31 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1586  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  29.73 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000412753  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1391  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  25.41 
 
 		 148 aa  41.2  0.005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0511192  normal  0.010538 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1602  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.58 
 
 		 163 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2097  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.75 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2538  3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  27.27 
 
 		 170 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199923  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1950  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  29.73 
 
 		 153 aa  41.2  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.160109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0993  beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabZ  26.4 
 
 		 148 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000434139  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5116  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.27 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000186876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4963  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.27 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000238321  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1245  3-hydroxymyristoyl-acyl carrier protein dehydratase  28.17 
 
 		 157 aa  40.4  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.614466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5508  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.27 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000439699  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5357  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.27 
 
 		 144 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  36.21 
 
 		 609 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  36.21 
 
 		 609 aa  40.8  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1157  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.58 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.508549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0470  3-hydroxyacyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  28.57 
 
 		 157 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.680535 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4175  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  31.58 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0537  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  27.47 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.514028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1501  (3R)-hydroxymyristoyl-ACP dehydratase  32.84 
 
 		 163 aa  40.4  0.008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.817883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2232  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  26.96 
 
 		 156 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2576  bifunctional UDP-3-O-[3-hydroxymyristoyl] N-acetylglucosamine deacetylase/(3R)-hydroxymyristoyl-[acyl-carrier-protein] dehydratase  34.85 
 
 		 446 aa  40.4  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0363046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0307  3-hydroxymyristoyl/3-hydroxydecanoyl-(acyl carrier protein) dehydratase  29.73 
 
 		 175 aa  40.4  0.009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.27035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2089  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase, FabA/FabZ  24.56 
 
 		 157 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  39.22 
 
 		 570 aa  40  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>